結(jié)直腸癌細(xì)胞同期放化療抵抗關(guān)鍵調(diào)控基因的篩選
發(fā)布時間:2019-11-24 12:51
【摘要】:[目的]:據(jù)統(tǒng)計,結(jié)直腸癌每年有100多萬例新發(fā)病例¨。新輔助放化療在直腸癌患者治療中起重要作用。隨著新輔助放化療運用的日趨廣泛,放化療抵抗的問題也日趨凸顯。研究顯示,基因表達異?赡軐(dǎo)致以5-Fu為基礎(chǔ)的同期放化療抵抗。本項目通過構(gòu)建直腸癌細(xì)胞體外同期放化療模型,誘導(dǎo)結(jié)直腸癌放化療抵抗細(xì)胞株,并運用全基因組表達譜芯片全面對比野生型結(jié)直腸癌細(xì)胞和所誘導(dǎo)的同期放化療抵抗細(xì)胞株的基因差異,篩選結(jié)直腸癌細(xì)胞同期放化療抵抗的關(guān)鍵基因,以全面了解結(jié)直腸癌同期放化療抵抗機制。本項目將為進一步探索合理的干預(yù)措施以逆轉(zhuǎn)直腸癌放化療抵抗打下基礎(chǔ),并為臨床提供放化療療效提供理論依據(jù)。[方法]:1.采用10μmol/15-Fu及4Gy 6MV X-ray對人結(jié)直腸癌細(xì)胞HCT116進行體外同期放化療,建立體外同期放化療抵抗人結(jié)直腸癌HCT116細(xì)胞株(chemoradioresistant cell, CRR cell);2. Clongenic Survival Assay法檢測同期放化療后HCT116細(xì)胞株的同期放化療抵抗性;3.全基因組表達譜芯片檢測同期放化療抵抗HCT116與其母細(xì)胞mRNA表達水平的差異;4.差異性表達mRNAs進行GO (gene ontology)分類,探索其生物學(xué)功能;5. KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)信號通路分析與差異性表達基因相關(guān)的信號通路;6.隨機選擇6個差異性表達基因進行qRT-PCR驗證其mnRNA表達水平;7.數(shù)據(jù)統(tǒng)計和分析采用SPSS17.0軟件包進行,數(shù)據(jù)以均數(shù)士標(biāo)準(zhǔn)差(x±s)表示,組間資料應(yīng)用單因素方差分析(ONE WAY ANOVA)和t檢驗。[結(jié)果1:1.經(jīng)過10次體外同期放化療后,已建立同期放化療后HCT116殘癌細(xì)胞株;2. Clongenic Survival Assay法證實同期放化療后HCT116殘癌細(xì)胞株具有同期放化療抵抗性,為同期放化療抵抗細(xì)胞株;3.全基因組表達譜芯片共篩選了21811個mRNAs,以fold change 2為差異性表達基因篩選標(biāo)準(zhǔn),其中11.0%(2397/21811) mRNAs在HCT116 CRR細(xì)胞和HCT116母細(xì)胞中表達有差異;4.按GO生物學(xué)過程(Biological process),細(xì)胞構(gòu)成(Cellular component),分子功能(Molecular function)對差異性表達基因進行分類,發(fā)現(xiàn)差異性表達基因具有多種生物學(xué)功能;5. KEGG信號通路分析與差異性表達基因相關(guān)的信號通路,有57條信號通路(38條上調(diào),19條下調(diào))與差異性表達基因相關(guān);6. qRT-PCR驗證中,隨機選擇的6個差異性表達基因中,除HOXB7外,其余5個基因的mRNAs上調(diào)、下調(diào)趨勢與基因芯片結(jié)果相同。[結(jié)論]:1.本實驗證實體外應(yīng)用模擬臨床結(jié)直腸癌治療的大劑量沖擊法可以增加人結(jié)直腸癌細(xì)胞HCT116的放化療抵抗性。成功建立放化療抵抗人結(jié)直腸癌細(xì)胞HCT116,為結(jié)直腸癌放化療抵抗性的研究進一步奠定了基礎(chǔ)。2.結(jié)直腸癌放化療抵抗相關(guān)mRNA差異表達譜的建立,綜合信息學(xué)分析提供了數(shù)個可能的富集生物過程和富集通路,為后續(xù)的研究提供了研究的方向和依據(jù)。3.qRT-PCR檢測部分基因表達情況,與基因芯片結(jié)果大部分一致,提示基因芯片結(jié)果準(zhǔn)確可靠。
【圖文】:
2.邋Colongenic邋survival邋assay對放化療后殘癌細(xì)胞株的放化療抵抗性鑒定結(jié)果逡逑Golongenic邋survival邋assay結(jié)果槰示HCT116野生型細(xì)胞株克枦形成數(shù)明.思少逡逑于HCT]16CR民細(xì)胞(圖2),多視單擊模型擬合細(xì)胞存活曲線(圖3),實驗逡逑}DDq、Do、SF2明雖低于照射組(表1)。逡逑Radiation邋Dose邋(Gy)邋0邐2邐4邐?邐8邐10逡逑廬冷.V邋:.邐.逡逑CRRHCT"eCe"之:學(xué)女)‘?車.戶‘邐y.逡逑若;?邋;邋'邋?如'.‘.,-逡逑.**?>.*,逡逑Parental邋HCT116邋Cell邋f.逡逑罔2;邋Colongenic邋survival邋assay法鑒定細(xì)胞放化療抵抗性逡逑Fig.2邋Validation邋of邋the邋chemoradioresi邋巧邋ance邋of邋HCT116邋C邋民民邋ceU邋by逡逑Clongenic邋survival邋assay逡逑1邋廣"?I邐?邋CRR邋HCT11#rP茫澹歟歟]3?0邋Pa巧ntal邋HCT116邋Cell逡逑置邐*逡逑0>邋.01邋I邐*逡逑C邐D逡逑>邐*逡逑I邋.001逡逑(/)逡逑.0001邐邐?邐■邐邐邐邐邐i逡逑0邐2邐4邐6邐8邐10逡逑Dose邋(Gy)逡逑圖3:單擊多魄模型擬合細(xì)胞存活曲線逡逑Fig.3邋survival邋curve邋derived邋by邋化e邋multi-target,邋sinTB]e-hit邋model逡逑*各組細(xì)胞存活分?jǐn)?shù)比
ll邐0.5889邐2.3015邐1.1319檢測結(jié)果逡逑6巧細(xì)胞株,2號標(biāo)本為HCT116CRR細(xì)A純度,,若OD值A260/A280比值接近1.8,提示純度達到實驗的要求(表巧。28s、18s清晰可見,比例約為2倍說A合格,符合芯片檢測的要求,每管取7表2.艮NA紫外檢測結(jié)果逡逑ab.2邋RNA邋checked邋by邋spectropho化me化r逡逑HCT116母細(xì)胞邐HCT1]6邐1.99邐邐2.36邐
【學(xué)位授予單位】:昆明醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號】:R735.34
【圖文】:
2.邋Colongenic邋survival邋assay對放化療后殘癌細(xì)胞株的放化療抵抗性鑒定結(jié)果逡逑Golongenic邋survival邋assay結(jié)果槰示HCT116野生型細(xì)胞株克枦形成數(shù)明.思少逡逑于HCT]16CR民細(xì)胞(圖2),多視單擊模型擬合細(xì)胞存活曲線(圖3),實驗逡逑}DDq、Do、SF2明雖低于照射組(表1)。逡逑Radiation邋Dose邋(Gy)邋0邐2邐4邐?邐8邐10逡逑廬冷.V邋:.邐.逡逑CRRHCT"eCe"之:學(xué)女)‘?車.戶‘邐y.逡逑若;?邋;邋'邋?如'.‘.,-逡逑.**?>.*,逡逑Parental邋HCT116邋Cell邋f.逡逑罔2;邋Colongenic邋survival邋assay法鑒定細(xì)胞放化療抵抗性逡逑Fig.2邋Validation邋of邋the邋chemoradioresi邋巧邋ance邋of邋HCT116邋C邋民民邋ceU邋by逡逑Clongenic邋survival邋assay逡逑1邋廣"?I邐?邋CRR邋HCT11#rP茫澹歟歟]3?0邋Pa巧ntal邋HCT116邋Cell逡逑置邐*逡逑0>邋.01邋I邐*逡逑C邐D逡逑>邐*逡逑I邋.001逡逑(/)逡逑.0001邐邐?邐■邐邐邐邐邐i逡逑0邐2邐4邐6邐8邐10逡逑Dose邋(Gy)逡逑圖3:單擊多魄模型擬合細(xì)胞存活曲線逡逑Fig.3邋survival邋curve邋derived邋by邋化e邋multi-target,邋sinTB]e-hit邋model逡逑*各組細(xì)胞存活分?jǐn)?shù)比
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【學(xué)位授予單位】:昆明醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號】:R735.34
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6 張繼民,劉明姬,n澗托
本文編號:2565436
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