[目的]應(yīng)用轉(zhuǎn)錄組測序（RNA sequencing,RNA-seq）技術(shù),研究苯對小鼠骨髓細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組表達(dá)和信號通路的影響,為苯對小鼠骨髓細(xì)胞毒性的可能作用機(jī)制提供科學(xué)線索。[方法]將C3H/He小鼠隨機(jī)分為苯暴露組[160 mg/（kg·d）]與對照組[0 mg/（kg·d）],每組10只,以皮下注射的方式染毒,每周5次,連續(xù)4周。分離小鼠的骨髓細(xì)胞,應(yīng)用RNA-seq技術(shù)對苯暴露和對照組小鼠的骨髓細(xì)胞進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序,并對測序結(jié)果進(jìn)行基因差異表達(dá)、基因功能與信號通路富集以及基因共表達(dá)分析。[結(jié)果]RNA-seq結(jié)果顯示,苯染毒后共有227個(gè)基因的表達(dá)發(fā)生明顯變化,其中122個(gè)基因下調(diào),105個(gè)基因上調(diào)。基因功能與信號通路富集分析結(jié)果顯示,這些差異基因主要富集在免疫、凋亡、代謝、氧化應(yīng)激、造血譜系等功能和通路上。差異基因共表達(dá)分析顯示,調(diào)控度大于10的基因有14個(gè),其中Ccr9、Xaf1、Flt3、Cd72分別是細(xì)胞免疫、細(xì)胞凋亡、造血細(xì)胞譜系、造血細(xì)胞分化等通路上的重要基因。[結(jié)論]苯暴露可導(dǎo)致小鼠骨髓細(xì)胞基因表達(dá)譜發(fā)生變化,可引起小鼠骨髓細(xì)胞免疫、凋亡、代謝、氧化應(yīng)激、造血譜系等功... 

【文章來源】：環(huán)境與職業(yè)醫(yī)學(xué). 2017,34(07)北大核心CSCD

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【部分圖文】：

苯染毒4周后小鼠骨髓細(xì)胞差異表達(dá)基因的共表達(dá)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)圖

lism）3<0.05<0.05Gpx1、Gstm5、Gpx4急性髓性白血病（Acutemyeloidleukemia）3<0.05<0.05Flt3、Ccnd1、Pim1［注］紅色代表在染毒組中高表達(dá)，綠色代表在染毒組中低表達(dá)，點(diǎn)越大調(diào)控能力相對越強(qiáng)，實(shí)線代表基因間呈正相關(guān)，虛線代表基因間呈負(fù)相關(guān)。［Note］Redrepresentshighexpressionintheexposuregroup，greenrepresentslowexpressionintheexposuregroup，andlargersizesuggestsstrongerdegree.Thesolidlinesrepresentapositivecorrelationbetweenthegenes，andthedashedlinesrepresentanegativecorrelationbetweenthegenes.圖2苯染毒4周后小鼠骨髓細(xì)胞差異表達(dá)基因的共表達(dá)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)圖Figure2Co-expressionnetworkofdifferentiallyexpressedgenesinbonemarrowcellsofmiceexposedtobenzeneforfourweeks

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]低水平職業(yè)性苯接觸人群健康效應(yīng)及生物標(biāo)志物研究[J]. 陳鏗鏗,黃振烈,賴關(guān)朝,吳邦華,楊愛初,曾麗海,羅巧,周珊宇,陳雯,黃漢林.  中國職業(yè)醫(yī)學(xué). 2015(06)
[2]苯致血液毒性遺傳易感性與外源化合物代謝酶基因多態(tài)性[J]. 陳艷.  衛(wèi)生研究. 2002(02)

博士論文
[1]基于RNA-seq與small RNA-seq進(jìn)行奶牛產(chǎn)奶性狀功能基因挖掘及生物信息學(xué)預(yù)測牛新miRNA[D]. 崔曉鋼.中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[2]SM22α敲除小鼠血管轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析及差顯基因的功能驗(yàn)證[D]. 陳榮.河北醫(yī)科大學(xué) 2014
[3]DNA損傷修復(fù)基因多態(tài)與苯作業(yè)工人遺傳損傷易感性關(guān)系的研究[D]. 張靜.新疆醫(yī)科大學(xué) 2012

碩士論文
[1]葡萄糖-6-磷酸脫氫酶缺陷對苯造血毒性的易感性與機(jī)制研究[D]. 楊文文.東南大學(xué) 2016
[2]基于RNA-Seq技術(shù)的人轉(zhuǎn)錄組分析研究[D]. 陳超.中南大學(xué) 2011



本文編號：3434436