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長鏈非編碼RNA在肝癌術(shù)后復(fù)發(fā)中的意義及機制研究

發(fā)布時間:2019-11-11 10:50
【摘要】:原發(fā)性肝癌(簡稱肝癌,Hepatocellular carcinoma,HCC)是常見惡性腫瘤,近年來在世界范圍內(nèi)發(fā)病率呈現(xiàn)上升趨勢,給社會經(jīng)濟帶來沉重負擔(dān)。手術(shù)切除是其主要治療手段,但是手術(shù)后腫瘤的高復(fù)發(fā)率嚴重影響了治療效果,研究預(yù)測腫瘤手術(shù)切除后復(fù)發(fā),是提高肝癌臨床療效,改善患者預(yù)后及生存質(zhì)量亟待解決的重大科學(xué)問題。隨著二代測序技術(shù)和生物信息分析技術(shù)的進展,發(fā)現(xiàn)越來越多的長鏈非編碼RNA在腫瘤發(fā)生發(fā)展中發(fā)揮著重要作用,是目前研究的最前沿領(lǐng)域,是新的腫瘤標(biāo)志物和藥物靶標(biāo)的重要來源。因為長鏈非編碼RNA對腫瘤的調(diào)控處于基因的上游階段,受干擾較少,研究其對肝癌的預(yù)后影響及機制,能夠為肝癌臨床診斷與治療提供了新的研究策略。第一部分:肝細胞肝癌組織和癌旁組織中差異表達的長鏈非編碼RNA的篩選與功能學(xué)驗證研究目的:篩選出在肝癌組織和癌旁組織中差異表達的長鏈非編碼RNA并在組織學(xué)和細胞系中驗證其差異表達能力,選取進一步研究的目標(biāo)RNA。研究方法:利用二代測序技術(shù)和生物信息學(xué)分析方法篩選肝切除術(shù)后肝癌組織和癌旁組織中差異表達的長鏈非編碼RNA,并進一步在正常肝細胞系、肝癌細胞系中驗證其表達能力。研究結(jié)果:利用構(gòu)建的肝癌基因芯片同時檢測肝癌組織和癌旁組織中長鏈非編碼RNA和信使RNA的表達量,篩選出差異性表達的LncRNA632條和mRNA391條,其中7條 LncRNA (p2609/p33560/ p3816/p40127-v4/p22534/p8751/p42540-v4)在肝癌病人中與mRNA表現(xiàn)出一致表達,15條LncRNA被檢測出呈現(xiàn)出明顯差異表達。通過細胞和組織學(xué)驗證,結(jié)果顯示IncRNA-C2、LncRNA-P7和LncRNA-P12呈現(xiàn)出明顯差異性表達,有統(tǒng)計學(xué)意義,遂選定差異表達最明顯的LncRNA-P7,并命名為LINC RP1130-1。核質(zhì)分離實驗結(jié)果顯示:LINC RP1130-1絕大部分存在于細胞質(zhì)中,則表明LINC RP1130-1很可能通過與某個特定通路蛋白結(jié)合發(fā)揮其調(diào)控功能。在了解了 LINC RP1130-1的作用部位后,我們對其在HCC復(fù)發(fā)與轉(zhuǎn)移的作用做了進一步的機制研究。第二部分:LINC RP1130-1通過STAT1-MAPK通道影響肝癌的復(fù)發(fā)與轉(zhuǎn)移研究目的:探索L INC RP1130-1在肝癌復(fù)發(fā)轉(zhuǎn)移中的可能作用機制。研究方法:通過轉(zhuǎn)染質(zhì)粒,過表達基因和沉默基因表達技術(shù)、蛋白免疫印跡技術(shù)、細胞活力測定、細胞增殖與凋亡能力等方法,分別在基因水平,蛋白水平進行實驗,尋找LINC RP1130-1的基因靶點和可能的蛋白位點。研究結(jié)果:研究表明LncRNA-P7 (LINC RP1130-1)可以抑制肝癌腫瘤細胞的增殖,促進肝癌細胞的凋亡過程;研究還發(fā)現(xiàn)LINC RP1130-1可調(diào)控STAT1基因的轉(zhuǎn)錄,并進而影響該基因所關(guān)聯(lián)的蛋白質(zhì)表達水平;其表達量增加可顯著降低STAT1基因的轉(zhuǎn)錄水平,降低STAT1蛋白和ERK1/2蛋白的表達量。我們認為LncRNA-P7 (LINC RP1130-1)可能是通過STAT-MAPK信號通路在肝癌復(fù)發(fā)轉(zhuǎn)移過程中起到重要作用。第三部分:長鏈非編碼RNA (LNCRNA-P7/LINCRP1130-1)與臨床信息的關(guān)系研究目的:研究LINC RP1130-1與肝癌病人臨床相關(guān)信息之間的關(guān)聯(lián)關(guān)系,探討LINC RP1130-1在臨床診治中的意義和作用。研究方法:分別測量肝癌組織和癌旁組織中的LINC RP1130-1表達量,將其按照表達量高低分為兩組,采用統(tǒng)計學(xué)方法分析兩組病人之間其他臨床信息之間差異。研究結(jié)果:研究發(fā)現(xiàn)相比較對應(yīng)的癌旁組織中的表達量,LINC RP1130-1在肝癌組織中的表達量呈現(xiàn)明顯低表達,在肝癌細胞系中的驗證也證實LINC RP1130-1在肝癌細胞中的表達量低于正常肝細胞,而且LINC RP1130-1低表達組無瘤生存時間(disease free survival, DFS)較高表達組顯著延長,兩組之間有統(tǒng)計學(xué)差異(P=0. 047)。研究中還發(fā)現(xiàn)LINC RP1130-1的表達與臨床分期、肝硬化,門靜脈癌栓、微血管癌栓、腫瘤數(shù)量等因素密切相關(guān)。受試者曲線面積(Areaundercurve,AUC)為0.74,這表明LINC RP1130-1的表達在肝癌診斷中具有很好的特異性和敏感性,能夠很好的用于肝癌的早期診斷。結(jié)論:很多研究表明,長鏈非編碼RNA在人體內(nèi)廣泛存在,參與了肝癌的發(fā)生發(fā)展過程。我們的研究發(fā)現(xiàn),相比較正常肝細胞,LncRNA-P7 (LINCRP1130-1)在肝癌細胞系表現(xiàn)為顯著的低表達,同樣,相比較于癌旁組織,LncRNA-P7 (LINCRP1130-1)在肝癌組織中也表現(xiàn)為顯著的低表達,具有統(tǒng)計學(xué)差異。進一步將LncRNA-P7 (LINC RP1130-1)與臨床病人資料進行關(guān)聯(lián)分析,發(fā)現(xiàn)LncRNA-P7 (LINCRP1130-1)的表達與臨床分期、肝硬化,門靜脈癌栓、微血管癌栓、腫瘤數(shù)量等因素密切相關(guān)。LncRNA-P7 (LINC RP1130-1)低表達組無瘤生存時間比高表達組顯著延長,兩組之間有統(tǒng)計學(xué)差異(P=0.047)。受試者曲線面積(AUC)為 0.74,表明 LncRNA-P7 (LINCRP1130-1)的表達在肝癌診斷中具有很好的特異性和敏感性,能夠很好的用于肝癌的早期診斷?偟膩碚f,LncRNA-P7 (LINCRP1130-1)參與了肝癌的發(fā)生發(fā)展過程,可以作為一類新型的具有生物學(xué)功能的臨床標(biāo)志物進一步研究,具有非常廣闊的臨床應(yīng)用前景。
【圖文】:

肝細胞肝癌,基因芯片,原始信號,患者


解放軍醫(yī)學(xué)院博士學(xué)位論文逡逑實驗結(jié)果逡逑一、目標(biāo)LncRNA的篩選逡逑我們利用基因芯片和生物信息學(xué)分析比較得出:肝癌組織與癌旁組織中共有391逡逑條LncRNAs和632條mRNAs有顯著差異表達(差異倍數(shù)>2,FDR值<0.05)。結(jié)逡逑果顯示:與患者癌旁組織相比較,肝癌組織中有許多LncRNA與mRNA表達量發(fā)生逡逑了差異。預(yù)示著癌組織中的表觀遺傳學(xué)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)發(fā)生了很大的改變,有助于后期相關(guān)逡逑研究者更好的探討LncRNAs與腫瘤疾病轉(zhuǎn)移及復(fù)發(fā)間的關(guān)聯(lián)。逡逑

差異表達,聚類圖,倍數(shù)


圖2:差異表達LncRNAs和mRNA聚類圖。通過基因芯片篩選,可以發(fā)現(xiàn)肝癌與逡逑癌旁組織中有391條LncRNAs邋(左)和632條mRNAs邋(右)有顯著差異表達。(FC>2,逡逑FDRCO.邋05,綠色區(qū)域越明亮代表下調(diào)倍數(shù)越大,紅色區(qū)域越明亮代表上調(diào)倍數(shù)越大)逡逑隨后我們對上述LncRNA與mRNA進行了共表達分析,分析顯示有7條LncRNA逡逑與相應(yīng)mRNA呈現(xiàn)顯著相關(guān)性(R2>0.999),這7條LncRNA在腫瘤中呈現(xiàn)顯著下逡逑調(diào)趨勢(圖3.綠色區(qū)域越明亮代表下調(diào)倍數(shù)越大,紅色區(qū)域越明亮代表上調(diào)倍數(shù)越逡逑大)。預(yù)示著這7條LncRNA與其相應(yīng)共表達的mRNA調(diào)控可能已經(jīng)失調(diào)。在腫瘤發(fā)逡逑生發(fā)展過程中起著重要的調(diào)控作用,同樣也預(yù)示著這7條LncRNA可能是通過影響逡逑這些mRNA的表達從而發(fā)揮其在腫瘤發(fā)生發(fā)展中的功能。同時,,這些mRNA也可能逡逑是這7條LncRNA的靶基因。逡逑
【學(xué)位授予單位】:中國人民解放軍醫(yī)學(xué)院
【學(xué)位級別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2017
【分類號】:R735.7

【參考文獻】

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1 Ai-Ru Hsieh;Cathy SJ Fann;Chau-Ting Yeh;Hung-Chun Lin;Shy-Yi Wan;Yi-Cheng Chen;Chia-Lin Hsu;Jennifer Tai;Shi-Ming Lin;Dar-In Tai;;Effects of sex and generation on hepatitis B viral load in families with hepatocellular carcinoma[J];World Journal of Gastroenterology;2017年05期

2 呂細林;黃剛;肖曼;劉孟剛;陳sョ

本文編號:2559223


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