基于16S rDNA序列的1株滅螺微生物的分子鑒定
發(fā)布時間:2018-04-26 19:22
本文選題:釘螺 + 微生物; 參考:《江蘇農(nóng)業(yè)科學》2017年01期
【摘要】:從湖南省汨羅市血吸蟲防治基地土壤中分離得到1株滅螺活性較強的微生物菌株B59,以B59菌株的總DNA為模板,采用細菌16S rDNA通用引物進行PCR擴增并測其核酸序列,得到1條約1 500 bp的片段。通過Blast軟件在Gen Bank中進行同源性檢索,將其與同源性較高的菌株的ITS序列進行Clustal X序列差異和同源性分析,分別使用MEGA 6.0軟件中的鄰接法、Phylip軟件中的最大簡約法及最大似然法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹。結(jié)果顯示,3種方法構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹基本一致,B59菌株與Bacillus cereus的親緣關(guān)系最近,聚為一支,相似度達100%。
[Abstract]:A microorganism strain B59 was isolated from the soil of Schistosoma japonicum control base in Miluo City, Hunan Province. Using the total DNA of strain B59 as template, the 16s rDNA primers were used for PCR amplification and nucleic acid sequencing. The fragment of 1 500 BP was obtained. The homology was searched in Gen Bank by Blast software, and the difference and homology of Clustal X sequence were analyzed with the ITS sequence of high homology strain. A phylogenetic tree was constructed by using the maximum minimization method and the maximum likelihood method in MEGA 6.0. The results showed that the phylogenetic tree constructed by the three methods was closely related to Bacillus cereus, and the similarity was 100%.
【作者單位】: 長治醫(yī)學院微生物教研室;中南大學湘雅醫(yī)學院病原生物教研室;長沙金城醫(yī)學檢驗所有限公司;
【基金】:國家自然科學基金(編號:81271862) 國家科技支撐計劃(編號:2009BAI78B05)
【分類號】:R184.38
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,本文編號:1807340
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