本文關(guān)鍵詞：姓氏與食管癌關(guān)系及其遺傳分子機(jī)理

  更多相關(guān)文章： 食管癌 姓氏 全基因組關(guān)聯(lián)分析

【摘要】：1研究背景與目的食管癌是世界上常見(jiàn)的六大惡性腫瘤之一,發(fā)病比較隱匿,一旦發(fā)現(xiàn),90%的患者便是中晚期并且早期診斷率較低,預(yù)后差。目前,食管癌仍然是威脅人類(lèi)生命的重大疾病之一,特別是河南、河北和山西交界的太行山地區(qū)是食管癌發(fā)病率和死亡率最高的地區(qū)。近年研究提示,環(huán)境和遺傳交互作用可能是導(dǎo)致食管癌發(fā)生的重要機(jī)制之一。有學(xué)者提出：假設(shè)識(shí)別隱藏“血緣”或者促癌基因在Y染色體上,近親結(jié)婚和源自共同的祖先不僅使祖先的一些姓氏頻率會(huì)越來(lái)越高,而且會(huì)增加疾病的發(fā)生。姓氏在一定程度上代表腫瘤的“風(fēng)險(xiǎn)”,這些風(fēng)險(xiǎn)同時(shí)也來(lái)自于Y染色體的發(fā)展,這些都強(qiáng)調(diào)了小繁殖種群的隔離在奠基者效應(yīng)和遺傳傾向的疾病中的重要性。Y染色體是男性特有的,姓氏靠男性來(lái)穩(wěn)定相傳,因此,隨之姓氏的代代相傳,Y染色體上的遺傳信息也得到了穩(wěn)定的傳遞,姓氏和染色體關(guān)系的存在,為姓氏遺傳結(jié)構(gòu)和親緣關(guān)系的研究提供依據(jù),這種發(fā)現(xiàn)被科學(xué)家稱(chēng)為“姓氏基因”。中國(guó)漢族姓氏作為一種獨(dú)特的文化和群體遺傳標(biāo)志已受到國(guó)內(nèi)外學(xué)者的關(guān)注。但是,尚無(wú)有關(guān)姓氏作為群體遺傳的標(biāo)志與疾病,特別是與腫瘤遺傳關(guān)系的研究報(bào)道。本研究旨在分析中國(guó)漢族人群食管癌患者姓氏分布,加深對(duì)中國(guó)漢族姓氏與食管癌關(guān)系的了解,并為進(jìn)一步闡明中國(guó)漢族姓氏與腫瘤遺傳的分子機(jī)理提供新思路。全基因組關(guān)聯(lián)分析(genome-wide association study, GWAS)是一種被公認(rèn)的識(shí)別復(fù)雜疾病易感基因的一項(xiàng)技術(shù),它是一種高通量的生物芯片技術(shù)。本研究通過(guò)病例-對(duì)照研究,利用GWAS技術(shù),發(fā)現(xiàn)各姓氏與食管癌發(fā)生的相關(guān)性。2材料與方法2.1漢族食管癌患者姓氏分布2.1.1研究對(duì)象101171例漢族食管癌患者均來(lái)自鄭州大學(xué)一附院河南省食管癌重點(diǎn)開(kāi)放實(shí)驗(yàn)室食管癌生物樣品資料庫(kù),所有患者均經(jīng)病理確診為食管鱗狀細(xì)胞癌。根據(jù)患者就診醫(yī)院病歷記錄,核查和補(bǔ)充患者種族、性別、診斷年齡、籍貫等臨床信息。確診時(shí)間在1973-2014年之間,男性64658例,女性36513例,男女比例是1.8：1,平均診斷年齡為(59.3+9.8)歲,其中男性為(59.2+9.7)歲,女性為(59.5+9.9)歲。2.1.2 資料來(lái)源、收集與整理所有的食管癌患者信息來(lái)源于現(xiàn)場(chǎng)大規(guī)模的人口問(wèn)卷調(diào)查和隨訪,這些調(diào)查信息均采用2007版Excel輸入。2.1.3 統(tǒng)計(jì)方法所有的數(shù)據(jù)分析均采用SPSS21.0軟件對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行處理分析。篩選食管癌資料庫(kù)中姓氏比例均大于總食管癌人群的2.0%的8個(gè)姓氏(王、張、李、劉、楊、趙、郭、陳)進(jìn)行分析。食管癌患者不同性別、年齡、地區(qū)中姓氏分布比較采用卡方檢驗(yàn),顯著性檢驗(yàn)水準(zhǔn)取α=0.05,P0.05有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。2.2 全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS)2.2.1 研究對(duì)象進(jìn)入GWAS研究的共有2076例漢族人群(病例組1381例,對(duì)照組695例)在兩組中分別篩選出(王、張、李、劉、楊、趙、郭、陳)8個(gè)姓氏,并且每人姓氏均大于20例,進(jìn)入分析,采集入選人群3-5ml外周靜脈血,-20℃儲(chǔ)存。2.2.2 研究方法用德國(guó)QIAGEN基因組DNA提取試劑盒提取血液樣本基因組DNA,準(zhǔn)確測(cè)定每份待標(biāo)化樣本DNA的濃度,DNA濃度保持在50ng/μl, OD值在1.8-2.0之間,選用Illumina Human 610-Quad芯片。計(jì)算樣本得率,SNP得率、最小等位基因頻率(minor allele frequency, MAP)、哈迪·溫伯格(Hardy-Weinberg; HWE)平衡律。對(duì)質(zhì)控后的數(shù)據(jù)用Golden Helix公司的SNP Variation Suite 8 (SVS 8)軟件分析并輸出結(jié)果,用Cochran-Armitage趨勢(shì)檢驗(yàn)計(jì)算P值、優(yōu)勢(shì)比(Odds ratio, OR)和95%可信區(qū)間(95% confidence interval,95%CI)。3. 結(jié)果3.1 漢族食管癌患者姓氏分布特征3.1.1 食管癌患者姓氏分布101171例漢族食管癌患者中,包括963個(gè)姓氏,男性中有830個(gè)姓氏,女性中有640個(gè)姓氏�？�?cè)巳褐行帐媳壤?.0%的姓氏有8個(gè),其中男性中有5個(gè)姓氏,女性中有4個(gè)姓氏。3.1.2不同性別、年齡食管癌患者姓氏分布101171例漢族食管癌患者中姓氏比例≥2.0%的姓氏有8個(gè),其中王姓最多(10.9%)、其次是張姓(9.6%)、李姓(9.4%)、劉姓(5.7%)、楊姓(3.4%)、趙姓(2.9%)、郭姓(2.8%)、陳姓(2.7%)。在男性食管癌患者50歲和50歲時(shí),這8個(gè)姓氏分布基本相同,差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=6.456,P=0.488),女性也是如此(χ2=3.569,P=0.828)。3.1.3不同地區(qū)食管癌患者姓氏分布比較101171例漢族食管癌患者中上述8個(gè)姓氏在河南省、河北省、山東省、山西省和安徽省的分布不同(χ2=191.338,P0.001)。通過(guò)對(duì)這5個(gè)省中8個(gè)姓氏的分布進(jìn)行兩兩計(jì)較發(fā)現(xiàn),河南省與河北省食管癌高發(fā)的8個(gè)姓氏分布基本一致(χ2=8.092,P=0.325)。其它省份8個(gè)姓氏分布均不同(P值均0.05)。3.2全基因組關(guān)聯(lián)分析結(jié)果8個(gè)姓氏食管癌易感性相關(guān)的SNPs(single nucleotide polymorphisms)不同,并且各姓氏在P值≤10-6、P值≤10-7、和P值≤10-8時(shí),各姓氏易感基因位點(diǎn)數(shù)量基本不同。隨著P值的下降,各姓氏易感基因位點(diǎn)數(shù)量改變不同。當(dāng)P值≤10-7時(shí),8個(gè)姓氏中只有5個(gè)姓氏有易感的SNPs位點(diǎn)。其中,陳姓的易感SNPs位點(diǎn)有15個(gè),其中主要定位在B1和B2兩個(gè)基因上；李姓的易感SNPs位點(diǎn)有6個(gè),其中主要定位在D基因；張姓的易感SNPs位點(diǎn)有1個(gè),其中主要定位在F基因上；楊姓的易感SNPs位點(diǎn)有4個(gè),主要定位在H基因；郭姓易感SNPs位點(diǎn)有5個(gè),主要定位在J基因上。4結(jié)論4.1漢族食管癌患者姓氏分布特征食管癌患者河南省和河北省高發(fā)姓氏分布相似,其它省份姓氏分布不同。食管癌患者高發(fā)姓氏分布與年齡無(wú)關(guān),食管癌患者高發(fā)姓氏分布在高發(fā)區(qū)的分布相同。4.2姓氏對(duì)食管癌的影響各個(gè)姓氏食管癌易感基因基本一致,不同姓氏食管癌易感基因不同。
【學(xué)位授予單位】：新鄉(xiāng)醫(yī)學(xué)院
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2015
【分類(lèi)號(hào)】：R735.1

【參考文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

1 周衡;黃貴華;;中醫(yī)對(duì)食管癌的認(rèn)識(shí)和治療研究進(jìn)展[J];遼寧中醫(yī)藥大學(xué)學(xué)報(bào);2012年02期

2 王偉鵬;黃佳;湯薩;袁果;陳莉莎;侯志超;劉亞麗;劉靜;王立東;;中晚期食管癌腫瘤大體類(lèi)型生物學(xué)特征及其對(duì)生存期的影響[J];河南大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版);2013年03期

3 閆圓圓;李文武;;CT灌注成像在食管癌中的應(yīng)用[J];中華腫瘤防治雜志;2011年13期

4 張永貞;王國(guó)平;許翊;馬朝輝;王媛;曹凌;王昕琛;;食管癌患者術(shù)后預(yù)后影響因素分析[J];現(xiàn)代預(yù)防醫(yī)學(xué);2011年09期

5 鄧登豪,朱海杭,羅金燕,張軍,王康敏,左紅梅;內(nèi)鏡下Toluidine Blue和Lugol’s Solution雙重染色在食管早期癌和淺表癌診斷中的意義[J];中國(guó)內(nèi)鏡雜志;2001年02期

6 李曉東;徐紅;孫巖;張建廣;李星花;;自體熒光內(nèi)鏡對(duì)早期胃癌診斷價(jià)值薈萃分析[J];中國(guó)內(nèi)鏡雜志;2010年11期

7 周倫,余海,鄭樹(shù),陸文娟,高慧萍,錢(qián)可大;隱血珠檢測(cè)上消化道出血病變的價(jià)值[J];中華腫瘤雜志;1999年01期

8 余英清;余燕武;;鋇餐造影與CT掃描在食道癌診斷中的價(jià)值[J];中國(guó)誤診學(xué)雜志;2006年02期

9 陳利華,趙平,任光國(guó),鄭少東;食管癌淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移與腫瘤長(zhǎng)度、侵潤(rùn)深度及分化程度的關(guān)系[J];中國(guó)胸心血管外科臨床雜志;1996年02期

10 ;Quality of life after three kinds of esophagectomy for cancer[J];World Journal of Gastroenterology;2012年36期

，

本文編號(hào)：1280079