本文關(guān)鍵詞： 肝細(xì)胞癌 microRNAs 生物信息學(xué) 阿霉素　出處：《生物技術(shù)通報》2017年07期 　論文類型：期刊論文

【摘要】：對已在前期實(shí)驗(yàn)中通過Dox誘導(dǎo)肝癌細(xì)胞HepG2 DNA損傷發(fā)現(xiàn)的受p53調(diào)控的hsa-miR-3661進(jìn)行生物信息學(xué)分析,并通過分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)對其功能進(jìn)行了驗(yàn)證,為miR-3661在肝腫瘤中的調(diào)控機(jī)制的研究提供理論基礎(chǔ)。獲取miR-3661結(jié)構(gòu)與序列信息;預(yù)測靶基因,使用DAVID進(jìn)行miRNA靶基因功能富集分析;分析miR-3661的p53結(jié)合位點(diǎn),通過基因間的相互作用構(gòu)建調(diào)控網(wǎng)絡(luò);進(jìn)行細(xì)胞增殖實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證miR-3661抑制腫瘤功能。結(jié)果表明,miR-3661序列保守,啟動子區(qū)存在p53結(jié)合位點(diǎn),暗示p53與hsa-miR-3661存在直接調(diào)控;預(yù)測靶基因1 009個,369個顯著富集于細(xì)胞周期調(diào)控、細(xì)胞增殖、細(xì)胞凋亡等腫瘤相關(guān)生物學(xué)過程(P0.05),主要參與了癌癥信號通路、MAPK信號通路與Erb B信號通路(P0.05);通過268組基因間的相互作用數(shù)據(jù)構(gòu)建了p53、hsa-miR-3661和靶基因的調(diào)控網(wǎng)絡(luò),從系統(tǒng)生物學(xué)角度分析了參與多個腫瘤生物進(jìn)程的關(guān)鍵靶基因;在實(shí)驗(yàn)中證實(shí)過表達(dá)miR-3661可以顯著抑制肝癌細(xì)胞HepG2的增殖過程(P-value=0.001 46)。miR-3661受p53直接調(diào)控,其靶基因顯著富集于多種腫瘤相關(guān)生物進(jìn)程與信號通路,過表達(dá)miR-3661可顯著抑制肝癌細(xì)胞增殖。
[Abstract]:The bioinformatics analysis of p53 regulated hsa-miR-3661 in HepG2 DNA damage induced by Dox in previous experiments was carried out, and its function was verified by molecular biological experiments. It provides a theoretical basis for the study of the regulatory mechanism of miR-3661 in liver neoplasms, acquires the structure and sequence information of miR-3661, predicts the target genes, uses DAVID to analyze the function enrichment of miRNA target genes, and analyzes the p53 binding sites of miR-3661. Through the interaction between genes, the regulatory network was constructed, and the inhibition of tumor function by miR-3661 was verified by cell proliferation experiment. The results showed that the sequence of miR-3661 R-3661 was conserved, and the promoter region had p53 binding site, suggesting that p53 and hsa-miR-3661 were directly regulated. It was predicted that 1 009 target genes were significantly enriched in cell cycle regulation and cell proliferation. Apoptosis and other tumor-related biological processes, such as P0.05, are mainly involved in the Erb B signaling pathway and the cancer signaling pathway, and the regulatory network of p53 hsa-miR-3661 and target genes is constructed by the interaction data of 268 groups of genes. The key target genes involved in many tumor biological processes were analyzed from the point of view of systems biology, and it was proved that overexpression of miR-3661 could significantly inhibit the proliferation of HepG2 cells. Its target gene was significantly enriched in many tumor related biological processes and signaling pathways. Overexpression of miR-3661 could significantly inhibit the proliferation of hepatoma cells.
【作者單位】： 西南交通大學(xué)生命科學(xué)與工程學(xué)院;
【基金】：中央高校基本科研業(yè)務(wù)費(fèi)專項(xiàng)資金(2682016YXZT04) 國家大學(xué)生創(chuàng)新性實(shí)驗(yàn)計(jì)劃項(xiàng)目(201610613066)
【分類號】：R735.7

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本文編號：1503905