【摘要】：目的:運用文獻計量學方法和統(tǒng)計學原理,對2005~2016年國內(nèi)外公開發(fā)表的主題為“砷致病機制”的文獻進行定量和定性分析,以揭示國內(nèi)外砷致病機制的研究現(xiàn)狀、熱點與發(fā)展趨勢;以人群流行病學調(diào)查資料為基礎(chǔ),運用meta分析的方法評價砷暴露與肝纖維化的關(guān)系;運用8標同位素標記相對和絕對定量(isobaric tags for relative and absolute quantification,iTRAQ)技術(shù)結(jié)合二維液相色譜串聯(lián)質(zhì)譜(2DLc-MS/MS)技術(shù)篩選出砷致肝纖維化大鼠肝臟中的差異蛋白,并對其進行生物信息學分析,為進一步闡明砷致肝纖維化的作用機制提供資料。方法:運用文獻管理軟件ENDNOTE對2005~2016年國內(nèi)外公開發(fā)表的主題為“砷致病機制”的文獻進行發(fā)表年份和來源期刊的分析,再使用信息可視化軟件CiteSpace對Web of ScienceTM核心合集和CNKI核心期刊專輯中同一時間段中該研究領(lǐng)域的文獻進行共引、共現(xiàn)、共詞、聚類分析。計算機檢索CNKI全文數(shù)據(jù)庫、萬方全文數(shù)據(jù)庫、中國生物醫(yī)學文獻數(shù)據(jù)庫、維普數(shù)據(jù)庫、PubMed數(shù)據(jù)庫、web of science全庫、EMBASE數(shù)據(jù)庫,檢索詞為砷暴露和肝纖維化,檢索時間從建庫至2016年12月31日,按照納入和排除標準篩選文獻,提取資料并評價納入文獻的質(zhì)量,采用Stata12.0軟件進行mata分析,計算合并OR值和95%CI值,并進行敏感性分析和發(fā)表偏倚評估。建立亞砷酸鈉致肝纖維化大鼠模型,運用8標iTRAQ技術(shù)結(jié)合2DLc-MS/MS技術(shù)篩選差異蛋白,將差異蛋白放入Uniprot和STRING 10.0,查看其代表的基因、功能和參與的通路,再用Goanna軟件分析差異蛋白參與的生物過程、所在的細胞位置和分子功能,在GO注釋分析的基礎(chǔ)上,用R軟件對差異蛋白參與的生物學過程進行聚類分析,篩選出主要作用通路。結(jié)果:1、從年發(fā)文量來看,國內(nèi)外砷致病機制研究的發(fā)展比較均衡,期間有小幅波動,年均發(fā)文量227-260篇,但從2013年開始該研究領(lǐng)域發(fā)表的文獻數(shù)量呈下降趨勢。2、國內(nèi)外文獻發(fā)表數(shù)量大于10的期刊均為核心期刊,國外來源期刊中93%JCR分區(qū)分布在Q1、Q2,37%期刊的影響因子大于5,研究領(lǐng)域主要集中在藥理學、毒理學、生物化學與分子生物學等領(lǐng)域。3、結(jié)合H指數(shù)和高被引結(jié)果分析,在砷致病機制研究領(lǐng)域?qū)W術(shù)成就排名前四的作者為Styblo Miroslav、Vahter Marie、Thomas DanielJ、Aposhian HV;起到關(guān)鍵作用排名前三位的作者為Yamanaka K、Anonymous和Mass MJ;既是經(jīng)典文獻又是關(guān)鍵文獻的論文是A new metabolic pathway of arsenite:arsenic-glutathione complexes are substrates for human arsenic methyltransferase Cyt19和Trivalent arsenicals are bound to proteins during reductive methylation。4、合作發(fā)文量前三的國外作者為Naranmandura,Hua,Suzuki,Kazuo T和Waalkes,Michael P,合作發(fā)文量前三的國家為美國、中國和日本,合作密切程度前三的國家為美國、加拿大和德國;機構(gòu)中亞利桑那大學研究成果最多。國內(nèi)合著發(fā)文量前三的作者為鄭玉建、王績英和吳君,合著研究成果第一的機構(gòu)是貴陽醫(yī)學院附屬醫(yī)院感染科。5、國外砷致病機制的研究熱點為毒性、氧化應(yīng)激、甲基化、細胞轉(zhuǎn)化、三氧化二砷、信號通路、谷胱甘肽以及蛋白機制研究,國內(nèi)該領(lǐng)域研究熱點為三氧化二砷、細胞凋亡、亞砷酸鈉、砷中毒機制研究。6、無機砷、表達、去甲基化酸、膀胱癌、砷甲基化是砷致病機制研究領(lǐng)域不同時間段的研究前沿。7、砷致病機制研究主題為三氧化二砷,甲基化,攝入方式、劑量等6項。8、對砷暴露與肝纖維化關(guān)系進行系統(tǒng)評價發(fā)現(xiàn),異質(zhì)性檢驗結(jié)果χ2=9.27,P=0.234(0.10),I2=24.5%(50%)。Z=8.42,P0.01,砷暴露與非砷暴露肝纖維化發(fā)生有差異,差異有統(tǒng)計學意義。結(jié)果合并OR值為3.50,95%CI為2.615-4.685,即砷暴露地區(qū)的肝纖維化發(fā)病是非砷暴露地區(qū)的3.5倍。9、研究發(fā)現(xiàn)Hic-5蛋白、谷胱甘肽合成酶在中、高劑量染毒組均上調(diào),原肌球蛋白共有六種蛋白,其中Tmp2在中、高劑量染毒組下調(diào),其他五種均顯示上調(diào)。與肝纖維化密切相關(guān)的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路為MAPK通路、PPARγ-NFκB信號通路、TGF-β通路、Wnt信號通路。差異蛋白中主要的生物學過程為代謝,其中氨基酸合成和代謝,糖代謝,脂肪酸合成和代謝為主要的過程。結(jié)論:1、利用計算機文本挖掘技術(shù)提取砷致病機制研究中的現(xiàn)狀、熱點和主題,從全局的角度上進行分析和把控,為進一步的研究提供文獻理論基礎(chǔ)。2、砷暴露與肝纖維化發(fā)生相關(guān),提示砷暴露可能是肝病高發(fā)的一個危險因素。3、差異蛋白中Hic-5蛋白、谷胱甘肽合成酶、原肌球蛋白與肝纖維化發(fā)生關(guān)系密切,MAPK通路、PPARγ-NFκB信號通路、TGF-β通路、Wnt信號通路對肝纖維化調(diào)控有重要作用,差異蛋白參與的生物學過程主要是代謝,其中氨基酸合成和代謝,糖代謝,脂肪酸合成和代謝,在砷致肝纖維化中發(fā)揮著重要作用。
[Abstract]:......
【學位授予單位】：新疆醫(yī)科大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2017
【分類號】：R114

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本文編號：2323254