本文關(guān)鍵詞：胃癌組織的DNA甲基化和基因表達(dá)研究

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【摘要】：鑒于目前胃癌DNA甲基化的研究多集中于單個或幾個基因,且DNA甲基化在胃癌發(fā)生、發(fā)展和浸潤轉(zhuǎn)移過程中的作用尚不明確。因此,運用高通量甲基化芯片明確DNA甲基化和其表達(dá)與胃癌組織學(xué)類型、腫瘤的部位、浸潤深度、淋巴結(jié)和腹膜轉(zhuǎn)移及預(yù)后的關(guān)系,具有重要意義。通過GO分類注釋以及KEGG PATHYWAY注釋分析后,能為建立胃癌DNA甲基化譜,探索胃癌發(fā)生、發(fā)展的表觀遺傳性機(jī)制,并擬建立胃癌分子分期及判斷預(yù)后的分子標(biāo)記物群,并針對靶分子設(shè)計干預(yù)措施,為胃癌的治療開辟新的路徑。本課題應(yīng)用DNA甲基化芯片檢測胃癌及其癌旁正常組織基因組甲基化情況,并利用軟件對篩選基因進(jìn)行功能分析,探討胃癌的發(fā)生發(fā)展及預(yù)后的分子機(jī)制。實驗方法:采用甲基化DNA免疫沉淀方法(Methylated DNA immunoprecipitation,MeDIP)結(jié)合NibleGen公司DNA甲基化芯片對胃癌及其癌旁組織進(jìn)行甲基化基因篩選,通過分析軟件對基因進(jìn)行GO(Gene Ontology)和KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)pathway注釋分析。結(jié)果顯示:1.甲基化差異基因:(1)基因啟動子區(qū):存在于胃癌組織中的甲基化差異基因為113個,如SHP1、FGF8、CSF2RA;胃癌組織中以1號和4號染色體甲基化差異基因最多,均為11個。18號和20號染色體甲基化差異基因最少,均為1個;存在于配對癌旁正常組織甲基化差異基因為161個,如:TNF、IGF2、BMP7。配對癌旁正常組織中以11號染色體甲基化差異基因最多,為17個;其次,以9號、19號和20號染色體甲基化差異基因較多,均為11個,Y染色體甲基化差異基因最少,為0個。(2)CpG島:存在于胃癌組織中的甲基化差異基因為123個。如:WNT2B、JAK2、TPT1;存在于癌旁組織甲基化差異基因為139個,如:TNFRSF4、HOXC8、NFYA。2.甲基化差異基因的功能分類:(1)GO分析軟件將功能相同的基因進(jìn)行了分類,組成了不同的基因群:①蛋白磷酸化相關(guān)基因;②調(diào)節(jié)細(xì)胞分解代謝相關(guān)基因;③離子轉(zhuǎn)運相關(guān)基因;④酶活性調(diào)節(jié)相關(guān)基因;⑤轉(zhuǎn)錄調(diào)控相關(guān)基因;⑥代謝相關(guān)基因;⑦細(xì)胞分裂相關(guān)基因;⑧細(xì)胞周期調(diào)節(jié)相關(guān)基因;⑨信號轉(zhuǎn)導(dǎo)相關(guān)基因等。(2)通路分析顯示DNA甲基化差異基因主要參與了腫瘤的發(fā)生、凋亡、機(jī)體免疫、氨基酸代謝等,例如:癌癥通路、JAK-STAT信號通路、細(xì)胞凋亡、卵母細(xì)胞減數(shù)分裂、色氨酸代謝、鈣離子信號通路、趨化因子信號通路、TGF-β信號通路、FcγR介導(dǎo)的吞噬作用等。研究結(jié)果表明,胃癌組織及其配對癌旁正常組織基因組DNA甲基化情況存在顯著差異。DNA甲基化基因分布在不同染色體上,其個數(shù)和分布差異很大�；蚪MDNA甲基化差異基因與胃癌的發(fā)生、發(fā)展具有相關(guān)性。
【關(guān)鍵詞】：DNA甲基化 胃癌 基因芯片 表觀遺傳學(xué)
【學(xué)位授予單位】：河北北方學(xué)院
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2015
【分類號】：R735.2
【目錄】：

• 摘要5-7
• ABSTRACT7-9
• 英文縮寫9-10
• 前言10-13
• 材料與方法13-18
• 結(jié)果18-22
• 附圖22-26
• 附表26-41
• 討論41-45
• 結(jié)論45-46
• 參考文獻(xiàn)46-51
• 綜述 DNA甲基化在胃癌的研究進(jìn)展51-60
• 參考文獻(xiàn)57-60
• 致謝60-61
• 個人簡歷61-62

【參考文獻(xiàn)】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前1條

1 ;Microarray-based method for detecting methylation changes of p16~(Ink4a) gene 5'-CpG islands in gastric carcinomas[J];World Journal of Gastroenterology;2004年24期

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本文編號：1131653