人血中隨齡變化circRNA的篩選與鑒定
發(fā)布時間:2021-02-25 13:15
研究背景:法醫(yī)學(xué)年齡推斷在法醫(yī)案件偵破中具有重要意義。隨著分子生物學(xué)的發(fā)展,一系列衰老相關(guān)的生物標(biāo)記被發(fā)現(xiàn),并被嘗試作為法醫(yī)年齡推斷候選標(biāo)記。然而基于這些標(biāo)記的年齡推斷都不同程度的存在推斷精度差、可重復(fù)性差、適用對象受限等問題,致使其法醫(yī)學(xué)應(yīng)用價值受限。人體衰老是一種復(fù)雜的生物學(xué)進(jìn)程。采用單一的年齡推斷指標(biāo)進(jìn)行準(zhǔn)確的年齡推斷絕非易事,需要借助大數(shù)據(jù)平臺,引入多種年齡推斷指標(biāo)進(jìn)行聯(lián)合多因素分析,所以繼續(xù)尋找穩(wěn)定性好、適用范圍廣、隨齡變化趨勢明顯的年齡推斷指標(biāo)仍然十分重要。近年研究表明,比m RNA更穩(wěn)定的circ RNA廣泛表達(dá)于人體各種組織中,參與調(diào)控機體的衰老進(jìn)程,其表達(dá)量與年齡具有相關(guān)性。據(jù)此,circ RNA有可能成為一種新的年齡推斷標(biāo)記。年齡相關(guān)的circ RNA標(biāo)記的篩選和鑒定可成為法醫(yī)學(xué)年齡推斷的重要基礎(chǔ)性研究內(nèi)容。目的:在全轉(zhuǎn)錄組范圍內(nèi)篩選和鑒定隨齡變化趨勢明顯的circ RNA標(biāo)記,為法醫(yī)學(xué)年齡推斷提供候選生物標(biāo)記。方法:(1)采集不同年齡段相對健康的個體血液;(2)采用circ RNA芯片檢測青年組、中年組和老年組樣本的circ RNA表達(dá)譜,并通過生物信息學(xué)方法分析...
【文章來源】:華中科技大學(xué)湖北省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:86 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖115個樣本總RNA的人1%甲醛變性瓊脂糖凝膠電泳圖
圖215個樣本的芯片掃描圖
圖 3 15 個樣本芯片原始信號值標(biāo)準(zhǔn)化后的箱線圖NA 芯片數(shù)據(jù)分析間差異比較分別計算兩組之間(中年組與青年組(BvsA)、老年組與中年組與青年組(C vs A)每個 circRNA 的表達(dá)差異倍數(shù)來比的表達(dá)譜的差異。用 t 檢驗計算統(tǒng)計顯著性。將表達(dá)倍數(shù)改于 0.05 的 circRNA 定為存在顯著差異的 circRNA。點圖和火山圖分析組和青年組比較,顯著差異的 circRNA 較少,而且差異倍數(shù)基 4,a 和 b);老年組和中年組比較,顯著下調(diào)的 circRNA 較差異倍數(shù)在 2 倍以上,部分 circRNA 的差異倍數(shù)達(dá)到 3 倍以rcRNA 相對比較少,差異倍數(shù)也基本都在 2 倍以內(nèi)(圖 4,
本文編號:3051027
【文章來源】:華中科技大學(xué)湖北省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:86 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖115個樣本總RNA的人1%甲醛變性瓊脂糖凝膠電泳圖
圖215個樣本的芯片掃描圖
圖 3 15 個樣本芯片原始信號值標(biāo)準(zhǔn)化后的箱線圖NA 芯片數(shù)據(jù)分析間差異比較分別計算兩組之間(中年組與青年組(BvsA)、老年組與中年組與青年組(C vs A)每個 circRNA 的表達(dá)差異倍數(shù)來比的表達(dá)譜的差異。用 t 檢驗計算統(tǒng)計顯著性。將表達(dá)倍數(shù)改于 0.05 的 circRNA 定為存在顯著差異的 circRNA。點圖和火山圖分析組和青年組比較,顯著差異的 circRNA 較少,而且差異倍數(shù)基 4,a 和 b);老年組和中年組比較,顯著下調(diào)的 circRNA 較差異倍數(shù)在 2 倍以上,部分 circRNA 的差異倍數(shù)達(dá)到 3 倍以rcRNA 相對比較少,差異倍數(shù)也基本都在 2 倍以內(nèi)(圖 4,
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