深度卷積網(wǎng)絡(luò)及其在乳腺病理圖像分析中的應(yīng)用
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【摘要】:在乳腺癌病理診斷與預(yù)后中,改進(jìn)的B loom-Richardson病理分級(jí)系統(tǒng)與細(xì)胞核的形態(tài)和拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)特征密切相關(guān),因此,病理圖像中準(zhǔn)確、快速的細(xì)胞核自動(dòng)檢測(cè)和分割是乳腺癌計(jì)算機(jī)輔助診斷與預(yù)后系統(tǒng)的重要基礎(chǔ)。但是由于病理組織染色方法的多樣性、圖像場(chǎng)景與病理標(biāo)志物高度復(fù)雜性、成像方法的差異性以及成像儀器的多樣性等因素,導(dǎo)致大部分細(xì)胞核都呈現(xiàn)出高度復(fù)雜的形狀和結(jié)構(gòu)特性,比如顏色的不均勻性、細(xì)胞的重疊性、多個(gè)細(xì)胞的高度凝聚性等。因而,病理圖像細(xì)胞核的自動(dòng)檢測(cè)和分割成為醫(yī)學(xué)圖像處理領(lǐng)域中一項(xiàng)非常具有挑戰(zhàn)性的任務(wù)。針對(duì)這一問題,本文提出了基于卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(CNN)初始化的局部區(qū)域活動(dòng)邊界模型(CNNiLRAC)進(jìn)行細(xì)胞檢測(cè)和分割,這一模型有效地結(jié)合兩個(gè)模塊:卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的細(xì)胞檢測(cè)模塊和局部區(qū)域活動(dòng)邊界模型(LRAC)的細(xì)胞分割模塊。第一個(gè)模塊中,本文使用由稀疏自編碼(SAE)初始化的CNN并結(jié)合滑動(dòng)窗口技術(shù),在高分辨率病理圖像中自動(dòng)檢測(cè)細(xì)胞;第二個(gè)模塊中,在細(xì)胞檢測(cè)的基礎(chǔ)上利用局部自適應(yīng)閾值的方法生成初始輪廓,然后再使用由局部高斯分布驅(qū)動(dòng)的LRAC模型進(jìn)行細(xì)胞分割。本文提出的算法在三個(gè)病理圖像數(shù)據(jù)集上進(jìn)行了實(shí)驗(yàn)評(píng)估。分別與藍(lán)色比例閾值(BR),迭代徑向選舉(IRV)和最大穩(wěn)定極值區(qū)域(MSER)三種方法進(jìn)行比較,結(jié)果表明,本文提出的CNNiLRAC模型能夠準(zhǔn)確地檢測(cè)細(xì)胞并且精確地分割細(xì)胞邊界。本文提出的模型在三個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)上的檢測(cè)準(zhǔn)確率分別為F-measure:80%、86%、80%, Precision-Recall曲線中的AveP:77%、82%、74%;在其中兩個(gè)有分割標(biāo)準(zhǔn)的數(shù)據(jù)庫(kù)中得到的分割準(zhǔn)確率分別為PPV:85%、89%。在深度卷積網(wǎng)絡(luò)模型方面,本文基于傳統(tǒng)卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(TCNN, Traditional CNN)提出一種快速有效的多級(jí)金字塔卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)MLPCNN (Multi-level pyramid CNN)模型,該模型避免了在大尺度圖像中卷積濾波速度過慢、CNN參數(shù)調(diào)節(jié)困難、訓(xùn)練時(shí)間過長(zhǎng)的問題。這一網(wǎng)絡(luò)使用權(quán)值共享的方法將低級(jí)的濾波權(quán)值共享到高級(jí),保證CNN的訓(xùn)練只在較小尺寸的圖像塊上進(jìn)行,加快訓(xùn)練速度。實(shí)驗(yàn)表明,在特征維數(shù)比較低的情況下,MLPCNN提取到的特征比傳統(tǒng)的特征提取方法更加有效。
【學(xué)位授予單位】:南京信息工程大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號(hào)】:R737.9;TP391.41
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,本文編號(hào):1150657
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