發(fā)布時間：2023-01-12 16:36

　　提出了一種基于局部全局一致性（LLGC）學(xué)習(xí)的藥物-靶標相互作用預(yù)測模型。該模型基于鄰近結(jié)點及流形結(jié)構(gòu)或聚類中的結(jié)點更有可能有相同標簽這一結(jié)論,綜合考慮靶標和藥物數(shù)據(jù)的全局和局部特征,融合靶標的序列相似性和藥物-靶標網(wǎng)絡(luò)的拓撲結(jié)構(gòu)信息,提出藥物-靶標相互作用預(yù)測方法,挖掘來自標準數(shù)據(jù)集中的藥物-靶標相互作用數(shù)據(jù)。為了分析局部全局一致性方法的性能,在酶、離子通道、GPCR與核受體4個數(shù)據(jù)集中對此方法與SBGI、KBMF2K、NetCBP和WNN-GIP進行了比較,實驗結(jié)果表明,除了在核受體數(shù)據(jù)中LLGC的AUC值比NetCBP和WNN-GIP中的略低外,在其他3個數(shù)據(jù)中,LLGC的性能都優(yōu)于其他方法。確定模型性能后,將其用于藥物-靶標相互作用數(shù)據(jù)預(yù)測,給出了得分最高的5個藥物-靶標相互作用數(shù)據(jù),且得知標準數(shù)據(jù)集中已知的藥物-靶標相互作用數(shù)據(jù)絕大部分出現(xiàn)在預(yù)測集的前20%中,91%以上出現(xiàn)在預(yù)測集的前50%中。這個結(jié)果表明,LLGC能有效預(yù)測藥物與靶標之間的潛在關(guān)聯(lián)。 

【文章頁數(shù)】：7 頁

【文章目錄】：
1 研究背景
2 數(shù)據(jù)和模型
    2.1 數(shù)據(jù)
    2.2 模型
3 實驗結(jié)果和討論
    3.1 與其他方法分析比較
    3.2 預(yù)測藥物-靶標相互作用
4 結(jié)語



本文編號：3730146