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應(yīng)用MALDI-TOF-MS檢測(cè)肺鱗癌患者血清多肽并分析其與化療療效相關(guān)性

發(fā)布時(shí)間:2018-09-07 12:10
【摘要】:背景與目的晚期肺鱗癌(squamous cell carcinoma of lung,SCC)一線治療以化療為主,其標(biāo)準(zhǔn)鉑二聯(lián)方案化療只能給患者帶來(lái)有限的獲益。并且不同的患者對(duì)于化療藥物的獲益不同。所以實(shí)現(xiàn)化療藥物最優(yōu)選擇達(dá)到個(gè)體化預(yù)見(jiàn)性治療尤為重要。本研究應(yīng)用基質(zhì)輔助激光解析電離飛行時(shí)間質(zhì)譜(matrix-assisted laser desorption/ionization-time of flight-mass spectrometry,MALDI-TOF-MS)檢測(cè)初治晚期SCC患者接受紫杉醇類聯(lián)合鉑類化療前血清多肽,并分析其與化療療效的相關(guān)性。方法初治晚期SCC患者接受紫杉醇類聯(lián)合鉑類方案化療,每?jī)芍芷谶M(jìn)行療效評(píng)價(jià)。評(píng)效為完全緩解(complete response,CR)或部分緩解(partial response,PR)患者定義為化療敏感組,疾病進(jìn)展(progressive disease,PD)患者定義為耐藥組。留取SCC患者化療前血清樣本,81例患者按照3:1的比例隨機(jī)分為訓(xùn)練組(敏感組I與耐藥組I)和驗(yàn)證組(敏感組II與耐藥組II),預(yù)處理訓(xùn)練組血清樣本并進(jìn)行MALDI-TOFMS檢測(cè),得到血清多肽指紋圖譜。經(jīng)Clin Pro Tools軟件系統(tǒng)分析處理,得到敏感組I與耐藥組I的差異多肽。應(yīng)用軟件內(nèi)置的3種不同的生物學(xué)算法分別建立療效預(yù)測(cè)模型,選取最優(yōu)算法建立療效預(yù)測(cè)模型。運(yùn)用驗(yàn)證組進(jìn)行盲樣驗(yàn)證。結(jié)果訓(xùn)練組共納入30例敏感組患者,31例耐藥組患者;驗(yàn)證組共納入敏感與耐藥組患者各10例。訓(xùn)練組在敏感與耐藥組有96個(gè)差異多肽,其中具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義的多肽有16個(gè)(P0.001)。由5個(gè)多肽(1,897.75 Da,2,023.93 Da,3,683.36 Da,4,269.56 Da,5,341.29 Da)建立療效預(yù)測(cè)模型。該模型對(duì)化療敏感組患者的識(shí)別率為95.11%,交叉驗(yàn)證率為89.18%。經(jīng)驗(yàn)證組進(jìn)行盲樣驗(yàn)證,其模型的準(zhǔn)確率為85%,靈敏度為90.0%,特異性為80.0%。敏感組I中位無(wú)進(jìn)展生存期(progress free survival,PFS)為7.2個(gè)月(95%CI:4.4-14.5);耐藥組I中位PFS為1.8個(gè)月(95%CI:0.7-3.5)。結(jié)果發(fā)現(xiàn):4,232.04 Da、4,269.56 Da的差異多肽與SCC患者PFS存在相關(guān)性(P0.001)。結(jié)論應(yīng)用MALDI-TOF-MS技術(shù)可檢測(cè)到化療敏感組及耐藥組患者的血清多肽存在差異,初步建立的療效預(yù)測(cè)模型可用于預(yù)測(cè)紫杉醇類聯(lián)合鉑類方案化療療效。但需進(jìn)一步擴(kuò)大樣本量完善及驗(yàn)證模型。
[Abstract]:Background & objective chemotherapy is the primary treatment for advanced lung squamous cell carcinoma (squamous cell carcinoma of lung,SCC). And different patients have different benefits for chemotherapeutic drugs. Therefore, it is very important to realize the optimal choice of chemotherapeutic drugs to achieve individualized predictive therapy. In this study, matrix-assisted laser desorption ionization time of flight mass spectrometry (matrix-assisted laser desorption/ionization-time of flight-mass spectrometry,MALDI-TOF-MS) was used to detect serum polypeptides in patients with primary and advanced SCC receiving paclitaxel combined with platinum chemotherapy, and the correlation between them and the effect of chemotherapy was analyzed. Methods SCC patients were treated with paclitaxel combined with platinum regimen every two cycles. Patients with complete remission (complete response,CR) or partial remission (partial response,PR) were defined as chemosensitive group and patients with progression of disease (progressive disease,PD) were defined as drug resistance group. The serum samples of 81 patients with SCC before chemotherapy were randomly divided into training group (sensitive group I and drug resistance group I) and validation group (sensitive group II and drug resistant group II), pretreatment training group) according to 3:1 ratio. The fingerprint of serum polypeptide was obtained. The differential polypeptides of sensitive group I and drug resistant group I were obtained by Clin Pro Tools system analysis. Three different biological algorithms built into the software were used to establish the model of curative effect prediction, and the optimal algorithm was selected to establish the model of curative effect prediction. The validation group was used for blind sample validation. Results there were 30 cases of sensitive group and 31 cases of drug resistance group in training group, and 10 cases in sensitive group and 10 cases in drug resistance group in validation group. In the training group, there were 96 different polypeptides in sensitive and resistant groups, 16 of which were statistically significant (P0.001). Five polypeptides (1897.75 Da,2023.93 Da,3683.36 Da,4269.56 Da,5341.29 Da) were used to establish a therapeutic effect prediction model. The recognition rate and cross validation rate of the model for chemosensitive group were 95.11 and 89.18 respectively. The accuracy of the model was 85, the sensitivity was 90.0, and the specificity was 80.0. The median progressive survival time (progress free survival,PFS) was 7.2 months (95%CI:4.4-14.5) in the sensitive group and 1.8 months (95%CI:0.7-3.5) in the resistant group. The results showed that there was a correlation between the differential polypeptide of 1: 4232.04 Da,4269.56 Da and PFS in SCC patients (P0. 001). Conclusion the difference of serum polypeptides between chemosensitive group and resistant group can be detected by MALDI-TOF-MS technique, and the preliminary therapeutic effect prediction model can be used to predict the efficacy of paclitaxel combined with platinum regimen chemotherapy. However, it is necessary to further expand the sample size and verify the model.
【作者單位】: 軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院附屬醫(yī)院肺部腫瘤科;國(guó)家生物醫(yī)學(xué)分析中心;
【基金】:國(guó)家重大科學(xué)儀器設(shè)備開(kāi)發(fā)專項(xiàng)(No.2011YQ170067)資助~~
【分類號(hào)】:R734.2

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本文編號(hào):2228225

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