基于UPLC-MS技術(shù)的鼻咽癌血漿脂質(zhì)組學(xué)初步研究
本文選題:鼻咽癌 + 脂質(zhì)組學(xué) ; 參考:《北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院》2015年博士論文
【摘要】:目的:鼻咽癌是來(lái)源于鼻咽腔或鼻咽隱窩表面上皮的惡性腫瘤,具有易復(fù)發(fā)及早期轉(zhuǎn)移的特點(diǎn)。鼻咽癌的預(yù)后與臨床分期直接相關(guān),但由于鼻咽癌臨床表現(xiàn)不特異以及缺乏簡(jiǎn)單有效的檢測(cè)手段,使得大多數(shù)鼻咽癌患者就診時(shí)疾病已發(fā)展到中晚期。研究發(fā)現(xiàn)Epstein-Barr病毒可以影響宿主細(xì)胞的脂質(zhì)代謝。Epstein-Barr病毒與鼻咽癌的發(fā)生密切相關(guān),鼻咽癌患者作為Epstein-Barr病毒的宿主之一,其脂質(zhì)代謝也可能受到影響。因此對(duì)鼻咽癌患者進(jìn)行脂質(zhì)代謝組學(xué)研究,將有助于進(jìn)一步探討鼻咽癌的發(fā)生機(jī)制。然而目前尚缺乏針對(duì)鼻咽癌的脂質(zhì)組學(xué)的研究。本研究通過(guò)分析初診未治鼻咽癌患者與健康人群的血漿脂質(zhì)代謝情況,試圖尋找可能的診斷標(biāo)志物以及發(fā)現(xiàn)可能存在的代謝途徑變化。方法:本研究選取中山大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院就診的10例初診未治鼻咽癌患者和10例健康志愿者作為研究對(duì)象,采用超高效液相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù)(Ultra-performance Liquid Chromatography-mass spectrometry, UPLC-MS)檢測(cè)血漿樣本中的脂質(zhì)類(lèi)代謝物。結(jié)果:通過(guò)UPLC-MS檢測(cè)及XCMS處理分析,在正負(fù)離子檢測(cè)模式下分別發(fā)現(xiàn)6914和4004個(gè)變量。進(jìn)一步運(yùn)用主成分分析對(duì)包含鼻咽癌組和健康對(duì)照組脂質(zhì)代謝信息的二維數(shù)據(jù)陣進(jìn)行無(wú)監(jiān)督數(shù)據(jù)分析,樣本聚類(lèi)良好。接著采用偏最小二乘判別分析進(jìn)行有監(jiān)督的數(shù)據(jù)分析,并采用500次置換驗(yàn)證防止模型過(guò)度擬合,同時(shí)確定主成分?jǐn)?shù)。運(yùn)用正交偏最小二乘判別分析構(gòu)建的統(tǒng)計(jì)學(xué)模型,并結(jié)合模型獲得的VIP值、jack-knifed置信區(qū)間載荷圖以及代謝輪廓圖篩選差異變量。最后剔除差異變量中的噪音、假峰同位素及碎片離子,最終獲得136個(gè)差異代謝物,其中29個(gè)代謝物能在數(shù)據(jù)庫(kù)中檢索到分子式。本研究對(duì)比分析初診未治的鼻咽癌組和健康對(duì)照組的脂質(zhì)組學(xué)結(jié)果,發(fā)現(xiàn)屬于脂肪酸類(lèi)、甘油酯類(lèi)、甘油磷脂類(lèi)和鞘糖脂類(lèi)的代謝物分子在鼻咽癌患者中含量明顯高于健康對(duì)照組,而屬于鞘磷脂類(lèi)的神經(jīng)酰胺在鼻咽癌組中含量低于健康對(duì)照組。結(jié)論:本研究發(fā)現(xiàn)了一系列可作為鼻咽癌潛在診斷標(biāo)志物的脂類(lèi)小分子代謝物并闡述了差異代謝物的生物學(xué)意義。通過(guò)對(duì)鼻咽癌患者中可能發(fā)生變化的脂質(zhì)代謝途徑進(jìn)行討論,對(duì)鼻咽癌的發(fā)生機(jī)制有了進(jìn)一步了解。
[Abstract]:Objective: nasopharyngeal carcinoma (NPC) is a malignant tumor originating from nasopharyngeal cavity or nasopharyngeal recess.The prognosis of nasopharyngeal carcinoma is directly related to the clinical stage. However, because of the nonspecific clinical manifestations of nasopharyngeal carcinoma and the lack of simple and effective means of detection, most patients with nasopharyngeal carcinoma have developed to the middle and late stage of the disease.It was found that Epstein-Barr virus can affect lipid metabolism of host cells. Epstein-Barr virus is closely related to the occurrence of nasopharyngeal carcinoma. As one of the hosts of Epstein-Barr virus, the lipid metabolism of NPC patients may also be affected.Therefore, the study of lipid metabolism in patients with nasopharyngeal carcinoma will be helpful to further study the pathogenesis of nasopharyngeal carcinoma.However, there is still a lack of lipid studies for nasopharyngeal carcinoma.In this study, we analyzed the plasma lipid metabolism in untreated nasopharyngeal carcinoma patients and healthy people, and tried to find out the possible diagnostic markers and possible metabolic pathway changes.Methods: ten newly diagnosed patients with untreated nasopharyngeal carcinoma and 10 healthy volunteers from Cancer Hospital affiliated to Sun Yat-sen University were selected as subjects.Ultra-performance Liquid Chromatography-mass spectroscopy (UPLC-MS) was used to detect lipid metabolites in plasma samples.Results: 6914 and 4004 variables were found in positive and negative ion detection mode by UPLC-MS detection and XCMS analysis.Furthermore, the unsupervised data matrix containing lipid metabolism information in nasopharyngeal carcinoma group and healthy control group was analyzed by principal component analysis (PCA), and the sample clustering was good.Then the supervised data is analyzed by partial least squares discriminant analysis, and 500 times of permutation verification is used to prevent the model from overfitting, and the main score is determined at the same time.The statistical model was constructed by orthogonal partial least squares discriminant analysis, and the VIP value jack-knifed confidence interval load map and metabolic contour map were used to screen the differential variables.Finally, 136 differentially metabolites were obtained by removing noise, pseudo-peak isotopes and fragment ions, 29 of which could be found in the database.In this study, the results of lipid analysis of nasopharyngeal carcinoma (NPC) with untreated nasopharyngeal carcinoma (NPC) were compared with those of healthy control group. It was found that it belongs to fatty acids and glycerides.The metabolites of glycerol phospholipids and sphingolipids were significantly higher in patients with nasopharyngeal carcinoma than in healthy controls, while ceramide, which belonged to sphingomyelin, was lower in nasopharyngeal carcinoma than that in healthy controls.Conclusion: a series of lipid small molecule metabolites which can be used as potential diagnostic markers for nasopharyngeal carcinoma were found and the biological significance of differential metabolites was expounded.The mechanism of nasopharyngeal carcinoma (NPC) was further understood by discussing the possible changes in lipid metabolism pathway in patients with nasopharyngeal carcinoma (NPC).
【學(xué)位授予單位】:北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類(lèi)號(hào)】:R739.63
【共引文獻(xiàn)】
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,本文編號(hào):1737308
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