結(jié)直腸癌血清IncRNA診斷模型的建立及其對結(jié)直腸癌預(yù)后監(jiān)測的臨床意義
本文選題:結(jié)直腸癌 + 血清lncNA; 參考:《山東大學(xué)》2017年碩士論文
【摘要】:目的:篩選結(jié)直腸癌血清中特異表達的lncRNA,建立結(jié)直腸癌血清lncRNA診斷模型,并探討該模型在結(jié)直腸癌診斷及預(yù)后監(jiān)測中的臨床意義。方法:1.初篩階段選取6名結(jié)直腸癌患者,取其結(jié)直腸癌及癌旁正常組織進行基因芯片分析,篩選出結(jié)直腸癌與癌旁正常組織間差異表達的lncRNA。結(jié)合基因芯片結(jié)果及相關(guān)文獻報道,選取候選lncRNA分子。2.確證階段采用RT-qPCR技術(shù),首先在80對結(jié)直腸癌及癌旁組織中對候選lncRNA分子進行驗證,將其中存在顯著性差異表達的候選分子在120名結(jié)直腸癌患者及120名對照者血清中進行進一步驗證,最終確定在組織及血清中均存在顯著差異表達的lncRNA分子。將確定的lncRNA分子帶入多元logisitic回歸分析,建立結(jié)直腸癌血清lncRNA診斷模型,采用受試者工作曲線(receiver operating characteristic curve,ROC)分析結(jié)直腸癌血清 lncRNA 模型的診斷效能。3.驗證階段另選取120位結(jié)直腸癌癌患者和120名對照者血清,采用RT-qPCR方法再次驗證上一階段確定的差異表達分子,并評價血清lncRNA診斷模型在結(jié)直腸癌診斷中的診斷價值。同時對這120位結(jié)直腸癌患者和120對照者的血清標(biāo)本CEA進行測定,比較血清lncRNA診斷模型與CEA在結(jié)直腸癌診斷中的效能。4.收集并分析驗證階段120名結(jié)直腸癌患者的預(yù)后信息。采用Kaplan-Meier分析對結(jié)直腸癌進行生存曲線分析,通過Cox比例風(fēng)險模型分析可用于結(jié)直腸癌預(yù)后監(jiān)測的獨立預(yù)后因素。5.分析篩選出的lncRNA分子在組織和血清中表達量的相關(guān)性,并檢測lncRNA分子的表達穩(wěn)定性。結(jié)果:1.初篩階段經(jīng)基因芯片分析,共發(fā)現(xiàn)5873個差異表達的lncRNA(≥2個拷貝,p0.05)。根據(jù)基因芯片分析結(jié)果及相關(guān)文獻報道,共選取18個lncRNA分子,其中10個候選分子來自芯片結(jié)果,8個分子來自文獻報道。2.在確證階段,經(jīng)RT-qPCR初次驗證,4個lncRNA分子(BANCR,NR_026817,NR_029373和NR_034119)在結(jié)直腸癌組織及血清中均存在顯著差異表達(均p0.001),其中 BANCR 表達上調(diào),NR_026817,NR_029373 和 NR_034119表達均下調(diào)。采用ROC曲線評估BANCR,NR_026817,NR_029373和NR_034119診斷結(jié)直腸癌的受試者工作曲線下面積(area under the ROC,AUC),分別為0.638,0.708,0.812和0.724。通過Logistic多元回歸分析建立基于4個lncRNA分子的結(jié)直腸癌血清lncRNA診斷模型,此診斷模型的AUC 為 0.891(95%CI 為 0.844-0.927,靈敏度為 81.67%,特異度為 80.00%)。3.驗證階段用RT-qPCR進行再次驗證,結(jié)直腸癌血清lncRNA診斷模型AUC為 0.881(95%CI 為 0.833-0.919,靈敏度為 89.17%,特異度 75.83%)。其對TNM I、II、III期結(jié)直腸癌的診斷的AUC分別為0.774、0.844和0.949,明顯高于 CEA 相應(yīng)的 0.588、0695 和 0.861,(均 p0.05)。4.Kaplan-Meier分析顯示,低表達NR_029373和NR_034119結(jié)直腸癌患者較高表達患者的生存率低(p = 0.013和0.044)。多變量Cox回歸分析顯示,NR_029373和NR_034119可以作為結(jié)直腸癌的獨立預(yù)后指標(biāo)(p分別為0.013 和 0.038)。5.4 個 lncRNA 分子(BANCR,NR_026817,NR_029373 和 NR_034119)在組織和血清中的表達量呈線性相關(guān),且4個lncRNA分子在室溫放置、反復(fù)凍融等處理后表達量穩(wěn)定。結(jié)論:1.結(jié)直腸癌血清 lncRNA 診斷模型(BANCR,NR_026817,NR_029373 和NR_034119)對結(jié)直腸癌早期診斷具有一定的臨床意義。2.NR_029373和NR_034119或可作為結(jié)直腸癌監(jiān)測的獨立預(yù)后指標(biāo)。
[Abstract]:Objective: to screen the specific expression of lncRNA in the serum of colorectal cancer and to establish a lncRNA diagnostic model for colorectal cancer, and to explore the clinical significance of this model in the diagnosis and prognosis of colorectal cancer. Methods: 1. patients with colorectal cancer were selected at the initial stage of screening, and the colorectal cancer and normal tissues were analyzed by gene chip analysis. The results of the differential expression of lncRNA. gene chip between rectal cancer and adjacent normal tissues and related literature were reported, and RT-qPCR technology was used to select the candidate lncRNA molecule.2. confirmation stage. First of all, the candidate lncRNA molecules were tested in 80 colorectal and para cancer tissues, and there were 120 candidates with significant differences in the expression of the candidate molecules. The sera of the colorectal cancer patients and 120 controls were further confirmed, and the lncRNA molecules with significant differences in the tissues and serum were determined. The lncRNA molecules were taken into multiple logisitic regression analysis, the lncRNA diagnostic model of colorectal cancer serum was established, and the receiver operating characte was used (receiver operating characte). Ristic curve, ROC) analysis of the diagnostic efficiency of the serum lncRNA model of colorectal cancer, 120 cancer patients and 120 control serums were selected from the.3. verification stage, and the RT-qPCR method was used to re verify the differential expression molecules identified in the previous stage, and the diagnostic value of serum lncRNA diagnostic model in the diagnosis of colorectal cancer was evaluated. The serum samples of 120 patients with colorectal cancer and 120 controls were measured to compare the serum lncRNA diagnostic model with the efficacy of CEA in the diagnosis of colorectal cancer and to analyze the prognostic information of 120 colorectal cancer patients at the verification stage. Kaplan-Meier analysis was used to analyze the survival curve of colorectal cancer, and the risk of Cox was proportional to the risk of Cox. The model analysis can be used to determine the correlation of the expression of lncRNA molecules in tissue and serum by independent prognostic factor.5. analysis of colorectal cancer prognosis and to detect the expression stability of lncRNA molecules. Results: 5873 differentially expressed lncRNA (more than 2 copies, P0.05) were detected by gene chip analysis at the 1. initial screening stage. A total of 18 lncRNA molecules were selected from the results of the slice analysis and related literature. 10 of the candidate molecules came from the results of the chip. 8 of the molecules were reported from the literature.2. at the confirmation stage. After the initial verification by RT-qPCR, 4 lncRNA molecules (BANCR, NR_026817, NR_029373 and NR_034119) were significantly different in the tissues and serum of colorectal cancer (p0.0 01) the expression of BANCR, NR_026817, NR_029373 and NR_034119 were all down regulated. The area under the working curve of BANCR, NR_026817, NR_029373 and NR_034119 was used to evaluate the area under the working curve of BANCR, NR_026817, NR_029373 and NR_034119 (area under the). The lncRNA diagnosis model of colorectal cancer serum of RNA molecule was 0.891 (95%CI 0.844-0.927, sensitivity 81.67%, specificity 80%).3. verification stage by RT-qPCR, and the serum lncRNA diagnostic model of colorectal cancer was 0.881 (95%CI for 0.833-0.919, sensitivity 89.17%, specificity 75.83%). The AUC for the diagnosis of TNM I, II, III colorectal cancer was 0.774,0.844 and 0.949 respectively, significantly higher than that of CEA corresponding 0.5880695 and 0.861. (P0.05).4.Kaplan-Meier analysis showed low expression of low expression of NR_029373 and NR_034119 colorectal cancer patients (P = 0.013 and 0.044). Multivariate regression analysis showed that 373 and NR_034119 can be used as an independent prognostic indicator of colorectal cancer (P 0.013 and 0.038).5.4 lncRNA molecules (BANCR, NR_026817, NR_029373 and NR_034119) in a linear correlation in the tissue and serum, and 4 lncRNA molecules are placed at room temperature, and after repeated freezing and thawing, the amount of expression is stable. Conclusion: 1. colorectal cancer blood The clear lncRNA diagnostic model (BANCR, NR_026817, NR_029373 and NR_034119) has certain clinical significance for the early diagnosis of colorectal cancer,.2.NR_029373 and NR_034119, or can be used as an independent prognostic indicator for colorectal cancer monitoring.
【學(xué)位授予單位】:山東大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2017
【分類號】:R735.34
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