基于分子對接、分子動力學模擬、紫外吸收光譜法、熒光光譜法與紅外光譜法,研究了細胞色素CYP2C9與雙酚A (BPA)之間的相互作用。分子對接研究表明,對接位點位于Thr364附近的空腔,結合能為-7. 51 kcal/mol;分子動力學模擬觀察了10 ns內(nèi)蛋白的整體構象變化,發(fā)現(xiàn)Thr364也是BPA與CYP2C9發(fā)生相互作用時的結合位點。光譜學研究發(fā)現(xiàn)CYP2C9與雙酚A結合發(fā)生熒光增強現(xiàn)象,并且它們間的相互作用力主要為疏水作用力;二級結構中β-轉角、無規(guī)則卷曲與β-折疊等也發(fā)生明顯變化;隨著底物濃度增加紫外吸收峰有明顯上升且伴隨紅移。模擬計算與光譜檢測均表明CYP2C9與BPA間存在較強的相互作用。

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【部分圖文】：

圖1BPA與CYP2C9的分子對接結果圖

使用分子動力學模擬技術可以研究BPA與CYP2C9發(fā)生相互作用時的動力學情況，并進一步驗證對接結果的準確性，對小分子BPA與CYP2C9蛋白進行10ns的分子動力學模擬。通過對BPA與CYP2C9相互作用過程的均方根偏差(RMSD)、均方根波動(RMSF)與回旋半徑(Rg)進行....

圖2游離態(tài)CYP2C9與復合物BPA-CYP2C9的RMSF(A),RMSD(B),Rg(C)

圖1BPA與CYP2C9的分子對接結果圖2.3雙酚A與CYP2C9作用的熒光光譜與結合常數(shù)

圖3310K下BPA與CYP2C9相互作用的熒光光譜圖

其中△F=F-F0，△F∞=F∞-F0式中，F(xiàn)0為CYP2C9的初始熒光強度;F為BPA與CYP2C9溶液發(fā)生相互作用后的熒光強度;△F∞為BPA與CYP2C9溶液相互作用飽和時的值;K為BPA與CYP2C9的結合常數(shù);Q為BPA的濃度。以1/△F對1/Q繪圖。經(jīng)計算分析得結合常....

圖4BPA與CYP2C9相互作用的紫外吸收光譜圖

紫外吸收光譜可用于檢測配體小分子是否與蛋白質(zhì)形成復合物，其變化值可以反應蛋白質(zhì)二級結構的變化[13]。如圖4所示，可以判斷BPA與CYP2C9的復合物存在2個吸收峰，第1個位于210nm附近，第2個峰位于250～260nm之間，隨著BPA濃度的上升，吸收峰值不斷上升且存在紅移....

本文編號：3919806