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蜂膠黃酮PB3A作用下結(jié)腸癌細(xì)胞株中miRNA-198和miRNA-296-5p的表達(dá)及功能預(yù)測

發(fā)布時間:2018-06-05 16:50

  本文選題:短葉松素--乙酸脂 + 結(jié)腸癌SW細(xì)胞; 參考:《中國病理生理雜志》2017年07期


【摘要】:目的:探討蜂膠黃酮短葉松素-3-乙酸酯(pinobanksin-3-acetate,PB3A)對結(jié)腸癌SW480細(xì)胞微小RNA(microRNA,miRNA)表達(dá)譜的影響,為結(jié)腸癌的治療及靶向藥物研發(fā)提供理論依據(jù)。方法:使用miRNA芯片技術(shù)分析檢測蜂膠黃酮PB3A處理人類結(jié)腸癌SW480細(xì)胞后miRNA表達(dá)譜的變化。通過實時熒光定量PCR方法檢測miRNA-198和miRNA-296-5p的表達(dá)水平,以此來驗證miRNA芯片結(jié)果的準(zhǔn)確性和可靠性。利用miRWalk、Micro T、miRanda等12個網(wǎng)上數(shù)據(jù)庫預(yù)測這2條miRNAs的靶基因并進(jìn)行靶基因功能富集分析。結(jié)果:miRNA芯片分析結(jié)果顯示,蜂膠黃酮PB3A干預(yù)24 h后結(jié)腸癌SW480細(xì)胞中差異表達(dá)倍數(shù)在2倍及以上的miRNA有267條,其中差異表達(dá)倍數(shù)達(dá)10倍及以上的miRNA有30條,28條為上調(diào)表達(dá),2條下調(diào)表達(dá);RT-qPCR實驗結(jié)果顯示miRNA-198和miRNA-296-5p的表達(dá)量趨勢跟miRNA芯片結(jié)果一致,表達(dá)差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P0.05)。miRNA靶基因預(yù)測發(fā)現(xiàn)miRNA-198有859個靶基因,miRNA-296-5p有906個靶基因;對這些可能被調(diào)控的靶基因進(jìn)行Gene Class分析,結(jié)果顯示miRNA-198和miRNA-296-5p的靶基因功能主要為轉(zhuǎn)錄因子、拷貝數(shù)變異、細(xì)胞分化、癌基因、蛋白激酶、組蛋白、轉(zhuǎn)移癌基因、腫瘤抑制基因等(P0.05)。信號通路富集分析結(jié)果顯示,miRNA-198靶基因顯著富集于腫瘤通路、Wnt信號通路、胞吞通路、Erb B信號通路、黏著斑通路、黑素生成通路等信號通路,而miRNA-296-5p靶基因在MAPK信號通路、胞吞通路、軸突導(dǎo)向通路、Wnt信號通路、胰島素信號通路、鈣離子信號通路等信號通路中出現(xiàn)聚集(P0.05)。結(jié)論:蜂膠黃酮PB3A影響結(jié)腸癌SW480細(xì)胞的miRNA表達(dá)譜。PB3A作用下miRNA-198和miRNA-296-5p的異常表達(dá)可能參與PB3A抗結(jié)腸癌的過程。
[Abstract]:Objective: to investigate the effect of pinobanksin-3-acetatePB3A on the expression profile of microRNA-miRNAs in colon cancer SW480 cells, and to provide theoretical basis for the treatment of colon cancer and the development of targeted drugs. Methods: miRNA microarray technique was used to detect the expression profile of miRNA in human colon cancer cell line SW480 treated with propolis flavonoid PB3A. The expression levels of miRNA-198 and miRNA-296-5p were detected by real-time fluorescent quantitative PCR to verify the accuracy and reliability of miRNA chip results. The target genes of the two miRNAs were predicted by 12 online databases such as Micro TnmiRanda and the functional enrichment analysis of the two miRNAs was carried out. Results the results of microarray analysis showed that there were 267 miRNAs with a differential expression multiple of 2 times or more in colon cancer SW480 cells after 24 h intervention with propolis flavonoid PB3A. Among them, 30 miRNAs with a multiple of 10 times or more were up-regulated and 2 down-regulated expressions were detected by RT-qPCR. The results of RT-PCR showed that miRNA-198 and miRNA-296-5p showed the same tendency as those of miRNA microarray, and the results of RT-PCR showed that the expression level of miRNA-198 and miRNA-296-5p were the same as those of miRNA microarray. There were significant differences in expression of miRNA-198, 859 target genes of miRNA-296-5p and 906 target genes of miRNA-198. Gene Class analysis showed that the function of the target genes of miRNA-198 and miRNA-296-5p was mainly transcriptional factors, and the results showed that the target gene function of miRNA-198 and miRNA-296-5p was mainly transcriptional factors, and the results showed that the target genes of miRNA-198 and miRNA-296-5p were mainly transcriptional factors. Copy number variation, cell differentiation, oncogene, protein kinase, histone, metastatic oncogene, tumor suppressor gene, etc. The results of signal pathway enrichment analysis showed that the target gene of miRNA-198 was significantly enriched in the tumor pathway, such as Wnt signaling pathway, endocytosis pathway, Erb B signaling pathway, adhesion plaque pathway, melanogenesis pathway, while miRNA-296-5p target gene was located in MAPK signal pathway and cytosolic pathway. The aggregation of P0.05 was found in the signal pathways such as Wnt signaling pathway, insulin signaling pathway and calcium signal pathway. Conclusion: the expression of miRNA-198 and miRNA-296-5p in colon cancer cell line SW480 might be affected by propolis flavonoid PB3A. The abnormal expression of miRNA-198 and miRNA-296-5p may be involved in the process of PB3A anti-colon cancer.
【作者單位】: 新疆大學(xué)生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院;
【基金】:國家自然科學(xué)基金資助項目(No.31660333)
【分類號】:R735.35

【參考文獻(xiàn)】

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【共引文獻(xiàn)】

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【二級參考文獻(xiàn)】

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7 宋e,

本文編號:1982733


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