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艱難梭菌臨床分離株的分子流行病學(xué)及耐藥性研究

發(fā)布時間:2018-04-13 13:28

  本文選題:艱難梭菌 + 毒素基因; 參考:《河北醫(yī)科大學(xué)》2012年碩士論文


【摘要】:目的:艱難梭菌(Clostridium difficile)是一種革蘭陽性專性厭氧芽孢桿菌,通常在環(huán)境和人類腸道中正常存在。該菌由于產(chǎn)生毒素A、B而致病。過度應(yīng)用抗生素、免疫抑制劑或化療藥物使耐藥的艱難梭菌產(chǎn)毒株過度繁殖并釋放毒素是導(dǎo)致艱難梭菌相關(guān)性腹瀉(Clostridium difficileassociated diarrhea,CDAD)的主要因素。CDAD的發(fā)病率在全球范圍內(nèi)不斷增加,尤其是高產(chǎn)毒株在北美地區(qū)造成了醫(yī)院內(nèi)的暴發(fā)流行,引起了世界范圍的關(guān)注。所以,為了了解中國石家莊地區(qū)艱難梭菌的流行情況,我們對艱難梭菌臨床分離株的毒素基因、PCR-核糖體分型、耐藥性及耐藥相關(guān)基因進(jìn)行了一系列研究,為有效防止艱難梭菌的暴發(fā)流行提供依據(jù)。 方法:2010年7月至2011年12月期間,共收集來自河北醫(yī)科大學(xué)第二醫(yī)院、河北醫(yī)科大學(xué)第四醫(yī)院、河北醫(yī)科大學(xué)第一醫(yī)院、河北省人民醫(yī)院的糞便標(biāo)本235份。首先,對這些標(biāo)本用糞便基因組DNA提取試劑盒進(jìn)行DNA提取,,采用常規(guī)PCR的方法直接檢測糞便中艱難梭菌毒素A、B基因tcdA和tcdB;然后,對毒素陽性的標(biāo)本通過富集芽孢培養(yǎng)法進(jìn)行培養(yǎng);最后,分離得到的艱難梭菌再通過多重PCR的方法同時檢測艱難梭菌毒素A、B基因tcdA和tcdB、二元毒素基因cdtA和cdtB及16SrDNA基因。用常規(guī)PCR的方法對分離到的艱難梭菌進(jìn)行PCR-核糖體分型,所得條帶用Quantity One軟件進(jìn)行比對分析。采用瓊脂稀釋法測定艱難梭菌對左氧氟沙星、萬古霉素、甲硝唑、克林霉素、替加環(huán)素的最低抑菌濃度(Minimal Inhibitory Concentration,MIC),并通過PCR的方法檢測克林霉素耐藥相關(guān)基因ermB。 結(jié)果:235份糞便標(biāo)本采用常規(guī)PCR的方法直接檢測糞便中艱難梭菌毒素A、B基因,共檢測出37份陽性標(biāo)本,陽性率為15.7%。對37份PCR毒素陽性的標(biāo)本用富集芽孢培養(yǎng)法進(jìn)行艱難梭菌培養(yǎng),共培養(yǎng)出32株菌,培養(yǎng)陽性率為86.5%。用多重PCR分別對分離出的32株菌進(jìn)行毒素A、B(tcdA、tcdB)、二元毒素A、B(cdtA、cdtB)及16SrDNA檢測。發(fā)現(xiàn)所有菌株的毒素A、B基因均陽性,未檢出二元毒素基因。32株艱難梭菌分成12種不同的PCR核糖體型。其中SⅠ型最多,占28%,沒有發(fā)現(xiàn)核糖型027和078型。所有菌株對甲硝唑、萬古霉素、替加環(huán)素均高度敏感。但是對克林霉素(MIC128mg/l)和左氧氟沙星(MIC64mg/l)出現(xiàn)了高水平耐藥,并且耐藥率較高,分別為100%和87.5%。對美洛培南的耐藥率較低為18.8%。32株對克林霉素耐藥的艱難梭菌中,檢出18株ermB基因陽性菌株,占56.25%。 結(jié)論:1用常規(guī)PCR的方法檢測艱難梭菌毒素A、B基因,可以對艱難梭菌感染行早期的診斷。2富集芽孢培養(yǎng)法,提高了艱難梭菌培養(yǎng)的陽性率,可作為一種有效的艱難梭菌培養(yǎng)方法在臨床推廣。3我國石家莊地區(qū)流行的32株艱難梭菌產(chǎn)毒株以A+B+的菌株為主,未發(fā)現(xiàn)產(chǎn)二元毒素的菌株。4在該地區(qū)發(fā)現(xiàn)了12種不同的PCR核糖體型別,流行的菌株以SⅠ型為主(28%),沒有發(fā)現(xiàn)核糖型027和078型。5本實驗通過測定多種抗生素對艱難梭菌的MIC值,發(fā)現(xiàn)其對克林霉素、左氧氟沙星耐藥率較高,部分菌株對美洛培南耐藥,未發(fā)現(xiàn)對甲硝唑、萬古霉素、替加環(huán)素耐藥的菌株。在該地區(qū)甲硝唑和萬古霉素,仍可以作為CDAD治療的首選藥物。
[Abstract]:Objective : Clostridium difficile ( Clostridium difficile ) is a kind of Gram positive specific anaerobic bacillus which is normally present in the environment and human intestinal tract . It is caused by the excessive reproduction and release of toxin A , B . The incidence of CDAD is increasing worldwide . In order to understand the epidemic situation of Clostridium difficileassociated diarrhea ( CDAD ) in Shijiazhuang area of China , we have carried out a series of research on toxin gene , PCR - ribosome typing , drug resistance and drug resistance related genes of Clostridium difficile clinical isolates to provide the basis for effectively preventing the outbreak of Clostridium difficile .

Methods : From July 2010 to December 2011 , 235 samples were collected from the Second Affiliated Hospital of Hebei Medical University , the Fourth Hospital of Hebei Medical University , the First Affiliated Hospital of Hebei Medical University and the People ' s Hospital of Hebei Province . First of all , DNA extraction was carried out on the fecal genomic DNA extraction kit .
and then carrying out culture on the toxin - positive specimen through the enrichment spore culture method ;


本文編號:1744718

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