發(fā)布時(shí)間：2018-02-17 06:05

  本文關(guān)鍵詞： 副溶血弧菌 基于堿基序列的多位點(diǎn)序列分型 基于肽鏈的多位點(diǎn)序列分型 克隆復(fù)合體　出處：《軍事醫(yī)學(xué)》2015年11期 　論文類型：期刊論文

【摘要】：目的了解2007~2012年來自我國東部沿海地區(qū)水產(chǎn)品中的副溶血弧菌分離株的毒力基因攜帶情況和菌株克隆群關(guān)系構(gòu)成。方法收集2007~2012年間來自廣東省、福建省、上海市、江蘇省、山東省、北京市的水產(chǎn)品,分離自水產(chǎn)品中的副溶血弧菌株,經(jīng)基于tlh基因熒光PCR鑒定為副溶血弧菌共79株。采用熒光PCR方法對其進(jìn)行了毒力基因耐熱直接溶血素(tdh)、耐熱直接溶血素相關(guān)溶血素(trh)及流行組標(biāo)識(shí)基因orf8檢測,采用國際推薦的多基因座序列分型(MLST)方法對菌株進(jìn)行亞群分析和克隆復(fù)合體分析,并構(gòu)建基于ST型和p ST型的最小生成樹,根據(jù)e BURST進(jìn)行克隆群復(fù)合體分析。結(jié)果在79株水產(chǎn)品分離株中,tlh均為陽性,8.86%(7/79)的分離株tdh陽性,orf8基因的攜帶率為8.86%。此79株副溶血弧菌分離株分屬于69個(gè)ST型,3個(gè)克隆群復(fù)合體,62個(gè)單體。在基于肽鏈的多位序列分型時(shí),此79株副溶血弧菌分離株可分為23個(gè)p ST型,包括1個(gè)克隆群復(fù)合體,2個(gè)單體。去重組后剩余363個(gè)單核苷酸多態(tài)性(SNP)位點(diǎn),以此363個(gè)SNP位點(diǎn)進(jìn)行分型,可分為68個(gè)pattern型。結(jié)論來自我國東部沿海地區(qū)的水產(chǎn)品中分離的副溶血弧菌具有高度多態(tài)性,但毒力基因攜帶率較低,MLST分型時(shí)以ST3型為多,AA-MLST分型時(shí)以p ST1型為主。
[Abstract]:Objective to investigate the virulence gene carriers and the relationship between virulent genes and clone populations of Vibrio parahaemolyticus isolated from aquatic products in the eastern coastal areas of China from 2007 to 2012. Methods from Guangdong Province, Fujian Province, Shanghai Province, Jiangsu Province during the period of 2007 ~ 2012, the virulence genes of Vibrio parahaemolyticus strains were collected. Vibrio parahaemolyticus isolated from aquatic products in Beijing, Shandong Province, A total of 79 strains of Vibrio parahaemolyticus were identified by fluorescence PCR based on tlh gene. The virulence gene, heat-resistant direct hemolysin, heat-resistant direct hemolysin (HAL) and the marker gene orf8 of epidemic group were detected by fluorescence PCR method. The subgroup analysis and clone complex analysis were carried out by using the internationally recommended multilocus sequence typing (MLST) method, and the minimal spanning tree based on St and p St was constructed. The results of cloning complex analysis based on e BURST showed that the carrying rate of tdh positive orf8 gene in 79 aquatic product isolates were 8.86% and 8.86% respectively. These 79 isolates belonged to 69 St types and 3 grams respectively. Carina complex, 62 monomers. In multiposition sequence typing based on peptide chain, The 79 isolates of Vibrio parahaemolyticus could be divided into 23 pST types, including 1 clone complex and 2 monomers. Conclusion Vibrio parahaemolyticus isolated from aquatic products in the eastern coastal areas of China is highly polymorphic, but the virulence gene carrying rate is relatively low. ST3 type is the main type of polymorphic AA-MLST typing.
【作者單位】： 北京工商大學(xué)食品學(xué)院食品添加劑與配料北京高校工程研究中心;中國疾病預(yù)防控制中心傳染病預(yù)防控制所傳染病預(yù)防控制國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【基金】：國家自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(31400161,81401715) 北京工商大學(xué)青年教師科研啟動(dòng)基金資助項(xiàng)目(QNJJ2014-25)
【分類號(hào)】：R155.5

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本文編號(hào)：1517398