石墨烯量子點穩(wěn)定和誘導(dǎo)i-motif DNA結(jié)構(gòu)的形成
本文關(guān)鍵詞:石墨烯量子點穩(wěn)定和誘導(dǎo)i-motif DNA結(jié)構(gòu)的形成,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
【摘要】:人端粒DNA富含胞嘧啶序列的單鏈能夠形成四鏈體i-motif的結(jié)構(gòu)。大約40%的所有基因的調(diào)控區(qū)或其附近區(qū)域都發(fā)現(xiàn)有i-motif結(jié)構(gòu),特別是在原癌基因的啟動子區(qū)域,如血管內(nèi)皮生長因子VEGF、原癌基因c-Myc以及成視網(wǎng)膜細胞瘤基因Rb等都能形成i-motif結(jié)構(gòu)。因此i-motif結(jié)構(gòu)成為基因調(diào)控和抗癌藥物設(shè)計的靶點,調(diào)控i-motif結(jié)構(gòu)也因此而具有非常重要的研究價值。 本論文主要研究石墨烯量子點(GQDs)調(diào)控四鏈體DNA i-motif結(jié)構(gòu)。研究發(fā)現(xiàn)GQDs在酸性條件下可以穩(wěn)定i-motif結(jié)構(gòu),而在堿性或中性條件下GQDs可以誘導(dǎo)i-motif結(jié)構(gòu)的形成。利用圓二色光譜、熒光、熱變性曲線、定點突變等研究方法,我們發(fā)現(xiàn)GQDs與i-motif結(jié)構(gòu)的loop區(qū)域的堿基通過π-π堆積作用而結(jié)合,這種相互作用使得i-motif與溶液接觸面減小,從而提高了它在水溶液中的穩(wěn)定性。同樣通過這種作用,在中性或堿性條件下,GQDs使得隨機無序單鏈結(jié)構(gòu)和i-motif結(jié)構(gòu)之間的平衡發(fā)生偏移,更多的隨機無序單鏈結(jié)構(gòu)轉(zhuǎn)變?yōu)閕-motif結(jié)構(gòu),從而誘導(dǎo)隨機無序單鏈結(jié)構(gòu)形成i-motif結(jié)構(gòu)。GQDs誘導(dǎo)i-motif結(jié)構(gòu)的形成以及對i-motif結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定作用使其在基因調(diào)控和化學(xué)治療藥物方面具有廣泛的應(yīng)用前景。
【關(guān)鍵詞】:石墨烯量子點 i-motif結(jié)構(gòu) 穩(wěn)定 誘導(dǎo)
【學(xué)位授予單位】:華東理工大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2013
【分類號】:R914
【目錄】:
- 摘要5-6
- Abstract6-9
- 第1章 前言9-25
- 1.1 端粒和端粒酶9-11
- 1.2 四鏈體DNA的結(jié)構(gòu)11-16
- 1.2.1 G-四鏈體DNA的基本結(jié)構(gòu)11-13
- 1.2.2 i-Motif DNA的基本結(jié)構(gòu)13-14
- 1.2.3 基于四鏈體DNA結(jié)構(gòu)為靶點的抗癌藥物14-16
- 1.3 小分子與四鏈體DNA的作用方式16-19
- 1.4 研究小分子與四鏈體DNA相互作用的方法19-23
- 1.4.1 熱變性曲線19-20
- 1.4.2 熒光光譜20-21
- 1.4.3 圓二色光譜21
- 1.4.4 聚丙烯酰胺凝膠電泳21
- 1.4.5 核磁共振21-22
- 1.4.6 選擇性透析22-23
- 1.5 石墨烯量子點(Graphene Quantum Dots,GQDs)23-24
- 1.6 本論文的研究思路24-25
- 第2章 石墨烯量子點誘導(dǎo)i-motif結(jié)構(gòu)的形成25-35
- 2.1 實驗內(nèi)容25-27
- 2.1.1 實驗材料25-26
- 2.1.2 溶液配制26
- 2.1.3 實驗方法26-27
- 2.2 結(jié)果與討論27-34
- 2.2.1 石墨烯量子點(GQDs)材料的表征27-28
- 2.2.2 不同pH條件下d22CT的結(jié)構(gòu)特征28-30
- 2.2.3 通過圓二色光譜研究GQDs誘導(dǎo)i-motif結(jié)構(gòu)的形成30-32
- 2.2.4 通過熱變性曲線研究GQDs誘導(dǎo)i-motif結(jié)構(gòu)的形成32-34
- 2.3 本章小結(jié)34-35
- 第3章 石墨烯量子點對i-motif結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定作用35-46
- 3.1 實驗內(nèi)容35-39
- 3.1.1 實驗材料35-36
- 3.1.2 溶液配制36-37
- 3.1.3 實驗方法37-39
- 3.2 結(jié)果與討論39-45
- 3.2.1 GQDs對G-四鏈體和i-motif結(jié)構(gòu)的影響39
- 3.2.2 GQDs對四鏈體DNA穩(wěn)定性的影響39-41
- 3.2.3 熒光檢測GQDs對雙鏈形成的影響41-44
- 3.2.4 凝膠電泳檢測GQDs對雙鏈形成的影響44-45
- 3.3 本章小結(jié)45-46
- 第4章 石墨烯量子點與i-motif作用機理研究46-56
- 4.1 實驗內(nèi)容46-48
- 4.1.1 實驗材料46
- 4.1.2 實驗方法46-48
- 4.2 結(jié)果和討論48-55
- 4.2.1 GQDs與i-motif結(jié)構(gòu)的結(jié)合能力48-49
- 4.2.2 2-氨基嘌呤取代腺嘌呤對于i-motif結(jié)構(gòu)的影響49-50
- 4.2.3 石墨烯量子點與i-motif作用位點研究50-52
- 4.2.4 石墨烯量子點與i-motif作用機理研究52-55
- 4.3 本章小結(jié)55-56
- 結(jié)論與展望56-57
- 參考文獻57-63
- 實驗儀器一覽表63-64
- 碩士期間發(fā)表論文64-65
- 致謝65
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本文編號:359216
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