目的初步探索中國中小學(xué)生微量營養(yǎng)素缺乏風(fēng)險的關(guān)聯(lián)SNP位點地域特征,為評估微量元素缺乏風(fēng)險提供基礎(chǔ)依據(jù)。方法搜集以往研究中報道的143個SNP位點,研究對象來自于2016年中國貧困地區(qū)營養(yǎng)健康調(diào)查項目義務(wù)教育中一至九年級1 130名中小學(xué)生的凝固血細胞,采用磁珠法提取DNA,競爭性等位基因法進行分型檢測。對差異基因進行GO顯著性富集,采用R軟件包進行PCA、kinship和SNP位點之間連鎖不平衡分析,分析候選SNP位點的特征。如有種群結(jié)構(gòu)的存在,采用Fa ST-LMM模型進行關(guān)聯(lián)分析。結(jié)果差異表達基因在生物過程分組中主要富集在催化活性、轉(zhuǎn)運活性、能量代謝途徑、類固醇激素、輔酶、維生素A、維生素D和水溶性維生素的代謝等生物學(xué)過程中,涉及轉(zhuǎn)錄、翻譯以及能量代謝相關(guān)基因。143個SNP位點分型結(jié)果在民族分布上差異有統(tǒng)計學(xué)意義,3號染色體上的基因多態(tài)性位點在民族間差異有統(tǒng)計學(xué)意義。主成分分析PC1顯示,位于RAB6B基因上的rs2280673解釋效度在25%以下,位于TF基因上的rs1799852解釋效度為25%～50%,位于RBP2基因上的rs2118981位點和SRPRB基因上的rs18... 

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【文章目錄】：
1 資料來源與方法
    1.1 MDR-SNPs納入原則及相關(guān)基因功能注釋分析
    1.2 樣本來源
    1.3 基因分型
    1.4 統(tǒng)計分析
2 結(jié)果
    2.1 基因功能注釋及富集分析結(jié)果
    2.2 連鎖不平衡和親緣關(guān)系分析結(jié)果
    2.3 主成分分析結(jié)果
3 討論


【參考文獻】：
期刊論文
[1]中國不同地區(qū)群體遺傳結(jié)構(gòu)差異及調(diào)整策略研究[J]. 朱猛,呂筠,余燦清,靳光付,郭彧,卞錚,Robin Walters,Iona Millwood,陳錚鳴,沈洪兵,胡志斌,李立明.  中華流行病學(xué)雜志. 2019 (01)
[2]母親MTRR和MTR基因多態(tài)性與子代神經(jīng)管畸形易感性Meta分析[J]. 張春紅,霍軍生,孫靜,黃建.  中國預(yù)防醫(yī)學(xué)雜志. 2018(10)
[3]中國人群母親5,10-亞甲基四氫葉酸還原酶基因C677T多態(tài)性與子代神經(jīng)管畸形易感性關(guān)系的Meta分析[J]. 張春紅,霍軍生,孫靜,黃建,樸瑋,殷繼永.  衛(wèi)生研究. 2018(02)
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