發(fā)布時(shí)間：2017-12-11 06:12

  本文關(guān)鍵詞：癌癥相關(guān)信號(hào)通路分析研究

  更多相關(guān)文章： 信號(hào)通路分析 皮爾森相關(guān)系數(shù) 互信息 子通路分析 特定的生物功能 癌癥

【摘要】：隨著生態(tài)環(huán)境的惡化以及其它的一些問(wèn)題,全球范圍內(nèi)癌癥的發(fā)病率一直持續(xù)上升尤其是中國(guó)。全球半數(shù)癌癥病例在亞洲,而亞洲大部分的癌癥患者集中在中國(guó)。大量的研究表明,許多癌癥的發(fā)生與信號(hào)通路的功能障礙有關(guān)。確定癌癥相關(guān)的信號(hào)通路可以幫助研究者研究治療癌癥的靶向藥物。本文主要從兩個(gè)方面研究了癌癥相關(guān)信號(hào)通路的識(shí)別。首先,已有的信號(hào)通路影響分析方法中僅僅將基因之間的左右關(guān)系簡(jiǎn)單的歸結(jié)為激活(+1)和抑制(-1),而沒(méi)有考慮在實(shí)際細(xì)胞網(wǎng)絡(luò)中基因之間的相互作用強(qiáng)度。針對(duì)這一問(wèn)題,我們研究了基于皮爾森相關(guān)系數(shù)或互信息的信號(hào)通路影響分析方法。在結(jié)腸癌數(shù)據(jù)集、肺癌數(shù)據(jù)集和胰腺癌數(shù)據(jù)集上的結(jié)果表明,基于皮爾森相關(guān)系數(shù)的信號(hào)通路影響分析方法與基于互信息的信號(hào)通路影響分析方法都能明顯提高原信號(hào)通路影響分析方法識(shí)別癌癥相關(guān)通路的能力,而且基于互信息的方法性能比基于皮爾森相關(guān)系數(shù)的方法更好。其次,近年來(lái)研究人員認(rèn)為癌癥的發(fā)生發(fā)展并不一定是整個(gè)通路發(fā)生了故障,而更有可能是一個(gè)通路中局部區(qū)域——子通路的功能發(fā)生了變化。因此子通路的分析方法引起了研究人員的關(guān)注,現(xiàn)有的子通路分析方法對(duì)于子通路的定義并不統(tǒng)一,有的將子通路定義為一個(gè)富集差異基因的團(tuán)或簇,有的定義為一個(gè)線性信號(hào)路徑。由于在KEGG數(shù)據(jù)庫(kù)中,大部分通路的末端都指向一些功能明確的生物功能,本文將指向一個(gè)特定功能的所有節(jié)點(diǎn)構(gòu)成的子網(wǎng)絡(luò)定義為功能子通路,進(jìn)而研究了基于這種功能子通路的癌癥相關(guān)通路的識(shí)別。在腸癌數(shù)據(jù)集、肺癌數(shù)據(jù)集和胰腺癌數(shù)據(jù)集上的結(jié)果表明,這一方法明顯提高了癌癥相關(guān)子通路的識(shí)別精度,而且,我們發(fā)現(xiàn)在這些功能中,有一些功能在三種癌癥中都顯著差異,而又另一些功能則僅僅富集于特定的癌癥。這一研究對(duì)于進(jìn)一步認(rèn)識(shí)生物通路的功能與癌癥的關(guān)系提供了重要的指導(dǎo)意義。
【學(xué)位授予單位】：溫州大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類(lèi)號(hào)】：TP311.13;R730.5

【相似文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

1 王春梅,姜濤,周春燕;誘導(dǎo)心臟發(fā)生的早期信號(hào)通路[J];中國(guó)生物化學(xué)與分子生物學(xué)報(bào);2004年05期

2 解文博;葉玲;;p38絲裂原活化蛋白激酶信號(hào)通路的部分研究方法[J];牙體牙髓牙周病學(xué)雜志;2009年10期

3 黎增輝;廖愛(ài)軍;;JNK信號(hào)通路[J];國(guó)際病理科學(xué)與臨床雜志;2010年03期

4 李林;;Wnt信號(hào)通路及其與骨形成的關(guān)系[J];臨床和實(shí)驗(yàn)醫(yī)學(xué)雜志;2010年20期

5 李鳳賀;辛世杰;楊棟;惠林萍;楊昱;張健;段志泉;;SHH信號(hào)通路在血小板源性生長(zhǎng)因子誘導(dǎo)的血管平滑肌細(xì)胞增殖中的作用研究[J];中國(guó)血管外科雜志(電子版);2010年04期

6 陳建勇;王聰;王娟;曹禮榮;;MAPK信號(hào)通路研究進(jìn)展[J];中國(guó)醫(yī)藥科學(xué);2011年08期

7 李寶新;李玉坤;;Wnt信號(hào)通路對(duì)骨調(diào)節(jié)研究新進(jìn)展[J];國(guó)際骨科學(xué)雜志;2008年03期

8 李佳殷;林麗珠;;JNK信號(hào)通路在惡性腫瘤中的研究進(jìn)展[J];實(shí)用中醫(yī)內(nèi)科雜志;2012年18期

9 張玉婷;劉立新;;胰島素樣生長(zhǎng)因子結(jié)合蛋白在相關(guān)信號(hào)通路中的作用研究進(jìn)展[J];中華消化病與影像雜志(電子版);2012年05期

10 席曉慧;王福文;牟艷玲;;Wnt信號(hào)通路與心血管疾病的研究進(jìn)展[J];食品與藥品;2014年01期

中國(guó)重要會(huì)議論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

1 程華;王文;;經(jīng)典Wnt信號(hào)通路抑制劑[A];2011全國(guó)老年癡呆與衰老相關(guān)疾病學(xué)術(shù)會(huì)議第三屆山東省神經(jīng)內(nèi)科醫(yī)師（學(xué)術(shù)）論壇論文匯編[C];2011年

2 蔣瑩;程華;張麗;艾厚喜;王文;;經(jīng)典Wnt信號(hào)通路抑制劑[A];第一屆全國(guó)麻醉藥理專(zhuān)業(yè)委員會(huì)第二次學(xué)術(shù)會(huì)議論文集[C];2011年

3 蔣瑩;程華;張麗;艾厚喜;王文;;經(jīng)典Wnt信號(hào)通路抑制劑[A];中國(guó)成人醫(yī)藥教育論壇（4）[C];2011年

4 蔣瑩;程華;張麗;艾厚喜;王文;;經(jīng)典Wnt信號(hào)通路抑制劑[A];中國(guó)藥理學(xué)會(huì)補(bǔ)益藥藥理專(zhuān)業(yè)委員會(huì)成立大會(huì)暨人參及補(bǔ)益藥學(xué)術(shù)研討會(huì)會(huì)議論文集[C];2011年

5 李艷菲;艾厚喜;孫芳玲;張麗;蔣瑩;王文;;Wnt信號(hào)通路研究新進(jìn)展[A];2013年中國(guó)藥學(xué)大會(huì)暨第十三屆中國(guó)藥師周論文集[C];2013年

6 李艷菲;艾厚喜;孫芳玲;張麗;蔣瑩;王文;;Wnt信號(hào)通路研究新進(jìn)展[A];2013年全國(guó)老年性癡呆與相關(guān)疾病學(xué)術(shù)會(huì)議論文匯編[C];2013年

7 李艷菲;艾厚喜;孫芳玲;張麗;蔣瑩;王文;;Wnt信號(hào)通路研究新進(jìn)展[A];第三屆中國(guó)藥理學(xué)會(huì)補(bǔ)益藥藥理專(zhuān)業(yè)委員會(huì)學(xué)術(shù)研討會(huì)論文集[C];2013年

8 季宇彬;胡哲清;鄒翔;;MAPK信號(hào)通路及其研究進(jìn)展[A];轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)研討會(huì)論文集[C];2010年

9 程華;孫芳玲;艾厚喜;張麗;蔣瑩;王文;;Wnt信號(hào)通路與血管發(fā)生[A];全國(guó)第三次麻醉藥理學(xué)術(shù)會(huì)議論文集[C];2012年

10 李林;;利用小分子探針研究經(jīng)典Wnt信號(hào)通路的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)機(jī)制[A];中國(guó)生物化學(xué)與分子生物學(xué)會(huì)第十一次會(huì)員代表大會(huì)暨2014年全國(guó)學(xué)術(shù)會(huì)議論文集——專(zhuān)題報(bào)告七[C];2014年

中國(guó)重要報(bào)紙全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前6條

1 劉海英;美發(fā)現(xiàn)兩種細(xì)胞信號(hào)通路互動(dòng)機(jī)制[N];科技日?qǐng)?bào);2009年

2 記者 劉海英;英發(fā)現(xiàn)細(xì)胞信號(hào)通路新“剎車(chē)”蛋白[N];科技日?qǐng)?bào);2012年

3 衣曉峰　陳英云 記者 李麗云;結(jié)腸癌發(fā)生中新的信號(hào)通路找到[N];科技日?qǐng)?bào);2009年

4 記者 許琦敏;減肥信號(hào)受控于腦中“通訊員”[N];文匯報(bào);2008年

5 記者 劉海英;一種蛋白決定人的抗壓能力[N];科技日?qǐng)?bào);2011年

6 通訊員 喬蕤琳 記者 衣曉峰 聶松義;癌癥中小分子和微小核苷酸有關(guān)聯(lián)[N];健康報(bào);2012年

中國(guó)博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

1 王森;乙型肝炎病毒表面抗原抑制TLR2和TLR4信號(hào)通路的機(jī)制研究[D];復(fù)旦大學(xué);2014年

2 尚果果;NRF2抗氧化應(yīng)激信號(hào)通路的活化在糖尿病腎病中的保護(hù)作用及其機(jī)制研究[D];復(fù)旦大學(xué);2014年

3 孫鼎琪;Akt信號(hào)通路在膀胱腫瘤的進(jìn)展及化療敏感性的實(shí)驗(yàn)研究[D];山東大學(xué);2015年

4 白秀峰;新基因Gsdma3對(duì)小鼠毛囊周期及Wnt/β-catenin信號(hào)通路作用的研究[D];第三軍醫(yī)大學(xué);2015年

5 張俊波;PI3K/Akt信號(hào)通路調(diào)控胞內(nèi)布魯氏菌16M存活的分子機(jī)制研究[D];石河子大學(xué);2014年

6 成旭東;黃芪活性物質(zhì)篩選及基于PKC-ERK信號(hào)通路抑制肺癌的作用機(jī)理研究[D];南京中醫(yī)藥大學(xué);2015年

7 路康;STAT3信號(hào)通路介導(dǎo)CLL和MCL發(fā)生組蛋白去乙�；敢种苿┠退幍臋C(jī)制研究[D];山東大學(xué);2015年

8 趙睿;Wnt信號(hào)通路在臂叢神經(jīng)根性撕脫傷誘發(fā)的神經(jīng)病理性痛中的作用機(jī)制研究[D];第四軍醫(yī)大學(xué);2015年

9 劉海燕;Sonic hedgehog信號(hào)通路對(duì)正常角質(zhì)形成細(xì)胞增殖及凋亡的影響及其分子機(jī)制[D];第四軍醫(yī)大學(xué);2015年

10 祁義軍;胃腸道間質(zhì)瘤中Shh信號(hào)通路作用的實(shí)驗(yàn)研究[D];安徽醫(yī)科大學(xué);2015年

中國(guó)碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

1 韓紹芳;小鼠主要嗅覺(jué)表皮組織內(nèi)AC3缺失對(duì)相關(guān)因子及信號(hào)通路的影響[D];河北大學(xué);2015年

2 李玉娟;Hedgehog信號(hào)通路在大鼠急性胰腺炎中的作用及其對(duì)TNF-α、IL-10的影響[D];河北醫(yī)科大學(xué);2015年

3 趙玲玲;FLCN與PAT1相互作用調(diào)控mTORC1信號(hào)通路的機(jī)理研究[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2015年

4 努爾古麗·蘇里坦;mir-260和mir-240調(diào)控錢(qián)蟲(chóng)壽命的研究[D];華中師范大學(xué);2015年

5 王瑜;晚期糖基化終末產(chǎn)物和骨髓間充質(zhì)干細(xì)胞對(duì)血管內(nèi)皮細(xì)胞VEGF信號(hào)通路的影響及其機(jī)制探討[D];河北醫(yī)科大學(xué);2015年

6 楊瑩瑩;microRNA-203通過(guò)APC介導(dǎo)活化Wnt/β-catenin信號(hào)通路在佐劑性關(guān)節(jié)炎大鼠成纖維樣滑膜細(xì)胞中的調(diào)控作用及機(jī)制研究[D];安徽醫(yī)科大學(xué);2015年

7 徐貞貞;PM2.5對(duì)人支氣管上皮細(xì)胞JAK/STAT信號(hào)通路的影響[D];山西醫(yī)科大學(xué);2015年

8 徐國(guó)棟;芪蛭皺肺顆粒調(diào)控肺泡Ⅱ型上皮細(xì)胞NF-κB信號(hào)通路的研究[D];甘肅中醫(yī)藥大學(xué)(原名：甘肅中醫(yī)學(xué)院);2015年

9 陸兆雙;多聚左旋精氨酸促進(jìn)LPS誘導(dǎo)的NCI-H292細(xì)胞釋放炎癥因子IL-6、IL-8的信號(hào)通路研究[D];安徽醫(yī)科大學(xué);2015年

10 修麗梅;P38MAPK信號(hào)通路在肢體缺血預(yù)處理腦保護(hù)中的作用[D];山西醫(yī)科大學(xué);2015年

，

本文編號(hào)：1277462