本文選題：乳腺癌　切入點(diǎn)：外周血　出處：《腫瘤防治研究》2017年04期 　論文類型：期刊論文

【摘要】：目的探討乳腺癌上皮細(xì)胞與外周血之間的交互作用。方法從GEO數(shù)據(jù)庫(kù)中獲取乳腺癌上皮細(xì)胞及外周血單個(gè)核細(xì)胞(PBMCs)表達(dá)譜。GEO2R在線分析工具篩選差異表達(dá)基因,利用Uni Prot和STRING數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)差異表達(dá)基因蛋白產(chǎn)物進(jìn)行亞細(xì)胞定位,篩選乳腺癌細(xì)胞分泌蛋白及與其相互作用的PBMCs膜蛋白。Cytoscape軟件構(gòu)建互作網(wǎng)絡(luò)。使用DAVID在線工具基因功能注釋和KEGG通路富集方法對(duì)互作分子進(jìn)行分析。結(jié)果共篩選到101對(duì)相互作用分子,基因功能主要涉及細(xì)胞黏附、細(xì)胞遷移、白細(xì)胞激活、免疫反應(yīng)等生物學(xué)過(guò)程,參與的信號(hào)通路主要有細(xì)胞外基質(zhì)—受體相互作用,細(xì)胞因子—細(xì)胞因子受體相互作用,趨化因子信號(hào)通路等。其中FN1、ITGBI、FLT1、COMP、CXCL12為關(guān)鍵蛋白。結(jié)論利用生物信息學(xué)方法,整合組學(xué)數(shù)據(jù),能夠有效獲取信息,為乳腺癌的治療及預(yù)后監(jiān)測(cè)的研究開(kāi)辟新思路。
[Abstract]:Objective to investigate the interaction between breast cancer epithelial cells and peripheral blood. Methods the expression profiles of breast cancer epithelial cells and peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) were obtained from GEO database. GEO2R online analysis tool was used to screen differentially expressed genes. Subcellular localization of differentially expressed gene protein products was performed by using Uni Prot and STRING databases. To screen the secreting proteins of breast cancer cells and their interaction with PBMCs membrane protein. Cytoscape software was used to construct the interaction network. The interaction molecules were analyzed by DAVID online tool gene function annotation and KEGG pathway enrichment method. 101 pairs of interacting molecules, Gene function is mainly involved in biological processes such as cell adhesion, cell migration, leukocyte activation, immune response and so on. The signal pathways involved include extracellular matrix receptor interaction and cytokine cytokine receptor interaction. CXCL12 is a key protein in chemokine signaling pathway. Conclusion Bioinformatics and data integration can effectively obtain information and open up a new way for the study of breast cancer treatment and prognosis monitoring. [WT5 "HZ] [WT5" HZ] [WT5 "BZ] [WT5" HZ] [WT5BZ] CXCL12 is a key protein in chemokine signaling pathway.
【作者單位】： 四川省腫瘤醫(yī)院研究所醫(yī)務(wù)部;成都醫(yī)學(xué)院生物醫(yī)學(xué)系;
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金(81201702) 四川省衛(wèi)計(jì)委科研項(xiàng)目(130295)
【分類號(hào)】：R737.9

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本文編號(hào)：1635109