目的研究食品中分離克羅諾桿菌屬種的鑒定方法,旨在建立穩(wěn)定、可靠的種的鑒定方法。方法本研究選擇三種鑒定方法,包括生化鑒定(VITEK 2 Compact)法、基質(zhì)輔助激光解吸電離飛行時間質(zhì)譜(MALDI-TOF MS)、全基因組測序,通過比較分析三種方法對19株克羅諾桿菌屬的鑒定結(jié)果,闡述三種鑒定方法的優(yōu)缺點及其適用性。結(jié)果本研究中19株克羅諾桿菌屬的鑒定結(jié)果顯示,VITEK 2 Compact對阪崎克羅諾桿菌和丙二酸鹽克羅諾桿菌的鑒定準(zhǔn)確率只有67%和66%,而MALDI-TOF MS和全基因組測序的鑒定結(jié)果一致,因此可以判定MALDI-TOF MS能夠快速、準(zhǔn)確、高通量對克羅諾桿菌屬進行種的鑒定。但是MALDI-TOF MS受限于數(shù)據(jù)庫,不能鑒定到亞種的水平。結(jié)論本研究結(jié)果提示VITEK 2 Compact法不適用于克羅諾桿菌屬種的鑒定;全基因組測序鑒定結(jié)果準(zhǔn)確可靠;MALDI-TOF MS可以實現(xiàn)快速、高通量、準(zhǔn)確的鑒定,仍需要進一步研究克羅諾桿菌屬3個亞種的蛋白指紋圖譜特點,豐富蛋白指紋圖譜數(shù)據(jù)庫,使其能夠準(zhǔn)確鑒定克羅諾桿菌屬的7個種和3個亞種。

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圖1MALDI-TOFMS鑒定克羅諾桿菌屬蛋白指紋圖譜

表119株克羅諾桿菌屬鑒定結(jié)果Table1Identificationof19Cronobacterspp.菌株編碼樣品來源生化鑒定MALDI-TOFMS全基因組測序直接點樣甲酸-乙腈二次處理cg1黑芝麻糊阪崎克羅諾桿菌阪崎克羅諾桿菌/丙二酸....

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