發(fā)布時間：2019-09-28 17:40

【摘要】：大腸癌是常見的惡性腫瘤之一,據(jù)世界流行病學調查,發(fā)現(xiàn)大腸癌的發(fā)病率在男女中都位于惡性腫瘤第三位,在北美、西歐、澳大利亞、新西蘭等地的發(fā)病率最高,居內臟腫瘤前二位,如今東亞、西班牙和東歐等曾經(jīng)低風險的地區(qū)發(fā)病率也正在迅速增加。研究認為大部分的大腸癌由大腸腺瘤演變而來。腸道微生物,由于其在營養(yǎng)代謝及免疫調節(jié)上的關鍵作用,被認為與大腸癌的癌變有直接關聯(lián)。然而,與大腸腺瘤或大腸癌相關的腸道微生物的物種及其功能還沒有進行過全面綜合的調查。因此本研究對來自健康人,大腸腺瘤患者,大腸癌患者的3個分組共147個個體的糞便樣品進行宏基因組測序,通過對測序數(shù)據(jù)進行過濾、組裝、基因預測與去冗余,構建了3,513,139個非冗余的微生物基因集。基于該3.5M基因集進行宏基因組關聯(lián)分析(MGWAS),發(fā)現(xiàn)在3個分組中腸道微生物整體上及基因、物種、功能上都存在差異。通過對3組樣品進行Kruskal Wallis檢驗,發(fā)現(xiàn)了分別富集于這3個人群中的130,715基因,基于這些差異基因進行MLG(Metagenomic linkage groups)分析,并利用MLG進行了健康組與癌癥組,健康組與腺瘤組的分類器的構建。并對這3個分組人群的進行了潛在風險因素分析,分析發(fā)現(xiàn)紅肉的攝入量與造成腸道環(huán)境惡化的細菌正相關,而水果、蔬菜的攝取量與這類細菌則是負相關,這一發(fā)現(xiàn)將為大腸腺瘤及大腸癌的早期診斷及治療提供新的思路。
【學位授予單位】：華南理工大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2016
【分類號】：R735.34

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