宣威地區(qū)肺腺癌病人肺組織特異miRNAs表達(dá)譜和靶基因及其信號(hào)通路預(yù)測(cè)
本文關(guān)鍵詞: miRNA芯片 miRNAs 宣威肺腺癌 靶基因 信號(hào)通路 出處:《南方醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào)》2017年02期 論文類(lèi)型:期刊論文
【摘要】:目的篩選出宣威地區(qū)肺腺癌病人肺組織miRNAs差異表達(dá)譜,預(yù)測(cè)其相關(guān)靶基因和信號(hào)通路。方法選取來(lái)自宣威地區(qū)肺腺癌24例和非宣威地區(qū)肺腺癌10例患者手術(shù)切除的肺癌組織和正常肺組織標(biāo)本,miRNAs芯片檢測(cè)34對(duì)肺癌切除標(biāo)本,篩選宣威肺腺癌miRNAs差異表達(dá)譜,AGO分析和KEGG Pathway分析預(yù)測(cè)其miRNAs的生物與肺癌相關(guān)的靶基因和信號(hào)通路。結(jié)果 miRNAs芯片檢測(cè):與非宣威肺腺癌比較,宣威肺腺癌差異表達(dá)顯著的特異miRNAs 34個(gè):表達(dá)上調(diào)的miRNAs有23個(gè),表達(dá)下調(diào)的miRNAs有11個(gè)。AGO富集分析及KEGG數(shù)據(jù)庫(kù)映射分析發(fā)現(xiàn):預(yù)測(cè)主要集中在PI3K/Alt信號(hào)通路附近,其預(yù)測(cè)靶基因有:GF、RTK、SOS、IRS1、BCAP、CYTOKINSR、ECM、ITGB、FAK和GβY,可能對(duì)肺癌生物學(xué)功能產(chǎn)生影響的靶基因主要集中在PI3K/Alt,WNT和MAPK通路。結(jié)論篩選出這些特異性miRNAs可能在宣威肺腺癌癌變和進(jìn)展中起重要作用,預(yù)測(cè)的靶基因可能與調(diào)節(jié)PI3K/Alt,WNT和MAPK信號(hào)通路的作用有關(guān)。
[Abstract]:Objective to screen the differential expression profiles of miRNAs in lung tissues of patients with adenocarcinoma of lung in Xuanwei area. Methods 24 cases of lung adenocarcinoma in Xuanwei area and 10 cases of lung adenocarcinoma in non-Xuanwei area were selected from lung cancer tissue and normal lung tissue. 34 pairs of lung cancer specimens were detected by miRNAs microarray, and the differential expression profiles of miRNAs in Xuanwei lung adenocarcinoma were screened. AGO analysis and KEGG Pathway analysis were used to predict the target genes and signaling pathways associated with lung cancer in miRNAs. Results miRNAs microarray was used to detect:. Compared with non-Xuan Wei lung adenocarcinoma. There were 34 differentially expressed specific miRNAs in Xuanwei lung adenocarcinoma and 23 up-regulated miRNAs. There were 11. Ago enrichment analysis and KEGG database mapping analysis of down-regulated miRNAs. It was found that the prediction was mainly near the PI3K/Alt signaling pathway. The predicted target genes were: GFG / RTK / SOS / IRS1 / BCAPX / CYTOKINSRS / ECM / ITGBGFAK and G 尾 _ Y, respectively. The target genes which may affect the biological function of lung cancer mainly focus on PI3K/Alt. Conclusion the screening of these specific miRNAs may play an important role in the carcinogenesis and progression of Xuanwei lung adenocarcinoma. The predicted target gene may play an important role in the regulation of PI3K/Alt. The role of WNT and MAPK signaling pathway is related.
【作者單位】: 昆明醫(yī)科大學(xué)第三附屬醫(yī)院//云南省腫瘤醫(yī)院//云南省肺癌研究重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【基金】:國(guó)家自然科學(xué)基金(U1202224,81460441) 云南省應(yīng)用基礎(chǔ)研究面上項(xiàng)目(2016FB145) 云南省衛(wèi)生科技計(jì)劃項(xiàng)目(2014NS001) 云南省醫(yī)療衛(wèi)生單位內(nèi)設(shè)研究基金(2016NS106) 云南省腫瘤醫(yī)院博士科研啟動(dòng)基金(BSJJ201502)~~
【分類(lèi)號(hào)】:R734.2
【正文快照】: 肺癌死亡率位居全世界癌癥之首,每年超過(guò)140萬(wàn)人死于肺癌[1]。盡管在早期診斷和新的治療策略方面獲得進(jìn)展,但是肺癌病人5年總體生存率仍然低于15%[2]。宣威肺癌是指位于中國(guó)西南云南省宣威地區(qū)(包括宣威、富源、麒麟和沾益縣等)居民所患的肺癌,女性肺癌發(fā)病率高達(dá)400/10萬(wàn),高
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,本文編號(hào):1488591
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