CSB遺傳變異與腫瘤發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)及肺癌預(yù)后關(guān)系研究
發(fā)布時(shí)間:2017-12-07 17:14
本文關(guān)鍵詞:CSB遺傳變異與腫瘤發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)及肺癌預(yù)后關(guān)系研究
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【摘要】:目的CSB(Cockayne syndrome type B)是轉(zhuǎn)錄偶聯(lián)核苷酸切除修復(fù)通路的重要組分,在腫瘤發(fā)生發(fā)展過(guò)程中發(fā)揮重要作用。本研究的目的之一在于用Meta分析方法研究CSB單核苷酸多態(tài)(single nucleotide polymorphism,SNPs)與多種腫瘤發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)之間的關(guān)系;目的之二在于分析CSB遺傳變異對(duì)經(jīng)鉑類化療后非小細(xì)胞肺癌患者預(yù)后的影響。方法第一章:我們采用計(jì)算機(jī)配合手工檢索的方式,使用PubMed、Embase、中國(guó)知網(wǎng)等數(shù)據(jù)庫(kù),檢索2015年12月之前證實(shí)發(fā)表的CSB單核苷酸多態(tài)與腫瘤發(fā)病關(guān)系的文獻(xiàn)。使用R 3.1.3軟件進(jìn)行Meta分析,計(jì)算OR(Odds ratios)及其95%CI(confidence interval),并繪制森林圖,用Q統(tǒng)計(jì)量來(lái)評(píng)價(jià)納入的各研究之間的異質(zhì)性。第二章:將238例于2008年3月至2012年12月期間在華北理工大學(xué)附屬唐山市工人醫(yī)院確診為非小細(xì)胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)的患者作為研究對(duì)象。使用人類單體型數(shù)據(jù)庫(kù)提供的基因分型數(shù)據(jù),用軟件Haploview 4.2獲得位于CSB基因的標(biāo)簽SNP(tag SNPs)。采用i Plex Gold Genotyping Assay和Sequenom Mass Array基因分型技術(shù)對(duì)所有目標(biāo)tag SNPs進(jìn)行基因分型。用Kaplan-Meier方法繪制生存曲線,Log-rank法檢驗(yàn)評(píng)價(jià)經(jīng)CSB標(biāo)簽遺傳變異對(duì)NSCLC預(yù)后的影響。Cox多因素回歸模型進(jìn)一步分析經(jīng)鉑類藥物化療后NSCLC患者預(yù)后的影響因素。結(jié)果第一章:經(jīng)檢索最終有26項(xiàng)研究納入本次Meta分析,共包括4個(gè)CSB遺傳變異(rs2228526,rs2228527,rs2228529,rs4253211)。其中,rs2228526多態(tài)研究包括3206名腫瘤患者和3694名正常對(duì)照對(duì)照;rs2228527多態(tài)研究包括4634名腫瘤患者和6063名正常對(duì)照;rs2228529多態(tài)研究包括2467名腫瘤患者和2634名正常對(duì)照;rs4253211多態(tài)研究包括4870名腫瘤患者和6561名正常對(duì)照。我們的Meta分析沒有發(fā)現(xiàn)任何CSB遺傳變異影響腫瘤發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)。第二章:CSB遺傳變異對(duì)肺癌患者生存的影響。使用Haploview軟件篩選了位于CSB基因的9個(gè)tag SNPs(rs2228526,rs2228528,rs2281793,rs3750751,rs4253101,rs2274097,rs2377902,rs4240506,rs4253212)。生存分析發(fā)現(xiàn)男性患者的中位生存時(shí)間(median survival time,MST)為24個(gè)月,明顯低于女性患者(MST=32月)(Log-rank P=0.012)。CSB rs2228526 AA基因型攜帶者的MST為29個(gè)月,明顯高于AG基因型攜帶者(MST為21個(gè)月),兩者之間具有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(Log-rank P=0.002);rs2281793 CC基因型攜帶者的MST為25個(gè)月,TT基因型攜帶者的MST為55個(gè)月,兩者比較具有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(Log-rank P=0.004);rs4253101AA基因型攜帶者的MST(29個(gè)月)低于AC基因型攜帶者(M21個(gè)月),兩者比較有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(Log-rank P=0.002);rs4240506位點(diǎn)AA基因型攜帶者的MST為33個(gè)月,明顯高于AG(24個(gè)月)和GG基因型攜帶者(27個(gè)月)(Log-rank P=0.026,0.042)。Cox多因素回歸分析顯示,rs2228526 AG基因型和rs4253101 AC基因型均是影響非小細(xì)胞肺癌預(yù)后的獨(dú)立影響因素(HR=1.86,95%CI=1.16-2.99,P=0.011)。結(jié)論CSB rs2228526和rs4253101遺傳變異可影響NSCLC患者接受鉑類化療生存時(shí)間,可能為NSCLC患者鉑類化療后個(gè)體化用藥的選擇提供理論依據(jù)。
【學(xué)位授予單位】:華北理工大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號(hào)】:R734.2
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本文編號(hào):1263139
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