【摘要】：研究目的1.調查了解廣東省鼠形動物中巴爾通體的流行分布情況和遺傳進化特征,為巴爾通體疾病的防控提供依據(jù);2.利用高通量測序技術對巴爾通體菌株測序,獲得巴爾通體全基因組序列信息,初步分析其功能基因,并對巴爾通體毒力基因和致病機制進行初步探討。研究方法1.本研究依據(jù)廣東省地理方位,選取省內中東西分布的7個地區(qū)進行捕鼠,采集鼠肝臟標本提取總核酸。2.利用聚合酶鏈反應(PCR)檢測巴爾通體核酸,先對樣本通過Real-time PCR方法檢測巴爾通體非編碼RNA(ssrA)基因,對擴增陽性的樣本進行分離培養(yǎng),并進一步用普通PCR擴增枸櫞酸合成酶基因(gltA),長度約379bp;和RNA聚合酶亞單位基因(rpoB),長度大小約866bp,將擴增產(chǎn)物送至公司測序。3.對ssrA、gltA、rpoB測序所得序列在NCBI中進行同源性比對,利用Mega 6.0軟件測試選取構建拓撲結構的最適模型,通過鄰近法(Neighbor-joining Method)和最大似然法(Maximum Likelihood Method)構建系統(tǒng)發(fā)育樹,分析進化關系。用SPSS19.0對統(tǒng)計數(shù)據(jù)進行處理,不同組間感染率的比較用χ2檢驗和Fisher's概率確切法。4.通過Ion Torrent PGM測序平臺對兩株巴爾通體進行全基因組測序,用RAST平臺對基因功能進行注釋,獲得全基因組精細圖,并對功能基因和毒力基因進行對比分析。研究結果1.本研究在廣東省惠州,佛市,茂名,云浮,潮州,揭陽、河源7個地區(qū),共采集鼠肝臟組織樣本495份,隸屬2目3科6屬8種。檢測鼠形動物巴爾通體總感染率為12.52%。感染鼠種有褐家鼠、黃胸鼠、屋頂鼠、黃毛鼠、板齒鼠和食蟲目動物臭，

本文編號：2625683