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ARMS與NGS對比檢測NSCLC患者標本EGFR、KRAS、BRAF、EML4-ALK融合等基因探索

發(fā)布時間:2018-06-27 05:03

  本文選題:基因突變 + 非小細胞肺癌 ; 參考:《安徽醫(yī)科大學學報》2017年10期


【摘要】:目的探討突變擴增阻滯系統(tǒng)(ARMS)法和下一代測序(NGS)法檢測非小細胞肺癌(NSCLC)患者標本多驅動基因改變上的差異,指導臨床個體化治療。方法51例NSCLC患者標本首先采用ARMS法,對所有樣本進行表皮生長因子受體(EGFR)、鼠類肉瘤病毒癌基因(KRAS)、鼠類肉瘤濾過性毒菌致癌基因同源體B1(BRAF)、棘皮動物微管相關類蛋白4-間變性淋巴瘤激酶(EML4-ALK)等基因檢測,隨后采用NGS對上述標本進行高通量檢測對比,收集臨床資料,定期隨訪。結果51例NSCLC樣本應用ARMS法與NGS檢測EGFR、KRAS、EML4-ALK突變陽性率(48.9%vs53.3%、11.1%vs 8.9%、13.7%vs 5.9%)差異無統(tǒng)計學意義。兩種方法檢測出的EGFR-19del突變組比EGFR-L858R突變組靶向治療生存期較長,差異有統(tǒng)計學意義(P=0.010),但兩組在性別、年齡、靶向治療階段等方面差異無統(tǒng)計學意義。NGS法檢測出EGFR-19del、L858R突變患者腫瘤特有基因平均數(shù)量分別為7.1、4.6個,EGFR-L858R多為抑癌基因突變(91%)。2例EGFR/KRAS雙突變患者較EG-FR單突變患者預后差。結論ARMS法和NGS均適用于NSCLC患者突變驅動基因檢測。對于DNA點突變檢測,NGS不僅顯示ARMS檢測的遺漏,還顯示突變豐度、伴隨突變及非常規(guī)突變等,對ARMS檢測有補充作用。EGFR-19del患者靶向治療生存期比EGFR-L858R突變患者長,EGFR-L858R主要為抑癌基因突變。EGFR合并KRAS雙突變患者預后較差,但仍需進一步研究證實。
[Abstract]:Objective to investigate the difference between mutational amplification block system (ARMS) and next generation sequencing (NGS) in the detection of multi-drive gene changes in patients with non-small cell lung cancer (NSCLC). Methods 51 patients with NSCLC were studied by ARMS. Epidermal growth factor receptor (EGFR), rodent sarcomavirus oncogene (KRAS), murine sarcoma filtering toxoid oncogene B1 (BRAF) and echinodermatous microtubule-associated protein 4-anaplastic lymphoma kinase (EML4-ALK) were detected in all samples. Then NGS was used to carry out high-throughput detection and contrast to collect clinical data and follow-up regularly. Results there was no significant difference between ARMS and NGS in detecting EML4-ALK mutation in 51 NSCLC samples (48.9 vs 11.1 vs 8.9% vs 5.9%). The survival time of targeted therapy in EGFR-19del mutation group was longer than that in EGFR-L858R mutation group (P < 0.010). There was no significant difference in target therapy stage. NGS method showed that the average number of tumor specific genes in EGFR-19dellL858R mutation patients was 7.1, and 4.6 EGFR-L858R mutations were tumor suppressor gene mutations (91%). The prognosis of EGFR-L858R mutation patients with EGFR / KRAS double mutation was worse than that of EG-FR single mutation patients. Conclusion both ARMS and NGS can be used to detect mutation driving genes in NSCLC patients. For DNA point mutation detection, NGS not only shows omissions in ARMS detection, but also shows mutation abundance, accompanied mutation and unconventional mutation, etc. The survival time of targeted therapy in patients with EGFR-19del mutation was significantly lower than that in patients with EGFR-L858R mutation. The prognosis of patients with EGFR-L858R mutation was lower than that of patients with EGFR-L858R mutation.
【作者單位】: 安徽醫(yī)科大學附屬省立醫(yī)院呼吸內(nèi)科;
【基金】:安徽省衛(wèi)生廳醫(yī)學科研課題計劃項目(編號:13zc001) 安徽省科技攻關計劃項目(編號:1301042216)
【分類號】:R734.2

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本文編號:2072768


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