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第25卷第4期
分析科學(xué)學(xué)報(bào)
2009年8月
V01.25No.4
ANAI。YTICAI。SCIENCE
2009
J URNAI。OF
Aug.
文章編號(hào):1006―6144 2009 04―0473―05
分子對(duì)接方法的應(yīng)用與發(fā)展
段愛霞,陳 晶,劉宏德,宴0秀輝,盧小泉’
西北師范大學(xué)化學(xué)化工學(xué)院,甘肅蘭州730070
摘 要:分子對(duì)接方法加快了藥物開發(fā)周期,具有快速、準(zhǔn)確度高等優(yōu)點(diǎn)。本文詳述了
分子對(duì)接方法的基本原理,及分子對(duì)接空問和能量的匹配要求和優(yōu)化時(shí)的各種方法。
綜述了該方法在藥物設(shè)計(jì)、藥理分析和探測(cè)生命體系等方面的應(yīng)用。
關(guān)鍵詞:分子對(duì)接;蛋白質(zhì);抑制劑;藥物設(shè)計(jì)
中圖分類號(hào):0657 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:A
1 引言
分子對(duì)接方法 MolecularDockingMethod 已成為藥物設(shè)計(jì)方法中比較成熟的直接藥物設(shè)計(jì)方法。
從已知結(jié)構(gòu)的受體 靶蛋白或活性位點(diǎn) 和配體出發(fā),,通過化學(xué)計(jì)量學(xué)方法模擬分子的幾何結(jié)構(gòu)和分子間
作用力來進(jìn)行分子問相互作用識(shí)別并預(yù)測(cè)受體一配體復(fù)合物結(jié)構(gòu)的方法稱為分子對(duì)接。準(zhǔn)確預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)
復(fù)合物的結(jié)構(gòu)和結(jié)合位點(diǎn)在藥物設(shè)計(jì)中顯得非常重要[1]。
分子對(duì)接方法最初是科學(xué)家在分子水平上研究生物體系中的化學(xué)問題時(shí)提出的。早在1894年,E.
的受體學(xué)說認(rèn)為大多數(shù)藥物與細(xì)胞膜上或細(xì)胞內(nèi)某些特定分子結(jié)合,才能發(fā)生效應(yīng),這些特定的分子被稱
為受體。所以,受體學(xué)說中的受體與分子對(duì)接中的受體概念是基本相同的,為分子對(duì)接方法奠定了理論基
礎(chǔ)。高通量虛擬篩選技術(shù) 并行化的分子對(duì)接方法 篩選量大,每天可完
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