目的對(duì)2017年采集自重慶地區(qū)蚊蟲(chóng)標(biāo)本攜帶的病毒進(jìn)行分離鑒定。方法采用組織細(xì)胞培養(yǎng)法進(jìn)行病毒分離,應(yīng)用高通量測(cè)序技術(shù)獲得病毒分離物的全基因組序列,采用系統(tǒng)發(fā)育法進(jìn)行種類(lèi)及分子特征分析。結(jié)果庫(kù)蚊標(biāo)本來(lái)源的病毒陽(yáng)性分離物CQFD2017能引起白紋伊蚊細(xì)胞C6/36病變,但不能引起金黃地鼠腎細(xì)胞BHK-21、非洲綠猴腎細(xì)胞Vero病變。CQFD2017全基因組序列長(zhǎng)度為20 893 bp,包含6個(gè)開(kāi)放閱讀框。系統(tǒng)進(jìn)化分析發(fā)現(xiàn),該毒株位于Nidovirales病毒目Mesoniviridae病毒科的Yichang病毒所在的進(jìn)化分支,與Yichang病毒(NC₀40534)的核苷酸一致性為98.6%,ORF1a和ORF1b區(qū)氨基酸一致性分別為99.06%和99.15%,因此將該毒株命名為Yichang病毒CQFD2017株。結(jié)論 2017年重慶市庫(kù)蚊標(biāo)本分離的CQFD2017株為Yichang病毒。

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圖1蚊蟲(chóng)標(biāo)本采集地點(diǎn)

2017年9月,在重慶市巴南區(qū)和豐都縣共采集到732只蚊蟲(chóng)標(biāo)本(圖1),其中騷擾阿蚊672只(92%),致倦庫(kù)蚊30只(4%),三帶喙庫(kù)蚊30只(4%)。這些蚊蟲(chóng)被分為20批次接種細(xì)胞。從重慶地區(qū)豐都縣致倦庫(kù)蚊標(biāo)本分離物在接種C6/36細(xì)胞后72h開(kāi)始引起細(xì)胞CPE。CPE的主....

圖2CQFD2017對(duì)C6/36細(xì)胞致病變作用

為了研究CQFD2017的系統(tǒng)進(jìn)化地位,從NCBI的GenBank下載了與CQFD2017相似性≥30%的RNA依賴(lài)的RNA聚合酶(RNA-dependentRNApolymerase,RdRp)氨基酸序列,并用于構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)。分析表明,CQFD2017屬于Mesoni....

圖3基于宜昌病毒分離株CQFD2017的RdRp區(qū)氨基酸序列的系統(tǒng)進(jìn)化分析

表1CQFD2017與Mesoniviridae病毒科家族成員的氨基酸序列比對(duì)分析Tab.1AminoacididentitiesbetweenCQFD2017andothermembersoffamilyMesoniviridaeVirusCQFD2....

本文編號(hào)：4004121