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基于放射組學(xué)在肺癌良惡性預(yù)測(cè)的初步研究

發(fā)布時(shí)間:2020-03-30 23:57
【摘要】:目的:肺癌是當(dāng)今世界最常見(jiàn)的惡性腫瘤之一,是全球癌癥死亡的主要原因。不能早期檢測(cè)是其高死亡率的最重要因素。雖然全國(guó)肺部篩查試驗(yàn)主張篩查某些高危人群,但這些篩查工作的實(shí)際實(shí)施尚未成功,且需求量很大。在此基礎(chǔ)上以及精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)的大背景下,放射組學(xué)應(yīng)運(yùn)而生。2012年,荷蘭研究員Lambin P首次提出了“Radiomics”的概念,并將其定義如下:使用高通量定量提取方法從影像學(xué)圖像中提取大量圖像特征。放射組學(xué)吸引了極大的關(guān)注,并且在2014年重新定義為:通過(guò)高通量自動(dòng)(或半自動(dòng))提取方式,從放射學(xué)圖像中感興趣區(qū)(ROI)內(nèi)提取大量可量化信息(或圖像特征);谒东@的圖像特征類型,這些特征大致分為四類:強(qiáng)度,結(jié)構(gòu),紋理/漸變和小波。已有許多研究顯示這些特征與肺結(jié)節(jié)的惡性潛能之間存在顯著相關(guān)性。本文通過(guò)放射組學(xué)對(duì)肺癌病例進(jìn)行定量特征提取,優(yōu)化選擇,然后通過(guò)機(jī)器學(xué)習(xí)方法實(shí)現(xiàn)肺癌病例討論和分析。資料與方法:在公開數(shù)據(jù)庫(kù)LIDC中挑選了224例以及醫(yī)院收集的263例肺結(jié)節(jié)病例,提取了共867個(gè)放射組學(xué)特征。首先,對(duì)胸CT中肺結(jié)節(jié)進(jìn)行分割;然后,進(jìn)行肺結(jié)節(jié)感興趣區(qū)域提取;最后,進(jìn)行所有放射組學(xué)特征信息提取。針對(duì)肺結(jié)節(jié)的特點(diǎn),研究中共設(shè)計(jì)了5組共62個(gè)放射組學(xué)特征構(gòu)成每個(gè)樣本的特征空間。采用十種降維算法對(duì)特征進(jìn)行降維,最后通過(guò)七種機(jī)器學(xué)習(xí)方法進(jìn)行分類比較。特征提取算法的代碼全部基于Matlab R2017b實(shí)現(xiàn)。結(jié)果:本文給出了多種數(shù)據(jù)特征降維方法的研究,具體給出了50個(gè),100個(gè),200個(gè),300個(gè),400個(gè),867個(gè)特征數(shù)據(jù)的分析結(jié)果,并針對(duì)不同機(jī)器學(xué)習(xí)分類算法進(jìn)行研究比對(duì),同時(shí)也對(duì)不同降維方法在不同機(jī)器學(xué)習(xí)算法中對(duì)我們的數(shù)據(jù)進(jìn)行分類的結(jié)果分析,給出了最大相關(guān)最小冗余降維下的隨機(jī)森林分類效果最佳,在隨機(jī)森林的分類器情況下對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行了二維和三維特征分析。將放射組學(xué)特征區(qū)分為二維放射組學(xué)特征和三維放射組學(xué)特征。其中二維放射組學(xué)特征包括了一維放射組學(xué)特征、基本形狀大小特征、二維灰度游程矩陣(GLRLM-2D)、Laws圖像紋理特征(Law-Textures)、LoG二階邊緣信息特征;三維放射組學(xué)特征包括了三維灰度共生矩陣、三維灰度區(qū)域大小矩陣(GLSZM-3D)、多尺度三維小波特征;而這些特征合稱混合放射組學(xué)特征。我們通過(guò)二維放射組學(xué)特征、三維放射組學(xué)特征、混合放射組學(xué)特征對(duì)于基于隨機(jī)森林的肺結(jié)節(jié)良惡性分類器進(jìn)行了分析。在3種特征分析中混合特征的識(shí)別精度要比其他兩個(gè)高。來(lái)自LIDC數(shù)據(jù)庫(kù)和來(lái)自醫(yī)院的數(shù)據(jù)在基于隨機(jī)森林的分類器中的結(jié)果分別為AUC=0.6571、ACC=76.26%,AUC=0.8667、ACC=76%;在基于支持向量機(jī)的分類器中的結(jié)果分別為AUC=0.6429,ACC=76.37%,AUC=0.7733、ACC=72%。由此可以發(fā)現(xiàn),來(lái)自LIDC數(shù)據(jù)庫(kù)的數(shù)據(jù)其分類準(zhǔn)確度較高但是其AUC較低,而來(lái)自腫瘤醫(yī)院的數(shù)據(jù)則正好與之相反。根據(jù)反復(fù)試驗(yàn)的數(shù)據(jù)證明,來(lái)自LIDC的數(shù)據(jù)準(zhǔn)確度相比于來(lái)自與腫瘤醫(yī)院的數(shù)據(jù)的準(zhǔn)確度高約3%。由此我們推測(cè)不同來(lái)源的肺結(jié)節(jié)數(shù)據(jù)對(duì)于分類器的建立有一定的影響。結(jié)論:在肺癌良惡診斷鑒別中,使用放射組學(xué)特征方法可以鑒別良惡性;诩y理特征的計(jì)算機(jī)輔助診斷系統(tǒng)可以提高對(duì)此類結(jié)節(jié)的診斷效能。
【圖文】:

基于放射組學(xué)在肺癌良惡性預(yù)測(cè)的初步研究


數(shù)據(jù)ROI區(qū)域提取圖2.1LIDC數(shù)據(jù)庫(kù)的肺結(jié)節(jié)分割,數(shù)據(jù)均使用逐結(jié)節(jié)逐層分割的方法,,

基于放射組學(xué)在肺癌良惡性預(yù)測(cè)的初步研究


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【學(xué)位授予單位】:天津醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號(hào)】:R734.2

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本文編號(hào):2608240

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