利用RNA測(cè)序技術(shù)探索靜脈內(nèi)平滑肌瘤病與子宮平滑肌瘤關(guān)系
本文關(guān)鍵詞: 靜脈內(nèi)平滑肌瘤病 子宮平滑肌瘤 RNA轉(zhuǎn)錄測(cè)序 聚類分析 出處:《北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院》2017年碩士論文 論文類型:學(xué)位論文
【摘要】:一、研究背景:靜脈內(nèi)平滑肌瘤病為臨床上較為少見的一種平滑肌細(xì)胞腫瘤,其病理學(xué)特點(diǎn)提示靜脈內(nèi)平滑肌瘤病為一種良性腫瘤,但其生物學(xué)行為具有惡性特點(diǎn),臨床上可見靜脈內(nèi)平滑肌瘤病瘤體可從子宮內(nèi)侵襲到髂靜脈血管至下腔靜脈,部分病例甚至可至右心房?jī)?nèi),亦有文獻(xiàn)報(bào)道該病存在遠(yuǎn)處肺轉(zhuǎn)移。自2002年11月至2015年1月,中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院、北京協(xié)和醫(yī)院共收治了 30757位子宮平滑肌瘤患者,其中有76名患者(占子宮平滑肌瘤患者總數(shù)0.25%)被診斷為靜脈內(nèi)平滑肌瘤病。靜脈內(nèi)平滑肌瘤病患者分別于心外科、血管外科、婦產(chǎn)科接受手術(shù)治療。自2002年11月至2016年6月,中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院、北京協(xié)和醫(yī)院心臟外科診斷并手術(shù)治療41位靜脈內(nèi)平滑肌瘤病患者,其中有30位(73.3%)患者之前因子宮平滑肌瘤疾病接受手術(shù)治療。這個(gè)有趣的臨床現(xiàn)象引起了我們的注意,我們推測(cè),靜脈內(nèi)平滑肌瘤病與子宮平滑肌瘤或許存在某些特定的關(guān)系。復(fù)習(xí)文獻(xiàn)可知,目前關(guān)于靜脈內(nèi)平滑肌瘤病的起源,有兩種假說較大家廣為接受。第一種假說認(rèn)為,靜脈內(nèi)平滑肌瘤病起源于血管壁的血管平滑肌細(xì)胞;另一種假說則提示,靜脈內(nèi)平滑肌瘤病由子宮平滑肌瘤演化而來。目前現(xiàn)有的文獻(xiàn)中,用于探索靜脈內(nèi)平滑肌瘤病與子宮平滑肌瘤之間關(guān)系的實(shí)驗(yàn)方法,多為比較兩者病理結(jié)果的差異及免疫組化結(jié)果的不同,少部分研究是從分子水平來探索血管平滑肌瘤與子宮平滑肌瘤之間的關(guān)系,未發(fā)現(xiàn)使用RNA測(cè)序技術(shù)來探索靜脈內(nèi)平滑肌瘤病的文獻(xiàn)。因此,我們實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)為利用RNA測(cè)序技術(shù),從分子水平來探索靜脈內(nèi)平滑肌瘤病與子宮平滑肌瘤之間的關(guān)系。二、方法:1.病人及標(biāo)本:我們從2014年于中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院、北京協(xié)和醫(yī)院心臟外科接受手術(shù)治療的靜脈內(nèi)平滑肌瘤病患者中選取5例病人,留取切除血管平滑肌瘤及自身子宮正常平滑肌作為標(biāo)本;同時(shí)從子宮平滑肌瘤患者中留取3例患者子宮平滑肌瘤及正常子宮平滑肌作為對(duì)照組。鑒于血管平滑肌瘤的大體標(biāo)本遠(yuǎn)段、中段及近段形態(tài)存在差異,我們將血管平滑肌瘤標(biāo)本人為分為遠(yuǎn)段(近心段)、中段及近段(子宮段)。2.提取RNA及測(cè)序:從每個(gè)標(biāo)本選取50 mg標(biāo)本組織,使用Trizol(Invitrogen)試劑將RNA萃取出來,行質(zhì)量檢測(cè),質(zhì)量檢測(cè)合格者使用IlluminaHiSeqTM 2000 platform(Illumina,San Diego,CA)進(jìn)行 RNA 測(cè)序。3.數(shù)據(jù)分析:對(duì)所獲得測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,得出靜脈內(nèi)平滑肌瘤病組差異表達(dá)基因及子宮平滑肌瘤病組差異表達(dá)基因的Gene ontology功能富集條目,最后分析包含差異表達(dá)基因的標(biāo)本之間的關(guān)系。三、結(jié)果:1.血管平滑肌瘤標(biāo)本的近心段、中段、子宮段共有的差異表達(dá)基因較少,提示血管平滑肌瘤或許是多源性基因表達(dá)。2.所得到的血管平滑肌瘤和子宮平滑肌瘤組差異表達(dá)基因,均富集于GO里的細(xì)胞外基質(zhì)、激素刺激反應(yīng)、細(xì)胞黏附、細(xì)胞死亡等功能條目。3.聚類分析提示靜脈內(nèi)平滑肌瘤病和子宮平滑肌瘤標(biāo)本并不能明顯區(qū)分開來。四、結(jié)論:血管平滑肌瘤和子宮平滑肌瘤的差異表達(dá)基因均與激素刺激反應(yīng)、細(xì)胞外基質(zhì)、細(xì)胞粘連等功能相關(guān)。這提示血管平滑肌瘤和子宮平滑肌瘤擁有著相似的基因調(diào)控系統(tǒng)。聚類分析結(jié)果提示所選取血管平滑肌瘤和子宮平滑肌瘤標(biāo)本距離較近,不能完全區(qū)分開來。因此我們或許可以認(rèn)為靜脈內(nèi)平滑肌瘤病與子宮平滑肌瘤功能關(guān)系相近,或許是子宮平滑肌瘤的亞型。
[Abstract]:......
【學(xué)位授予單位】:北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2017
【分類號(hào)】:R737.33
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,本文編號(hào):1555507
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