【摘要】：大腸癌是常見的惡性腫瘤之一,據(jù)世界流行病學(xué)調(diào)查,發(fā)現(xiàn)大腸癌的發(fā)病率在男女中都位于惡性腫瘤第三位,在北美、西歐、澳大利亞、新西蘭等地的發(fā)病率最高,居內(nèi)臟腫瘤前二位,如今東亞、西班牙和東歐等曾經(jīng)低風(fēng)險(xiǎn)的地區(qū)發(fā)病率也正在迅速增加。研究認(rèn)為大部分的大腸癌由大腸腺瘤演變而來。腸道微生物,由于其在營養(yǎng)代謝及免疫調(diào)節(jié)上的關(guān)鍵作用,被認(rèn)為與大腸癌的癌變有直接關(guān)聯(lián)。然而,與大腸腺瘤或大腸癌相關(guān)的腸道微生物的物種及其功能還沒有進(jìn)行過全面綜合的調(diào)查。因此本研究對(duì)來自健康人,大腸腺瘤患者,大腸癌患者的3個(gè)分組共147個(gè)個(gè)體的糞便樣品進(jìn)行宏基因組測序,通過對(duì)測序數(shù)據(jù)進(jìn)行過濾、組裝、基因預(yù)測與去冗余,構(gòu)建了3,513,139個(gè)非冗余的微生物基因集�；谠�3.5M基因集進(jìn)行宏基因組關(guān)聯(lián)分析(MGWAS),發(fā)現(xiàn)在3個(gè)分組中腸道微生物整體上及基因、物種、功能上都存在差異。通過對(duì)3組樣品進(jìn)行Kruskal Wallis檢驗(yàn),發(fā)現(xiàn)了分別富集于這3個(gè)人群中的130,715基因,基于這些差異基因進(jìn)行MLG(Metagenomic linkage groups)分析,并利用MLG進(jìn)行了健康組與癌癥組,健康組與腺瘤組的分類器的構(gòu)建。并對(duì)這3個(gè)分組人群的進(jìn)行了潛在風(fēng)險(xiǎn)因素分析,分析發(fā)現(xiàn)紅肉的攝入量與造成腸道環(huán)境惡化的細(xì)菌正相關(guān),而水果、蔬菜的攝取量與這類細(xì)菌則是負(fù)相關(guān),這一發(fā)現(xiàn)將為大腸腺瘤及大腸癌的早期診斷及治療提供新的思路。
【學(xué)位授予單位】：華南理工大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類號(hào)】：R735.34

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本文編號(hào)：2543438