本文關(guān)鍵詞：MicroRNA-497抑制炎癥相關(guān)基因在結(jié)腸癌細(xì)胞的表達(dá)　出處：《山西醫(yī)科大學(xué)》2016年碩士論文　論文類型：學(xué)位論文

  更多相關(guān)文章： miR-497 結(jié)腸癌 炎癥相關(guān)基因 GO功能注釋 pathway分析

【摘要】：目的:建立高表達(dá)miR-497的結(jié)腸癌細(xì)胞模型;分析miR-497高表達(dá)結(jié)腸癌細(xì)胞的基因表達(dá)譜,篩選差異表達(dá)基因,探索在結(jié)腸癌細(xì)胞中miR-497對炎癥相關(guān)基因的影響。方法:1、高表達(dá)miR-497的結(jié)腸癌細(xì)胞模型的建立構(gòu)建miR-497慢病毒表達(dá)載體并進(jìn)行慢病毒包裝;miR-497慢病毒感染結(jié)腸癌細(xì)胞,用流式分選技術(shù)結(jié)合嘌呤霉素篩選感染陽性的細(xì)胞;采用細(xì)胞計數(shù)法繪制高表達(dá)miR-497的結(jié)腸癌細(xì)胞及對照細(xì)胞的生長曲線。2、全基因組表達(dá)芯片篩選差異表達(dá)基因并驗(yàn)證應(yīng)用全基因組表達(dá)芯片篩選miR-497過表達(dá)后差異表達(dá)基因;MAS3.0生物信息注釋系統(tǒng)對差異表達(dá)基因進(jìn)行GO分析和KEGG pathway分析;利用生物信息學(xué)網(wǎng)站Targetscan對miR-497進(jìn)行靶基因預(yù)測,并對預(yù)測靶基因與下調(diào)基因取交集得到的基因進(jìn)行pathway分析,篩選與炎癥相關(guān)的基因;RT-qPCR方法驗(yàn)證差異基因在穩(wěn)定轉(zhuǎn)染的結(jié)腸癌細(xì)胞及結(jié)腸癌組織中的表達(dá)。結(jié)果:1、成功構(gòu)建了穩(wěn)定高表達(dá)miR-497結(jié)腸癌細(xì)胞株,GFP陽性細(xì)胞達(dá)90%以上,miR-497表達(dá)量是對照組的77倍(P0.05);miR-497穩(wěn)定高表達(dá)的結(jié)腸癌細(xì)胞增殖減慢。2、篩選出Absolute Fold change 3倍以上的差異基因共1053個,其中表達(dá)上調(diào)基因471個,下調(diào)基因582個;經(jīng)GO分析,下調(diào)基因主要參與轉(zhuǎn)錄調(diào)控、免疫反應(yīng)、信號轉(zhuǎn)導(dǎo)等生物學(xué)過程;KEGG pathway分析表明,下調(diào)基因主要參與MAPK、細(xì)胞因子與受體、Jak-STAT等炎癥相關(guān)信號通路;下調(diào)基因中預(yù)測出miR-497可能的靶基因有125個,富集于MAPK和細(xì)胞因子與受體、Jak-STAT等信號通路;RT-qPCR驗(yàn)證結(jié)果表明,選取的15個炎癥相關(guān)基因中有10個基因在miR-497高表達(dá)的HCT116細(xì)胞中表達(dá)下降,與芯片結(jié)果一致;其中IL29、TNFSF15、IL11、JAK3和IL2Rβ等5個基因在mi R-497低表達(dá)的結(jié)腸癌組織中表達(dá)上調(diào)。結(jié)論:穩(wěn)定高表達(dá)miR-497的結(jié)腸癌細(xì)胞建立成功;miR-497抑制炎癥相關(guān)基因在結(jié)腸癌細(xì)胞的表達(dá)
【學(xué)位授予單位】：山西醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類號】：R735.35

【相似文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前10條

1 胡平,琚立華,徐元鼎;結(jié)腸癌細(xì)胞核DNA含量測量及形態(tài)分析[J];復(fù)旦學(xué)報(醫(yī)學(xué)版);2003年05期

2 王春暉;歐陽欽;唐承薇;黃明慧;李獻(xiàn);;選擇性及非選擇性COX-2抑制劑對結(jié)腸癌細(xì)胞生長的影響[J];四川大學(xué)學(xué)報(醫(yī)學(xué)版);2006年04期

3 韓忠寶;李洪祥;楊翊研;;生長抑素聯(lián)合阿霉素體外抑制結(jié)腸癌細(xì)胞的實(shí)驗(yàn)研究[J];吉林醫(yī)學(xué);2006年09期

4 張朝陽;徐克森;楊廣運(yùn);王金申;高穎;劉炎峰;帥晶;王家勇;李少燕;壽楠海;牛軍;;反義整合素β6基因?qū)Y(jié)腸癌細(xì)胞作用的研究[J];中華醫(yī)學(xué)雜志;2007年37期

5 沈丹;鄧長生;;過氧化物酶體增殖物激活受體γ在結(jié)腸癌中的表達(dá)及其激動劑對結(jié)腸癌細(xì)胞的生長抑制作用[J];臨床內(nèi)科雜志;2008年01期

6 田永剛;許軍;劉昶;;人工氣腹對結(jié)腸癌細(xì)胞生物學(xué)行為的影響[J];腹腔鏡外科雜志;2009年10期

7 高喜廉，傅志民，姜宗源;結(jié)腸癌細(xì)胞腸壁縱向浸潤與臨床意義[J];中國醫(yī)科大學(xué)學(xué)報;1994年03期

8 鄭平菊,黃威權(quán),王瑞安,孫嵐,高平;5-羥色胺及其受體在結(jié)腸癌細(xì)胞的免疫組織化學(xué)定位[J];科學(xué)通報;1995年21期

9 林潔;黃瓊;來茂德;;5-氮-2′-脫氧胞苷對結(jié)腸癌細(xì)胞生物學(xué)行為的影響[J];臨床與實(shí)驗(yàn)病理學(xué)雜志;2008年04期

10 王德力;齊東麗;;光鑷?yán)庾V技術(shù)檢測結(jié)腸癌細(xì)胞的研究[J];長春大學(xué)學(xué)報;2009年04期

相關(guān)會議論文 前10條

1 許峰;王杉;葉穎江;崔志榮;;腫瘤浸潤淋巴細(xì)胞在結(jié)腸癌細(xì)胞殺傷中的作用及機(jī)制[A];中華醫(yī)學(xué)會第七次全國消化病學(xué)術(shù)會議論文匯編（下冊）[C];2007年

2 王貴玉;王錫山;;激光捕獲微切割技術(shù)分離結(jié)腸癌細(xì)胞用于蛋白組學(xué)研究[A];中國蛋白質(zhì)組學(xué)第三屆學(xué)術(shù)大會論文摘要[C];2005年

3 沈丹;鄧長生;;過氧化物酶體增殖物激活受體γ在結(jié)腸癌中的表達(dá)及其激動劑對結(jié)腸癌細(xì)胞的生長抑制作用[A];中華醫(yī)學(xué)會第七次全國消化病學(xué)術(shù)會議論文匯編（下冊）[C];2007年

4 郭俊明;賴依峰;肖丙秀;劉瓊;;大豆異黃酮對體外培養(yǎng)的結(jié)腸癌細(xì)胞生長和細(xì)胞周期的影響[A];華東六省一市生物化學(xué)與分子生物學(xué)會2003年學(xué)術(shù)交流會論文摘要集[C];2003年

5 李本輝;楊賢子;張文杰;;人類結(jié)腸癌細(xì)胞缺陷型Stat6~(null)活化表型與癌細(xì)胞高凋亡率及低侵襲轉(zhuǎn)移力相關(guān)[A];湖北省抗癌協(xié)會青年委員會成立大會暨第一屆青年學(xué)術(shù)論壇資料匯編[C];2009年

6 王國強(qiáng);方m錁，

本文編號：1327805