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基于放射組學在肺癌良惡性預測的初步研究

發(fā)布時間:2020-03-30 23:57
【摘要】:目的:肺癌是當今世界最常見的惡性腫瘤之一,是全球癌癥死亡的主要原因。不能早期檢測是其高死亡率的最重要因素。雖然全國肺部篩查試驗主張篩查某些高危人群,但這些篩查工作的實際實施尚未成功,且需求量很大。在此基礎上以及精準醫(yī)學的大背景下,放射組學應運而生。2012年,荷蘭研究員Lambin P首次提出了“Radiomics”的概念,并將其定義如下:使用高通量定量提取方法從影像學圖像中提取大量圖像特征。放射組學吸引了極大的關注,并且在2014年重新定義為:通過高通量自動(或半自動)提取方式,從放射學圖像中感興趣區(qū)(ROI)內(nèi)提取大量可量化信息(或圖像特征)。基于所捕獲的圖像特征類型,這些特征大致分為四類:強度,結構,紋理/漸變和小波。已有許多研究顯示這些特征與肺結節(jié)的惡性潛能之間存在顯著相關性。本文通過放射組學對肺癌病例進行定量特征提取,優(yōu)化選擇,然后通過機器學習方法實現(xiàn)肺癌病例討論和分析。資料與方法:在公開數(shù)據(jù)庫LIDC中挑選了224例以及醫(yī)院收集的263例肺結節(jié)病例,提取了共867個放射組學特征。首先,對胸CT中肺結節(jié)進行分割;然后,進行肺結節(jié)感興趣區(qū)域提取;最后,進行所有放射組學特征信息提取。針對肺結節(jié)的特點,研究中共設計了5組共62個放射組學特征構成每個樣本的特征空間。采用十種降維算法對特征進行降維,最后通過七種機器學習方法進行分類比較。特征提取算法的代碼全部基于Matlab R2017b實現(xiàn)。結果:本文給出了多種數(shù)據(jù)特征降維方法的研究,具體給出了50個,100個,200個,300個,400個,867個特征數(shù)據(jù)的分析結果,并針對不同機器學習分類算法進行研究比對,同時也對不同降維方法在不同機器學習算法中對我們的數(shù)據(jù)進行分類的結果分析,給出了最大相關最小冗余降維下的隨機森林分類效果最佳,在隨機森林的分類器情況下對數(shù)據(jù)進行了二維和三維特征分析。將放射組學特征區(qū)分為二維放射組學特征和三維放射組學特征。其中二維放射組學特征包括了一維放射組學特征、基本形狀大小特征、二維灰度游程矩陣(GLRLM-2D)、Laws圖像紋理特征(Law-Textures)、LoG二階邊緣信息特征;三維放射組學特征包括了三維灰度共生矩陣、三維灰度區(qū)域大小矩陣(GLSZM-3D)、多尺度三維小波特征;而這些特征合稱混合放射組學特征。我們通過二維放射組學特征、三維放射組學特征、混合放射組學特征對于基于隨機森林的肺結節(jié)良惡性分類器進行了分析。在3種特征分析中混合特征的識別精度要比其他兩個高。來自LIDC數(shù)據(jù)庫和來自醫(yī)院的數(shù)據(jù)在基于隨機森林的分類器中的結果分別為AUC=0.6571、ACC=76.26%,AUC=0.8667、ACC=76%;在基于支持向量機的分類器中的結果分別為AUC=0.6429,ACC=76.37%,AUC=0.7733、ACC=72%。由此可以發(fā)現(xiàn),來自LIDC數(shù)據(jù)庫的數(shù)據(jù)其分類準確度較高但是其AUC較低,而來自腫瘤醫(yī)院的數(shù)據(jù)則正好與之相反。根據(jù)反復試驗的數(shù)據(jù)證明,來自LIDC的數(shù)據(jù)準確度相比于來自與腫瘤醫(yī)院的數(shù)據(jù)的準確度高約3%。由此我們推測不同來源的肺結節(jié)數(shù)據(jù)對于分類器的建立有一定的影響。結論:在肺癌良惡診斷鑒別中,使用放射組學特征方法可以鑒別良惡性;诩y理特征的計算機輔助診斷系統(tǒng)可以提高對此類結節(jié)的診斷效能。
【圖文】:

基于放射組學在肺癌良惡性預測的初步研究


數(shù)據(jù)ROI區(qū)域提取圖2.1LIDC數(shù)據(jù)庫的肺結節(jié)分割,數(shù)據(jù)均使用逐結節(jié)逐層分割的方法,,

基于放射組學在肺癌良惡性預測的初步研究


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【學位授予單位】:天津醫(yī)科大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2018
【分類號】:R734.2

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本文編號:2608240

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