【摘要】：目的:目前在白血病分子機制的研究中,疾病相關(guān)蛋白的翻譯后加工主要集中于磷酸化和乙酰化修飾,而對蛋白質(zhì)翻譯后加工的最主要方式——糖基化卻甚少涉及。本研究旨在探索白血病惡性表型與糖基化的相關(guān)性。方法:(1)TCGA數(shù)據(jù)庫收集得到183例急性白血病病例,大數(shù)據(jù)處理方法探討研究多肽:N-乙酰氨基半乳糖基轉(zhuǎn)移酶(Polypepide:N-Acetylgalactosaminyltransferases,pp-GalNAc-Ts,EC.2.1.41)家族pp-GalNAc-T1、T2及N-乙酰氨基葡萄糖基轉(zhuǎn)移酶β3GnTs家族特別是β3GnT8與白血病細(xì)胞相關(guān)性。采用Affymetrix GeneChip Command Console軟件(version4.0,Affymetrix)處理提取原始數(shù)據(jù)。利用Genespring軟件(version 12.5;Agilent Technologies)進(jìn)行RNA標(biāo)準(zhǔn)化和后續(xù)處理。差異基因利用T檢驗的p值和倍數(shù)變化值進(jìn)行篩選,篩選的標(biāo)準(zhǔn)為上調(diào)或者下調(diào)倍數(shù)變化值=2.0且P值=0.05。對差異基因進(jìn)行GO和KEGG富集分析,以判定差異基因主要影響的生物學(xué)功能或者通路。對差異基因進(jìn)行非監(jiān)督層次聚類,展示差異基因在不同樣本間的表達(dá)模式。(2)運用實時定量PCR、Western Blot、Lectin Blot、流式細(xì)胞術(shù)等方法,檢測白血病細(xì)胞K562和HL60,mRNA水平、蛋白水平糖基化相關(guān)糖基轉(zhuǎn)移酶表達(dá)變化,并檢測細(xì)胞表面N-聚糖、O-聚糖等糖鏈結(jié)構(gòu),與白血病臨床分型及白血病細(xì)胞的惡性表型的關(guān)系作較深入的研究。(3)收集白血病臨床病例骨髓涂片130例,通過凝集素免疫組化方法,觀察在白血病急慢性的不同分型、患者不同年齡、患者性別等分組中,β3GnT8(GalT7)和β3GnT2P暬鋃嗑廴樘前妨吹謀澩鋝鉅，

本文編號：2227590