本文選題：肝細(xì)胞癌 + 腫瘤基因組圖譜�。� 參考：《中國腫瘤生物治療雜志》2017年02期

【摘要】：目的:探討CDCA8和INCENP mRNA在肝細(xì)胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)組織中的表達(dá)及其臨床意義。方法:使用Illumina Nextbio芯片數(shù)據(jù)庫分析原發(fā)性HCC組織和相應(yīng)癌旁組織中CDCA8和INCENP mRNA表達(dá)情況,在癌癥基因組圖譜(The Cancer Genome Atlas,TCGA)肝癌數(shù)據(jù)庫中使用RNA-Seq mRNA表達(dá)數(shù)據(jù)進(jìn)行驗(yàn)證,并結(jié)合TCGA臨床數(shù)據(jù)分析CDCA8和INCENP mRNA表達(dá)水平與HCC患者臨床病理特征及預(yù)后的關(guān)系,使用基因集富集軟件分析目的基因高表達(dá)的相關(guān)通路。結(jié)果:CDCA8和INCENP mRNA在HCC組織中表達(dá)水平顯著上調(diào)(P0.01)。CDCA8 mRNA表達(dá)水平與HCC的組織學(xué)分級、瘤體大小、腫瘤復(fù)發(fā)、美國東部腫瘤協(xié)作組織(ECOG)評級、血清AFP水平、腫瘤基因拷貝數(shù)變異顯著相關(guān)(P0.05);INCENP mRNA表達(dá)水平與HCC的組織學(xué)分級、腫瘤復(fù)發(fā)、ECOG評級、血清AFP水平、腫瘤基因突變總數(shù)和腫瘤基因拷貝數(shù)變異顯著相關(guān)(P0.05)。CDCA8高表達(dá)組患者的OS及TFS顯著低于CDCA8低表達(dá)組患者(P0.01);INCENP高表達(dá)組患者的OS顯著低于INCENP低表達(dá)組患者(P0.05),而TFS無顯著差異(P0.05)。多因素分析顯示,CDCA8 mRNA水平是預(yù)測HCC患者不良預(yù)后的獨(dú)立因素(P0.01)。基因集富集分析表明,CDCA8和INCENP可能在細(xì)胞周期之外的其他生物學(xué)信號通路中發(fā)揮一定作用。結(jié)論:CDCA8和INCENP mRNA在HCC組織中呈現(xiàn)顯著高表達(dá)。CDCA8可能成為HCC預(yù)后的獨(dú)立風(fēng)險(xiǎn)因素和新的治療靶點(diǎn)。
[Abstract]:Objective: to investigate the expression and clinical significance of CDCA8 and INCENP mRNA in hepatocellular carcinoma. Methods: Illumina Nextbio microarray database was used to analyze the expression of CDCA8 and INCENP mRNA in primary HCC tissues and corresponding adjacent tissues, and RNA-Seq mRNA expression data were used to verify the expression of CDCA8 and INCENP mRNA in the cancer genome map of the Cancer Genome Atlas TCGA. Based on the clinical data of TCGA, the relationship between the expression of CDCA8 and INCENP mRNA and the clinicopathological characteristics and prognosis of HCC patients was analyzed. The gene set enrichment software was used to analyze the related pathway of high expression of target gene. Results the expression levels of INCENP mRNA and CDCA8 were significantly up-regulated in HCC tissues. The expression levels of mRNA and HCC were correlated with the histological grade, tumor size, tumor recurrence, Ecog rating and serum AFP level. There was a significant correlation between the expression of INCENP mRNA and the histological grade of HCC, the grade of ECOG and the level of serum AFP. There was a significant correlation between the total mutation of tumor gene and the variation of the copy number of tumor gene. The OS and TFS of the patients with high expression of P0.05N. CDCA8 were significantly lower than those of the patients with high expression of P0.01INCENP and the patients with high expression of INCENP, but there was no significant difference in TFS between the patients with high expression and the patients with low expression of INCENP. Multivariate analysis showed that CDCA8 mRNA level was an independent predictor of poor prognosis in patients with HCC. Gene set enrichment analysis showed that CDCA8 and INCENP may play a role in other biological signaling pathways outside the cell cycle. Conclusion the high expression of CDCA8 and INCENP mRNA in HCC may be an independent risk factor and a new therapeutic target for the prognosis of HCC.
【作者單位】： 復(fù)旦大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院遺傳工程國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【基金】：國家科技重大專項(xiàng)資助項(xiàng)目(No.2013ZX10002010)~~
【分類號】：R735.7

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本文編號：1962012