乳腺癌血清標志物的TMT標記定量蛋白質(zhì)組學(xué)篩選及分析
發(fā)布時間:2018-03-14 04:38
本文選題:乳腺腫瘤 切入點:蛋白質(zhì)組學(xué) 出處:《第二軍醫(yī)大學(xué)學(xué)報》2017年05期 論文類型:期刊論文
【摘要】:目的探討乳腺癌患者血清中蛋白的表達變化,篩選并分析乳腺癌診斷的生物學(xué)標志物。方法采用定量蛋白質(zhì)組學(xué)串聯(lián)質(zhì)量標簽(TMT)標記技術(shù)對68例Ⅱ期乳腺癌患者及62例健康女性的血清蛋白進行檢測,并進行蛋白質(zhì)定量分析,篩選乳腺癌患者血清中發(fā)生顯著變化的差異蛋白。利用Uni Prot數(shù)據(jù)庫和Proteome Discoverer軟件及在線工具STRING對差異蛋白進一步行生物信息學(xué)分析,應(yīng)用蛋白質(zhì)印跡法和q PCR對變化倍數(shù)顯著的差異蛋白VIME(上調(diào)為健康對照女性的3.918倍)和RAF1(下調(diào)為健康對照女性的0.251)進行驗證。結(jié)果共獲得67種差異蛋白,其中26種表達上調(diào),41種表達下調(diào)。基因本體論(GO)注釋分析和功能聚類分析顯示上述差異蛋白與腫瘤的血管生成、新陳代謝進程、生物黏附能力等相關(guān)。蛋白質(zhì)印跡法和q PCR驗證結(jié)果顯示RAF1蛋白和mRNA在Ⅱ期乳腺癌患者血清中的表達水平均低于健康對照女性,而VIME蛋白和mRNA的表達均高于健康對照女性,與篩選結(jié)果一致。結(jié)論定量蛋白質(zhì)組學(xué)TMT法能有效篩選Ⅱ期乳腺癌患者血清中的差異蛋白,其中VIME和RAF1蛋白有望成為乳腺癌淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的候選血清標志物。
[Abstract]:Objective to investigate the changes of serum protein expression in patients with breast cancer. Methods Serum proteins of 68 stage 鈪,
本文編號:1609643
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