肝內(nèi)膽管細胞癌差異LncRNA表達分析
本文關(guān)鍵詞:肝內(nèi)膽管細胞癌差異LncRNA表達分析 出處:《上海交通大學(xué)》2015年碩士論文 論文類型:學(xué)位論文
更多相關(guān)文章: 肝臟腫瘤 肝內(nèi)膽管細胞癌 長鏈非編碼RNA
【摘要】:【目的】:肝內(nèi)膽管細胞癌的發(fā)病率逐年上升且起病隱匿、易轉(zhuǎn)移、并對化療不敏感,具有不良的臨床后果。目前尚未有效的早期診斷標志物、治療方法、預(yù)后判斷標準。本實驗期望能夠通過對肝內(nèi)膽管細胞癌腫瘤組織中差異長鏈非編碼RNA進行分析,討論長鏈非編碼RNA在肝內(nèi)膽管細胞癌的發(fā)病中所可能起到的作用,并篩選出與ICC發(fā)病、治療或預(yù)后相關(guān)的Lnc RNA!痉椒ā:收集經(jīng)臨床病理證實為肝內(nèi)膽管細胞癌的腫瘤組織與正常膽管組織,利用Angilent 4*180K人類Lnc RNA芯片檢測其m RNA與Lnc RNA的表達情況,并篩選出具有差異表達的m RNA與Lnc RNA。通過m RNA共表達分析預(yù)測差異Lnc RNA可能的功能,并從中篩選出于具有腫瘤相關(guān)性的Lnc RNA,以便行進一步研究。【結(jié)果】:通過對芯片數(shù)據(jù)進行分析,共發(fā)現(xiàn)差異表達的m RNA 718條,其中上調(diào)表達的m RNA有432條,下調(diào)表達的m RNA有286條;共發(fā)現(xiàn)差異表達的長鏈非編碼RNA 1740條,其中上調(diào)表達的長鏈非編碼RNA有1427條,下調(diào)表達的長鏈非編碼RNA有313條。研究發(fā)現(xiàn)腫瘤相關(guān)性長鏈非編碼RNA CRNDE、CBR3-AS1、SOX2-OT在肝內(nèi)膽管細胞癌中具有差異表達,并根據(jù)Lnc RNA預(yù)測結(jié)果從中篩選出具有腫瘤相關(guān)性且表達差異倍數(shù)大于4倍、P值小于0.01的Lnc RNA 86個!窘Y(jié)論】:長鏈非編碼RNA可能參與細胞功能的各個方面,在肝內(nèi)膽管細胞癌的發(fā)病中起著重要作用,其可能通過調(diào)節(jié)細胞內(nèi)信號通路而差異ICC致病過程。長鏈非編碼RNA CRNDE、CBR3-AS1可能在ICC致病過程中具有關(guān)鍵作用。Mapk信號通路、Rap1信號通路、Ras信號通路、PI3K-AKT信號通路可能在ICC致病過程中起重要作用。
[Abstract]:......
【學(xué)位授予單位】:上海交通大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號】:R735.8
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,本文編號:1350037
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