通用多重不對稱PCR結(jié)合寡核苷酸芯片檢測7種食源性致病菌
本文選題:食源性致病菌 + 通用引物 ; 參考:《食品科學》2017年08期
【摘要】:應(yīng)用通用多重不對稱聚合酶鏈式反應(yīng)(polymerase chain reaction,PCR)和寡核酸芯片技術(shù)建立一種同時檢測7種常見食源性致病菌的方法。每種致病菌上游或下游引物5’端連接一段異源的共有序列。以熒光標記的該共有序列作為通用引物,與限制性特異引物經(jīng)一步多重不對稱PCR同時獲得所有目標菌的單鏈標記靶序列,可被芯片上固定的特異性寡核苷酸探針捕獲。通過芯片掃描、分析熒光信號完成檢測。標準菌株檢測結(jié)果證實,該方法可特異地檢測單一和混合感染的目標菌,基因組DNA的檢測靈敏度為0.1~1 pg。95份模擬污染和零售食品樣本芯片檢測結(jié)果與常規(guī)的分離與生化鑒定及熒光定量PCR結(jié)果一致。建立的寡核苷酸芯片方法可為快速、特異、靈敏及高通量地鑒定食源性致病菌提供一種有效的檢測手段。
[Abstract]:A method for simultaneous detection of seven common foodborne pathogenic bacteria was established by using universal polymerase chain reaction PCR and oligonucleic acid chip technology. The upstream or downstream primer 5 'ends of each pathogen are linked to a common sequence of heterologous sources. Using the fluorescent labeled common sequence as the universal primer, the single-strand labeled target sequence of all the target bacteria was simultaneously obtained by one-step multiplex asymmetric PCR with the restriction specific primer, which could be captured by the specific oligonucleotide probe fixed on the chip. The fluorescence signal was analyzed and detected by chip scanning. The results of standard strain detection confirmed that this method could specifically detect single and mixed infected target bacteria. The detection sensitivity of genomic DNA was 0.1 pg.95. The results of microarray detection of simulated contamination and retail food samples were consistent with those of routine isolation, biochemical identification and fluorescence quantitative PCR. The established oligonucleotide chip method can provide an effective method for rapid, specific, sensitive and high-throughput identification of foodborne pathogenic bacteria.
【作者單位】: 西安市疾病預(yù)防控制中心;
【基金】:陜西省自然科學基礎(chǔ)研究計劃項目(2015JM3112) 西安市社會發(fā)展引導計劃——醫(yī)學研究項目(SF1516(2))
【分類號】:R155.5
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,本文編號:1897863
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