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硫酸鈹致16HBE細(xì)胞炎癥反應(yīng)及其對(duì)microRNA表達(dá)譜的影響

發(fā)布時(shí)間:2020-06-29 06:30
【摘要】:目的:探討硫酸鈹(Beryllium sulfate,BeSO4)致人支氣管上皮細(xì)胞(16HBE)的炎癥反應(yīng)及其對(duì)micro RNA表達(dá)譜的影響。方法:1.以16HBE細(xì)胞為研究對(duì)象,用不同濃度BeSO4(0、100、150、200、250、300μmol/L)處理細(xì)胞48 h,采用MTT法檢測(cè)其對(duì)16HBE細(xì)胞活力的影響,分別使用酶聯(lián)免疫吸附實(shí)驗(yàn)(ELISA)、免疫印跡試驗(yàn)(Western Blot)檢測(cè)16HBE細(xì)胞內(nèi)白細(xì)胞介素-10(Interleukin-10,IL-10)、腫瘤壞死因子-α(Tumor Necrosis Factor-alpha,TNF-α)、干擾素-γ(Interferon-γ,IFN-γ)、環(huán)氧化酶-2(Cyclooxygenase-2,COX-2)及誘導(dǎo)型一氧化氮合酶(inducible Nitric Oxide Synthase,i NOS)的表達(dá)。2.采用small RNA測(cè)序技術(shù)檢測(cè)BeSO4處理后16HBE細(xì)胞內(nèi)miRNA的表達(dá),并按|log2Fold Change|1和P0.05的標(biāo)準(zhǔn),篩選差異表達(dá)較大的miRNAs。使用Target Scan、miRanda和Pita數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)部分miRNAs進(jìn)行靶基因預(yù)測(cè),利用DAVID在線工具對(duì)靶基因進(jìn)行Gene Ontology(GO)分析和the Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG)pathway富集分析,運(yùn)用Cytoscape軟件構(gòu)建靶基因的調(diào)控網(wǎng)絡(luò),使用實(shí)時(shí)熒光定量PCR(q RT-PCR)驗(yàn)證候選miRNAs的表達(dá)。3.選擇目標(biāo)miRNA進(jìn)行功能分析,構(gòu)建miRNA mimics、miRNA inhibitor,利用脂質(zhì)體轉(zhuǎn)染技術(shù)處理16HBE細(xì)胞,隨后用BeSO4處理,分別采用ELISA、Western Blot法檢測(cè)IL-10、TNF-α、IFN-γ、COX-2及i NOS的表達(dá),探討增加或減少miRNA在BeSO4誘導(dǎo)16HBE細(xì)胞炎癥反應(yīng)中的作用。使用miRanda、Target Scan、DIANA Tools和miRwalk數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)目標(biāo)miRNA進(jìn)行靶基因預(yù)測(cè),并與m RNA測(cè)序結(jié)果(課題組前期轉(zhuǎn)錄組測(cè)序結(jié)果)取交集,繪制韋恩圖,采用Target Scan預(yù)測(cè)miR-663b和靶基因LIF的結(jié)合位點(diǎn)。結(jié)果:1.與對(duì)照組相比,BeSO4抑制16HBE細(xì)胞的活力,且存在劑量反應(yīng)關(guān)系,差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.05),BeSO4對(duì)16HBE細(xì)胞的半數(shù)抑制濃度(IC50)為260μmol/L;BeSO4可致16HBE細(xì)胞內(nèi)IL-10、TNF-α、IFN-γ、COX-2及i NOS等炎癥相關(guān)因子表達(dá)增加(P0.05)。2.small RNA測(cè)序:與對(duì)照組相比,BeSO4處理組16HBE細(xì)胞中有179個(gè)差異表達(dá)的miRNAs,其中上調(diào)的有88個(gè)、下調(diào)的有91個(gè)。這些差異表達(dá)的miRNAs中已命名有93個(gè)、未命名有86個(gè)。3.符合差異表達(dá)篩選標(biāo)準(zhǔn)的miRNAs有28個(gè),包括18個(gè)上調(diào)的miRNAs和10個(gè)下調(diào)的miRNAs。對(duì)28個(gè)miRNAs進(jìn)行靶基因預(yù)測(cè)發(fā)現(xiàn),23個(gè)miRNAs預(yù)測(cè)的共同靶基因轉(zhuǎn)錄本有27160(基因5140)個(gè),其余5個(gè)miRNAs沒(méi)有預(yù)測(cè)到共同的靶基因。預(yù)測(cè)得到的靶基因主要位于細(xì)胞質(zhì)和細(xì)胞核中,與轉(zhuǎn)錄、信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、蛋白結(jié)合等生物學(xué)作用有關(guān)。q RT-PCR驗(yàn)證結(jié)果表明miR-1306-5p、miR-193b-5p、miR-4485-3p和miR-877-5p表達(dá)上調(diào),miR-23b-5p和miR-663b表達(dá)下調(diào),與測(cè)序結(jié)果一致。4.與對(duì)照組相比,miR-663b mimics明顯下調(diào)16HBE細(xì)胞內(nèi)IL-10、TNF-α、IFN-γ、COX-2及i NOS等炎癥相關(guān)因子的表達(dá)(P0.05),減輕BeSO4對(duì)16HBE細(xì)胞的炎癥反應(yīng),而miR-663b inhibitor則增加了16HBE細(xì)胞內(nèi)IL-10、TNF-α、IFN-γ、COX-2及i NOS等炎癥相關(guān)因子的表達(dá)(P0.05)。5.預(yù)測(cè)到miR-663b的靶基因共有271個(gè),與m RNA測(cè)序結(jié)果有交集的有65個(gè)。通過(guò)軟件分析miR-663b與LIF的3’UTR存在結(jié)合位點(diǎn),LIF是miR-663b的潛在靶基因。而基因LIF主要參與JAK-STAT信號(hào)通路。結(jié)論:1.BeSO4可致16HBE細(xì)胞產(chǎn)生炎癥反應(yīng)。2.BeSO4可致16HBE細(xì)胞內(nèi)88個(gè)miRNAs表達(dá)上調(diào),91個(gè)miRNAs表達(dá)下調(diào)。3.miR-663b的潛在靶基因是LIF。miR-663b過(guò)表達(dá)可減輕BeSO4致16HBE細(xì)胞的炎癥反應(yīng);而miR-663b的下調(diào)則加重BeSO4致16HBE細(xì)胞的炎癥反應(yīng)。
【學(xué)位授予單位】:南華大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類號(hào)】:R114
【圖文】:

細(xì)胞活力,細(xì)胞的,毒性作用,統(tǒng)計(jì)學(xué)意義


第 3 章 結(jié) 果第 3 章 結(jié) 果對(duì) 16HBE 細(xì)胞活力的影響估 BeSO4對(duì) 16HBE 細(xì)胞的毒性作用,用濃度為 0、10ol/L 的 BeSO4處理 16HBE 細(xì)胞 48 h,MTT 檢測(cè) 16H對(duì)照組相比,不同濃度的 BeSO4抑制 16HBE 細(xì)胞的,差異均具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05),且 BeSO4對(duì) 1(IC50)約為 260 μmol/L,見圖 3.1。

細(xì)胞內(nèi),對(duì)照組,細(xì)胞,統(tǒng)計(jì)學(xué)意義


圖 3.2 BeSO4對(duì) 16HBE 細(xì)胞內(nèi) IL-10、TNF-α和 IFN-γ的影響A:IL-10 蛋白表達(dá)量;B:TNF-α蛋白表達(dá)量;C:IFN-γ蛋白表達(dá)量(*與對(duì)照組相比,P<0.05)3.3 BeSO4對(duì) 16HBE 細(xì)胞內(nèi) COX-2、iNOS 蛋白表達(dá)的影響用濃度為 0、100、150、200、250、300 μmol/L 的 BeSO4處理 16HBE 細(xì)胞48 h,用 Western Blot 法檢測(cè)細(xì)胞中 COX-2、iNOS 蛋白的表達(dá)水平。與對(duì)照組相比,不同濃度的 BeSO4處理增加 16HBE 細(xì)胞種 COX-2、iNOS 蛋白的表達(dá),差異均具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05),且隨著 BeSO4濃度的增大,COX-2、iNOS蛋白的表達(dá)水平也逐漸增加,見圖 3.3。

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本文編號(hào):2733541

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