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蒙古族腸道核心菌群及其與飲食關(guān)聯(lián)性研究

發(fā)布時(shí)間:2021-03-21 08:22
  腸道菌群與人體形成了密不可分的互惠共生關(guān)系,它的平衡穩(wěn)定與宿主的營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)加工、能量代謝、免疫調(diào)節(jié)、胃腸道上皮細(xì)胞更新等重要生理活動(dòng)息息相關(guān)。蒙古族起源于公元7世紀(jì)的額爾古納河?xùn)|岸,是東亞主要民族之一,同時(shí)也是蒙古國(guó)的主體民族。蒙古族鼎盛時(shí)期,將我國(guó)領(lǐng)土擴(kuò)展到中亞和南俄羅斯,使我國(guó)成為橫跨歐亞的帝國(guó),這極大程度促進(jìn)了中西方文化交流。傳統(tǒng)蒙古族飲食極具特色,肉食、奶食及發(fā)酵乳制品在其飲食結(jié)構(gòu)中占很大比重。 目前,世界各個(gè)地區(qū)和民族健康人的腸道菌群結(jié)構(gòu)及核心菌群被廣泛報(bào)道。然而,對(duì)于蒙古族這樣一個(gè)分布廣泛,歷史悠久且獨(dú)具生活飲食特色的民族,迄今為止仍沒(méi)有關(guān)于該民族腸道菌群結(jié)構(gòu)及其與飲食關(guān)系的研究報(bào)道。本研究應(yīng)用熒光定量PCR技術(shù)和基于16S rRNA V1-V3可變區(qū)的高通量測(cè)序技術(shù),對(duì)采集自蒙古國(guó)烏蘭巴托市,中央省和肯特牧區(qū)的64名蒙古族健康志愿者腸道菌群進(jìn)行了為期一年(1月,3月,6月,9月和11月,共5次)的動(dòng)態(tài)監(jiān)測(cè),旨在揭示蒙古族健康人腸道菌群構(gòu)成及其核心腸道菌群,在此基礎(chǔ)上結(jié)合飲食調(diào)查表,深入分析四季變換的飲食與蒙古族健康人腸道菌群的密切聯(lián)系。 研究結(jié)果表明,在門(mén)的水平上擬桿菌門(mén)(Bacteroidetes,55.56%)、硬壁菌門(mén)(Firmicutes,39.53%)、變形菌門(mén)(Proteobacteria,2.68%)和放線菌門(mén)(Actinobacteria,0.85%)在蒙古族志愿者腸道內(nèi)含量最高,而硬壁菌門(mén)與擬桿菌門(mén)的比例值平均值是0.71。在屬的水平上,蒙古族健康志愿者腸道內(nèi)含量最高的是普氏菌屬(Prevotella)。而基于熒光定量PCR的菌屬定量結(jié)果顯示,擬桿菌屬,雙歧桿菌屬,腸桿菌類群,普氏菌屬,乳桿菌屬和普拉梭菌屬在每克糞便中的基因拷貝數(shù)取對(duì)數(shù)后分別為9.61±0.13,8.02±0.85,7.59±0.21,9.66±0.17,6.53±0.18和10.34±0.71個(gè);诟(xì)水平的OTU分析結(jié)果顯示,蒙古族腸道內(nèi)存在核心菌群,它們分別隸屬于:Prevotella、Bacteroides、Faecalibacterium、 Ruminococcus、Subdoligranulum和Coprococcus。通過(guò)與KEGG數(shù)據(jù)庫(kù)預(yù)測(cè)比對(duì),我們發(fā)現(xiàn)這些核心菌群主要參與了糖酵解,脂肪酸代謝,半乳糖代謝,丙氨酸及谷氨酸代謝,精氨酸及脯氨酸代謝,淀粉及蔗糖代謝,碳代謝和硫胺素代謝。 基于微生物群落α和β多樣性的分析結(jié)果證實(shí)居住于蒙古國(guó)烏蘭巴托市、中央省和肯特牧區(qū)的蒙古族腸道菌群構(gòu)成差異顯著,而差異顯著的菌屬為:Prevotella、Solobacterium、Succinivibrio、Shigella、Olsenella、Lactobacillus、 Bacteroides、Oscillibacter、Roseburia和Coprococcus等。通過(guò)統(tǒng)計(jì)食頻調(diào)查表,我們發(fā)現(xiàn)烏蘭巴托地區(qū)蒙古族志愿者食物種類豐富,飲食結(jié)構(gòu)穩(wěn)定?咸啬羺^(qū)牧民食物種類匱乏,飲食結(jié)構(gòu)季節(jié)性很強(qiáng),波動(dòng)極大。而中央省志愿者居民生活水平和飲食結(jié)構(gòu)都介于上述兩個(gè)地區(qū)之間;诓煌蓸訒r(shí)間的腸道菌群分析結(jié)果與食頻調(diào)查表結(jié)果具有高度一致性,烏蘭巴托市居民一年四季腸道菌群結(jié)構(gòu)穩(wěn)定,而肯特牧區(qū)牧民腸道菌群結(jié)構(gòu)隨季節(jié)變遷變化顯著。而基于普氏分析的結(jié)果也顯示,蒙古族飲食結(jié)構(gòu)及其腸道菌群結(jié)構(gòu)相關(guān)性密切。由此,我們判斷,四季變換的飲食是蒙古族腸道菌群結(jié)構(gòu)變化的主要因素。
【學(xué)位授予單位】:內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2014
【分類號(hào)】:R151
文章目錄
摘要
Abstract
縮略語(yǔ)表
1 前言
    1.1 健康人腸道菌群構(gòu)成
    1.2 健康人腸道菌群的構(gòu)成、功能及核心腸道菌群
    1.3 影響腸道菌群群落結(jié)構(gòu)的因素
        1.3.1 基因型對(duì)腸道菌群的影響
        1.3.2 年齡及身體質(zhì)量指數(shù)(BMI)對(duì)腸道菌群的影響
        1.3.3 飲食對(duì)腸道菌群的影響
        1.3.4 抗生素對(duì)腸道菌群的影響
    1.4 腸道菌群與疾病
    1.5 分子生物學(xué)與生物信息學(xué)技術(shù)在腸道菌群研究中的應(yīng)用
    1.6 蒙古族歷史及生活習(xí)俗概述
    1.7 本研究的目的和意義
2 材料和方法
    2.1 材料
        2.1.1 樣品來(lái)源
        2.1.2 本試驗(yàn)選用的參考菌株及擴(kuò)增引物
        2.1.3 本研究采用的試劑盒及常用試劑
        2.1.4 儀器設(shè)備
    2.2 試驗(yàn)方法
        2.2.1 糞便樣品采集及保存
        2.2.2 糞便中細(xì)菌宏基因組DNA的提取
        2.2.3 細(xì)菌16S rRNA V1-V3可變區(qū)擴(kuò)增
        2.2.4 PCR產(chǎn)物純化、平衡及測(cè)序
        2.2.5 高質(zhì)量序列的提取
        2.2.6 測(cè)序結(jié)果的生物信息學(xué)處理
        2.2.7 腸道常見(jiàn)菌屬的熒光定量(q-PCR)研究
        2.2.8 數(shù)據(jù)的統(tǒng)計(jì)分析及圖表繪制
        2.2.9 核酸序列登錄號(hào)
3 結(jié)果與分析
    3.1 測(cè)序深度及樣品測(cè)序量說(shuō)明
    3.2 蒙古族腸道菌群構(gòu)成
        3.2.1 蒙古族腸道菌群在門(mén)水平上的構(gòu)成
        3.2.2 蒙古族腸道菌群在屬水平上的構(gòu)成
    3.3 蒙古族健康志愿者核心腸道菌群及其功能與代謝通路研究
    3.4 肯特牧區(qū),中央省和烏蘭巴托市蒙古族志愿者腸道菌群差異性分析
        3.4.1 基于α多樣性的3地健康志愿者腸道菌群比較分析
        3.4.2 基于β多樣性的3地健康志愿者腸道菌群比較分析
        3.4.3 基于菌屬水平的3地健康志愿者腸道菌群差異性分析
    3.5 烏蘭巴托市、中央省及肯特牧區(qū)蒙古族居民飲食調(diào)查
    3.6 飲食變化對(duì)蒙古族志愿者腸道菌群的影響
        3.6.1 肯特牧區(qū)蒙古族志愿者一年四季腸道菌群多樣性變化
        3.6.2 烏蘭巴托地區(qū)蒙古族志愿者一年四季腸道菌群多樣性變化
        3.6.3 中央省蒙古族志愿者一年四季腸道菌群多樣性變化
        3.6.4 基于α多樣性四季飲食變換對(duì)蒙古族腸道菌群的影響
    3.7 飲食與腸道菌群關(guān)聯(lián)性分析
4 討論
致謝
參考文獻(xiàn)
附錄
作者簡(jiǎn)介

【相似文獻(xiàn)】

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本文編號(hào):2514762

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