本文關(guān)鍵詞：U2依賴型mRNA剪接復(fù)合體相關(guān)基因多態(tài)與原發(fā)性肝癌發(fā)生風(fēng)險的關(guān)聯(lián)研究

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【摘要】：背景：原發(fā)性肝癌(Primary liver cancer, PLC,以下簡稱肝癌)病死率高,目前居于全球癌癥死因第三位,肝癌在我國發(fā)病人數(shù)占全球發(fā)病人數(shù)的半數(shù)以上。肝癌發(fā)病隱匿,一旦發(fā)現(xiàn)往往預(yù)后很差。因此,探討其危險因素并進行有針對性的預(yù)防是減少肝癌人群健康危害的關(guān)鍵。在癌癥發(fā)生的遺傳和環(huán)境因素研究中,目前nRNA剪接復(fù)合體相關(guān)基因突變與腫瘤的關(guān)系備受關(guān)注。mRNA選擇性剪接影響著人類90%以上的基因表達,這個途徑一旦發(fā)生異常,則可能影響包括細胞增殖、發(fā)育與分化等環(huán)節(jié)的多個基因的正常剪接過程,導(dǎo)致腫瘤發(fā)生。2011年以來,Nature、Cell等雜志先后報道剪接復(fù)合體基因突變,尤其是U2核糖核蛋白體依賴型剪接復(fù)合體相關(guān)基因(包括U2AF35、U2AF65、SF1、SRSF1、SF3A1、SF3B1和PRPF40B等)突變與血液腫瘤如慢性髓細胞性白血病以及實體瘤如胰腺癌、乳腺癌以及黑色素瘤等發(fā)生有關(guān),我們課題組的前期研究也發(fā)現(xiàn)U2AF65的基因多態(tài)與胰腺癌的發(fā)生有關(guān),但上述基因與肝癌發(fā)生風(fēng)險關(guān)聯(lián)尚未見報道。目的：1、探討U2依賴型mRNA剪接復(fù)合體的關(guān)鍵基因U2AF35.U2AF65、SRSF1、SRSF2、 SF3B1、SF3A1、SFl和PRPF40B與肝癌發(fā)生風(fēng)險的關(guān)系。2、分析上述基因與已報告的肝癌主要環(huán)境危險因素的交互作用對肝癌發(fā)生風(fēng)險的影響。方法：采用以醫(yī)院為基礎(chǔ)的兩階段病例-對照研究方法：1、篩查階段：選擇2009年5月至2012年6月武漢同濟醫(yī)院首次確診的378例原發(fā)性肝癌病例和461例同期成人體檢非腫瘤對照。采用Openarray中通量分型技術(shù)在篩查樣本中對U2依賴型mRNA剪接復(fù)合體的關(guān)鍵基因U2AF35、U2AF65、 SRSF1、SRSF2、SF3B1、SF3A1、SF1和PRPF40的17個潛在功能標(biāo)簽單核苷酸多態(tài)性(Single nucleotide polymorphism,SNP)位點進行基因分型；基于不同遺傳模型分析上述候選SNPs與肝癌的關(guān)聯(lián)性,并探討其與吸煙、飲酒以及HBV慢性感染的交互作用。2、驗證階段：選擇2007年9月至2009年9月北京佑安醫(yī)院首次確診的428例原發(fā)性肝癌病例和647例同期體檢的非腫瘤對照,對篩查階段得到的陽性位點采用TaqMan實時熒光定量基因分型技術(shù)進行基因分型；同時探討基因與肝癌的關(guān)聯(lián),以及基因與環(huán)境交互作用的影響。結(jié)果：1、篩查樣本中觀察到SF3A1基因的四個TagSNPs位點rs2074733、rs5994293、rs7288947和rs9608886與肝癌發(fā)病風(fēng)險存在顯著關(guān)聯(lián)：以攜帶rs2074733-CC基因型者為參照,攜帶rs2074733-T等位基因者的肝癌發(fā)病風(fēng)險降低,OR值為0.36(95%CI：0.25-0.53)；以攜帶rs5994293-TT基因型者為參照,攜帶rs5994293-G等位基因者的肝癌發(fā)病風(fēng)險降低,OR值為0.42(95%CI：0.29-0.61)；以攜帶rs7288947-CC基因型者為參照,攜帶rs7288947-T等位基因者的肝癌發(fā)病風(fēng)險降低,OR值為0.54(95%CI：0.41-0.72)和以攜帶rs9608886-TT基因型者為參照,攜帶rs9608886-G等位基因者的肝癌發(fā)病風(fēng)險降低,OR值為0.17(95%CI：0.10-0.31)。2、將上述四個位點在驗證樣本中進行驗證后發(fā)現(xiàn),SF3A1基因的rs5994293位點與肝癌發(fā)病風(fēng)險仍舊存在關(guān)聯(lián)。以攜帶TT基因型者為參照,攜帶G等位基因者的肝癌發(fā)病風(fēng)險降低34%(95%CI：0.44-0.99,P=0.042),但P值經(jīng)FDR校正后無統(tǒng)計學(xué)差異。3、對兩個階段樣本均發(fā)現(xiàn)存在強連鎖不平衡的SF3A1基因rs7288947-rs5994293進行單體型分析,兩個階段樣本中CG單體型均與肝癌發(fā)生風(fēng)險有關(guān)。合并樣本中以攜帶CT單體型的個體為參照,攜帶CG單體型肝癌發(fā)病風(fēng)險降低到0.67(95%CI：0.55-0.82；P=0.0001)。4、環(huán)境變量單因素分析結(jié)果顯示,在兩階段研究樣本中HBsAg陽性為肝癌的危險因素,合并樣本的OR值為50.70(95%CI：37.08-69.31,P=1.16E-133)；吸煙在篩查階段樣本中是肝癌發(fā)病的危險因素(OR=1.65；95%CI: 1.06-2.56,P=0.027),合并樣本中吸煙者肝癌發(fā)病風(fēng)險是非吸煙者的1.36倍(95%CI：0.99-1.87,P=0.057)。5、環(huán)境-環(huán)境、基因-環(huán)境交互作用結(jié)果顯示：在兩階段研究樣本中,觀察到HBsAg與吸煙、飲酒存在加法交互作用,合并樣本中HBsAg陽性與吸煙、飲酒的加法交互協(xié)同指數(shù)SI分別為2.12(95%CI：1.59-2.65)、1.83(95%CI：1.26-2.40)；在合并樣本中,觀察到HBsAg陰性者中合并吸煙飲酒和SF3A1-rs5994293 TT基因型之間存在加法交互作用,加法交互協(xié)同指數(shù)SI為2.27(95%CI：1.43-3.12)。但在HBsAg陽性者中并沒有觀察到上述加法交互作用。結(jié)論：攜帶SF3A1-rs5994293-TT基因型可能增加肝癌的發(fā)生風(fēng)險；在非HBV感染者中攜帶該基因型者,同時合并吸煙飲酒可增加肝癌的發(fā)生風(fēng)險,但仍需大樣本研究及功能研究的驗證。
【關(guān)鍵詞】：肝癌 U2依賴型mRNA剪接復(fù)合體 基因多態(tài) 交互作用
【學(xué)位授予單位】：北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2015
【分類號】：R735.7
【目錄】：

• 摘要4-6
• Abstract6-8
• 前言8-13
• 一、肝癌流行病學(xué)8
• 二、肝癌危險因素8-13
• 材料與方法13-26
• 一、主要實驗儀器13
• 二、主要實驗試劑和耗材13
• 三、研究設(shè)計及研究對象13-14
• 四、基因組DNA的提取14-15
• 五、候選SNP挑選15-19
• 六、基因分型19-23
• 七、統(tǒng)計分析23-26
• 結(jié)果26-49
• 一、研究對象人口學(xué)特征26-30
• 二、篩查階段剪接復(fù)合體關(guān)鍵基因多態(tài)與肝癌關(guān)聯(lián)性分析30-37
• 三、驗證階段驗證剪接復(fù)合體關(guān)鍵基因多態(tài)與肝癌的關(guān)聯(lián)性37-38
• 四、合并階段剪接復(fù)合體關(guān)鍵基因多態(tài)與肝癌的關(guān)聯(lián)性38-41
• 五、單體型與肝癌發(fā)病風(fēng)險的關(guān)聯(lián)分析41-43
• 六、基因-環(huán)境、環(huán)境-環(huán)境交互作用分析43-49
• 討論49-53
• 一、遺傳因素49-50
• 二、環(huán)境因素50-51
• 三、交互作用51
• 四、本研究的優(yōu)勢與不足51-53
• 小結(jié)53
• 結(jié)論53-54
• 參考文獻54-58
• 附錄58-61
• 附錄一 論文縮寫詞匯中英文對照表58-60
• 附錄二 個人簡歷60-61
• 致謝61-62

【參考文獻】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前4條

1 葉家才;崔書中;巴明臣;;原發(fā)性肝癌的流行病學(xué)特征及其危險因素[J];實用醫(yī)學(xué)雜志;2008年10期

2 章國衛(wèi),宋懷東,陳竺;mRNA選擇性剪接的分子機制[J];遺傳學(xué)報;2004年01期

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本文編號：1019640