利用RNA測序技術探索靜脈內(nèi)平滑肌瘤病與子宮平滑肌瘤關系
本文關鍵詞: 靜脈內(nèi)平滑肌瘤病 子宮平滑肌瘤 RNA轉錄測序 聚類分析 出處:《北京協(xié)和醫(yī)學院》2017年碩士論文 論文類型:學位論文
【摘要】:一、研究背景:靜脈內(nèi)平滑肌瘤病為臨床上較為少見的一種平滑肌細胞腫瘤,其病理學特點提示靜脈內(nèi)平滑肌瘤病為一種良性腫瘤,但其生物學行為具有惡性特點,臨床上可見靜脈內(nèi)平滑肌瘤病瘤體可從子宮內(nèi)侵襲到髂靜脈血管至下腔靜脈,部分病例甚至可至右心房內(nèi),亦有文獻報道該病存在遠處肺轉移。自2002年11月至2015年1月,中國醫(yī)學科學院、北京協(xié)和醫(yī)院共收治了 30757位子宮平滑肌瘤患者,其中有76名患者(占子宮平滑肌瘤患者總數(shù)0.25%)被診斷為靜脈內(nèi)平滑肌瘤病。靜脈內(nèi)平滑肌瘤病患者分別于心外科、血管外科、婦產(chǎn)科接受手術治療。自2002年11月至2016年6月,中國醫(yī)學科學院、北京協(xié)和醫(yī)院心臟外科診斷并手術治療41位靜脈內(nèi)平滑肌瘤病患者,其中有30位(73.3%)患者之前因子宮平滑肌瘤疾病接受手術治療。這個有趣的臨床現(xiàn)象引起了我們的注意,我們推測,靜脈內(nèi)平滑肌瘤病與子宮平滑肌瘤或許存在某些特定的關系。復習文獻可知,目前關于靜脈內(nèi)平滑肌瘤病的起源,有兩種假說較大家廣為接受。第一種假說認為,靜脈內(nèi)平滑肌瘤病起源于血管壁的血管平滑肌細胞;另一種假說則提示,靜脈內(nèi)平滑肌瘤病由子宮平滑肌瘤演化而來。目前現(xiàn)有的文獻中,用于探索靜脈內(nèi)平滑肌瘤病與子宮平滑肌瘤之間關系的實驗方法,多為比較兩者病理結果的差異及免疫組化結果的不同,少部分研究是從分子水平來探索血管平滑肌瘤與子宮平滑肌瘤之間的關系,未發(fā)現(xiàn)使用RNA測序技術來探索靜脈內(nèi)平滑肌瘤病的文獻。因此,我們實驗設計為利用RNA測序技術,從分子水平來探索靜脈內(nèi)平滑肌瘤病與子宮平滑肌瘤之間的關系。二、方法:1.病人及標本:我們從2014年于中國醫(yī)學科學院、北京協(xié)和醫(yī)院心臟外科接受手術治療的靜脈內(nèi)平滑肌瘤病患者中選取5例病人,留取切除血管平滑肌瘤及自身子宮正常平滑肌作為標本;同時從子宮平滑肌瘤患者中留取3例患者子宮平滑肌瘤及正常子宮平滑肌作為對照組。鑒于血管平滑肌瘤的大體標本遠段、中段及近段形態(tài)存在差異,我們將血管平滑肌瘤標本人為分為遠段(近心段)、中段及近段(子宮段)。2.提取RNA及測序:從每個標本選取50 mg標本組織,使用Trizol(Invitrogen)試劑將RNA萃取出來,行質(zhì)量檢測,質(zhì)量檢測合格者使用IlluminaHiSeqTM 2000 platform(Illumina,San Diego,CA)進行 RNA 測序。3.數(shù)據(jù)分析:對所獲得測序數(shù)據(jù)進行分析,得出靜脈內(nèi)平滑肌瘤病組差異表達基因及子宮平滑肌瘤病組差異表達基因的Gene ontology功能富集條目,最后分析包含差異表達基因的標本之間的關系。三、結果:1.血管平滑肌瘤標本的近心段、中段、子宮段共有的差異表達基因較少,提示血管平滑肌瘤或許是多源性基因表達。2.所得到的血管平滑肌瘤和子宮平滑肌瘤組差異表達基因,均富集于GO里的細胞外基質(zhì)、激素刺激反應、細胞黏附、細胞死亡等功能條目。3.聚類分析提示靜脈內(nèi)平滑肌瘤病和子宮平滑肌瘤標本并不能明顯區(qū)分開來。四、結論:血管平滑肌瘤和子宮平滑肌瘤的差異表達基因均與激素刺激反應、細胞外基質(zhì)、細胞粘連等功能相關。這提示血管平滑肌瘤和子宮平滑肌瘤擁有著相似的基因調(diào)控系統(tǒng)。聚類分析結果提示所選取血管平滑肌瘤和子宮平滑肌瘤標本距離較近,不能完全區(qū)分開來。因此我們或許可以認為靜脈內(nèi)平滑肌瘤病與子宮平滑肌瘤功能關系相近,或許是子宮平滑肌瘤的亞型。
[Abstract]:......
【學位授予單位】:北京協(xié)和醫(yī)學院
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2017
【分類號】:R737.33
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,本文編號:1555507
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