【摘要】：目的探討骨肉瘤潛在的miRNA分子調(diào)控網(wǎng)絡(luò),為解析骨肉瘤發(fā)生發(fā)展的分子機(jī)制提供理論支撐。方法通過差異表達(dá)分析獲得骨肉瘤組織表達(dá)水平發(fā)生顯著性改變的miRNA,并找到具有顯著差異的miRNA靶基因;再通過KEGG代謝通路富集分析以及GO基因功能注釋,探究骨肉瘤組織與正常組織相比表達(dá)水平發(fā)生顯著性改變基因的功能,構(gòu)建分子共調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。結(jié)果篩選差異表達(dá)miRNA52例,其中31例miRNA上調(diào)表達(dá),21例miRNA下調(diào)表達(dá);參與腫瘤通路的miRNA共有5例,其關(guān)聯(lián)靶基因共有314個(gè)。KEGG代謝通路富集分析結(jié)果與GO基因功能分析結(jié)果顯示,差異表達(dá)基因主要參與腫瘤相關(guān)的代謝通路。基于差異表達(dá)基因及TRED數(shù)據(jù)庫中所收錄的人類轉(zhuǎn)錄因子信息,對(duì)差異表達(dá)基因進(jìn)行分子偶聯(lián),構(gòu)建了分子共調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。結(jié)論基于分子共表達(dá)網(wǎng)絡(luò),對(duì)骨肉瘤發(fā)生發(fā)展的分子作用機(jī)制進(jìn)行了系統(tǒng)性挖掘。
[Abstract]:Objective to explore the potential miRNA molecular regulatory network of osteosarcoma and provide theoretical support for the molecular mechanism of osteosarcoma. Methods miRNAs with significant changes in expression level of osteosarcoma were obtained by differential expression analysis, and miRNA target genes with significant differences were found, and then enriched by KEGG metabolic pathway and annotated by go gene function. To explore the function of gene expression in osteosarcoma tissues compared with normal tissues, and to construct molecular coregulation networks. Results differential expression of miRNA52 was screened in 31 cases, in which 31 cases were up-regulated and 21 cases were down-regulated in miRNA, 5 cases were involved in tumor pathway, and 314 associated target genes were detected by enrichment analysis of KEGG metabolic pathway and go gene function analysis. Differentially expressed genes are mainly involved in tumor-related metabolic pathways. Based on the differentially expressed genes and the information of human transcription factors in TRED database, a molecular coregulation network was constructed by molecular coupling of differentially expressed genes. Conclusion based on the molecular coexpression network, the molecular mechanism of osteosarcoma was systematically explored.
【作者單位】： 吉林大學(xué)第二醫(yī)院骨科醫(yī)學(xué)中心;
【基金】：吉林省直衛(wèi)生專項(xiàng)項(xiàng)目 吉林大學(xué)白求恩醫(yī)學(xué)部博士研究生拔尖人才培育計(jì)劃(YB201501);吉林大學(xué)研究生創(chuàng)新基金支持(2016108,2016041)
【分類號(hào)】：R738.1

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9 朱U，

本文編號(hào)：2146910