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基于代謝組學(xué)尋找食管癌生物標志物以及肺癌的耐藥生物標志物研究

發(fā)布時間:2017-11-10 05:13

  本文關(guān)鍵詞:基于代謝組學(xué)尋找食管癌生物標志物以及肺癌的耐藥生物標志物研究


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【摘要】:代謝組學(xué)是研究一個生物系統(tǒng)中所有代謝物的含量以及代謝物對外因內(nèi)因刺激產(chǎn)生的變化的科學(xué)。代謝組學(xué)主要有三種檢測方式,包括核磁共振、氣質(zhì)聯(lián)用和液質(zhì)聯(lián)用。相比基因組、蛋白組等其他組學(xué),代謝組學(xué)檢測的代謝物更加適用于臨床。癌癥是一種致死率很高的疾病。癌癥細胞由于需要大量繁殖,需要改變細胞體內(nèi)的代謝模式來產(chǎn)生大量的能量和物質(zhì)來滿足大量繁殖的需求。所以癌癥是一種和代謝密切相關(guān)的疾病,使用代謝組學(xué)來研究癌癥具有很大的優(yōu)勢。代謝組在癌癥研究中的研究包括:臨床診斷研究、癌癥代謝機理研究、癌癥藥物作用機理研究等。本論文包括兩個課題:課題一是尋找和食管癌相關(guān)的臨床生物標志物,食管癌在中國以及亞洲地區(qū)具有較大的患病率,然而目前的臨床診斷方法并不是很靈敏或者會對身體產(chǎn)生一定的創(chuàng)傷。本課題試圖使用代謝組的方法來尋找和食管癌相關(guān)的代謝物生物標志物,找到一種新的食管癌的臨床診斷方法。課題一使用以核磁共振的代謝組檢測方法比較了51名食管癌患者和50名正常人的血清樣本中代謝物的不同,使用主成分分析、最小二乘法得到了和食管癌相關(guān)的代謝組指紋圖譜,使用人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)找到了代謝物脯氨酸和谷氨酰胺為最后找到的和食管癌相關(guān)的生物標志物,并使用聚類分析對這兩個生物標志物進行驗證,最后對這兩個代謝物進行了含量上的對比,發(fā)現(xiàn)脯氨酸和谷氨酰胺在食管癌患者的血清中的含量都比正常人低。課題二是尋找和肺癌耐藥相關(guān)的臨床生物標志物,肺癌在全球都具有很高的患病率和死亡率。治療肺癌的方法主要包括化療、放療、化療和放療結(jié)合和手術(shù)等。在化療中使用的藥物經(jīng)常會產(chǎn)生耐藥性,包括原發(fā)性耐藥和繼發(fā)性耐藥,這兩種耐藥性會對患者產(chǎn)生較大的危害,提前預(yù)測患者是否會耐藥會減輕患者的治療成本并對患者進行個體化治療,本課題試圖用代謝組的方法來尋找和肺癌相關(guān)的代謝生物標志物。課題二使用以液質(zhì)聯(lián)用的代謝組檢測方法檢測了136個血清樣本中代謝物,其中56個患者具有原發(fā)耐藥,80個沒有原發(fā)耐藥;44個患者具有繼發(fā)性耐藥,92個沒有繼發(fā)耐藥。對原發(fā)性耐藥和繼發(fā)性耐藥兩組進行代謝組分析,通過最小二乘法找到了和原發(fā)耐藥以及繼發(fā)耐藥相關(guān)的代謝物指紋圖譜,通過P值、Fold-Change值以及AUC值尋找原發(fā)耐藥和繼發(fā)耐藥相關(guān)的生物標志物,在原發(fā)耐藥中發(fā)現(xiàn)了4個生物標志物,在繼發(fā)耐藥中發(fā)現(xiàn)了8個生物標志物,基本上為脂質(zhì)類、磷脂類和固醇類的代謝物。并使用ROC曲線驗證了這12個生物標志物預(yù)測耐藥效果,發(fā)現(xiàn)原發(fā)性耐藥的預(yù)測效果AUC為0.818,繼發(fā)性耐藥的預(yù)測效果AUC為0.793,預(yù)測效果都比較好。最后比較了這12個生物標志物在耐藥組和非耐藥組的含量大小。
【學(xué)位授予單位】:北京化工大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號】:R735.1;R734.2

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6 馬t,

本文編號:1165213


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