PI3Kγ抑制劑的抗腫瘤活性評價(jià)及其機(jī)制分析
發(fā)布時(shí)間:2022-10-04 18:19
PI3Ks(Phosphoinositide 3-kinases)的過度激活與多種腫瘤的發(fā)生、發(fā)展和預(yù)后密切相關(guān),因此PI3K逐漸發(fā)展成為抗癌領(lǐng)域的一個(gè)重要靶點(diǎn)。PI3Ks主要分為PI3Kα、PI3Kβ、PI3Kδ和PI3Kγ四個(gè)亞型,其中PI3Kδ和PI3Kγ主要表達(dá)于造血系統(tǒng)中,并在B細(xì)胞活化、增殖、存活和淋巴組織歸巢中起著重要作用,這揭示了開發(fā)PI3Kγ抑制劑用于選擇性治療惡性血液腫瘤的巨大的潛力以及可能性。但在活性結(jié)合區(qū)域內(nèi),PI3Kγ與PI3K其他三個(gè)亞型具有高同源度,使得開發(fā)PI3Kγ抑制劑存在巨大的挑戰(zhàn),造成目前選擇性PI3Kγ抑制劑報(bào)道的匱乏。課題組前期以PI3Kγ為靶點(diǎn)構(gòu)建多構(gòu)象虛擬篩選體系篩選出83個(gè)潛在的PI3Kγ小分子抑制劑。本課題通過一系列生物活性評價(jià)結(jié)合計(jì)算機(jī)模擬機(jī)制研究,探討了83個(gè)小分子的抗腫瘤活性及候選化合物的γ選擇性作用機(jī)理。主要結(jié)果如下:1)采用MTT方法檢測83個(gè)化合物對13種惡性腫瘤細(xì)胞(胃癌、胰腺癌、乳腺癌、多發(fā)性骨髓瘤、白血。┑目乖鲋郴钚,結(jié)果表明化合物1(JN-PK1)、化合物43、化合物65和化合物79具有潛在的抗腫瘤活性,其中JN-...
【文章頁數(shù)】:57 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第一章 緒論
1.1 PI3K/Akt信號通路
1.1.1 PI3K的結(jié)構(gòu)和功能
1.1.2 PI3K/Akt信號通路的調(diào)控
1.2 PI3K/Akt信號通路與惡性血液腫瘤的關(guān)系
1.2.1 惡性血液腫瘤中PI3K/Akt信號通路的異常表達(dá)
1.2.2 用于治療惡性血液腫瘤的PI3K抑制劑
1.2.3 PI3Kγ抑制劑的研究進(jìn)展
1.3 計(jì)算機(jī)輔助藥物機(jī)理研究
1.4 立題背景及研究內(nèi)容
第二章 PI3Kγ抑制劑的生物學(xué)活性驗(yàn)證及其機(jī)理研究
2.1 引言
2.2 實(shí)驗(yàn)材料
2.2.1 細(xì)胞株
2.2.2 計(jì)算模擬軟件
2.2.3 化合物
2.2.4 實(shí)驗(yàn)試劑
2.2.5 實(shí)驗(yàn)耗材與儀器
2.2.6 培養(yǎng)基和相關(guān)實(shí)驗(yàn)溶液的配制
2.2.7 藥物的配置
2.3 生物學(xué)活性實(shí)驗(yàn)方法
2.3.1 細(xì)胞的培養(yǎng)
2.3.2 化合物在細(xì)胞水平上的初篩驗(yàn)證
2.3.3 JN-PK1 抑制多種惡性血液腫瘤細(xì)胞的增殖實(shí)驗(yàn)
2.3.4 體外檢測JN-PK1的PI3K激酶活性
2.3.5 JN-PK1對PI3K/Akt信號通路的抑制
2.3.6 JN-PK1 對惡性血液腫瘤細(xì)胞的促凋亡實(shí)驗(yàn)
2.3.7 細(xì)胞流式檢測JN-PK1 促惡性血液腫瘤細(xì)胞凋亡作用
2.4 JN-PK1 作為PI3Kγ抑制劑的機(jī)理研究
2.4.1 PI3Ks亞型蛋白的選取及其準(zhǔn)備
2.4.2 JN-PK1 的構(gòu)建和優(yōu)化
2.4.3 JN-PK1 對接到四個(gè)亞型的活性口袋
2.4.4 分子動(dòng)力學(xué)模擬(MD simulation)
2.4.5 MM/GBSA結(jié)合自由能計(jì)算
2.5 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
2.5.1 JN-PK1 有效抑制多種惡性腫瘤細(xì)胞的增殖
2.5.2 JN-PK1 選擇性抑制PI3Kγ
2.5.3 JN-PK1 有效抑制PI3K/Akt信號通路
2.5.4 JN-PK1 誘導(dǎo)惡性血液腫瘤細(xì)胞發(fā)生凋亡
2.5.5 JN-PK1 對接到PI3Ks四種亞型的結(jié)果
2.5.6 JN-PK1和PI3Ks四種亞型的分子動(dòng)力學(xué)模擬及自由能分解
2.6 結(jié)論
第三章 PI3Kδ抑制劑Idelalisib衍生物的機(jī)理研究
3.1 引言
3.2 實(shí)驗(yàn)條件及方法
3.2.1 計(jì)算機(jī)軟件
3.2.2 比較分子力場分析法建立3D-QSAR模型
3.2.3 41個(gè)抑制劑與PI3Kδ進(jìn)行分子對接
3.2.4 分子動(dòng)力學(xué)(MD)模擬
3.2.5 MM/GBSA結(jié)合自由能計(jì)算
3.3 結(jié)果與討論
3.3.1 COMFA模型分析
3.3.2 分子對接分析
3.3.3 分子動(dòng)力學(xué)模擬及結(jié)合自由能計(jì)算
3.4 結(jié)論
主要結(jié)論與展望
主要結(jié)論
展望
致謝
參考文獻(xiàn)
附錄 作者在攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表的論文及申請的專利
本文編號:3685531
【文章頁數(shù)】:57 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第一章 緒論
1.1 PI3K/Akt信號通路
1.1.1 PI3K的結(jié)構(gòu)和功能
1.1.2 PI3K/Akt信號通路的調(diào)控
1.2 PI3K/Akt信號通路與惡性血液腫瘤的關(guān)系
1.2.1 惡性血液腫瘤中PI3K/Akt信號通路的異常表達(dá)
1.2.2 用于治療惡性血液腫瘤的PI3K抑制劑
1.2.3 PI3Kγ抑制劑的研究進(jìn)展
1.3 計(jì)算機(jī)輔助藥物機(jī)理研究
1.4 立題背景及研究內(nèi)容
第二章 PI3Kγ抑制劑的生物學(xué)活性驗(yàn)證及其機(jī)理研究
2.1 引言
2.2 實(shí)驗(yàn)材料
2.2.1 細(xì)胞株
2.2.2 計(jì)算模擬軟件
2.2.3 化合物
2.2.4 實(shí)驗(yàn)試劑
2.2.5 實(shí)驗(yàn)耗材與儀器
2.2.6 培養(yǎng)基和相關(guān)實(shí)驗(yàn)溶液的配制
2.2.7 藥物的配置
2.3 生物學(xué)活性實(shí)驗(yàn)方法
2.3.1 細(xì)胞的培養(yǎng)
2.3.2 化合物在細(xì)胞水平上的初篩驗(yàn)證
2.3.3 JN-PK1 抑制多種惡性血液腫瘤細(xì)胞的增殖實(shí)驗(yàn)
2.3.4 體外檢測JN-PK1的PI3K激酶活性
2.3.5 JN-PK1對PI3K/Akt信號通路的抑制
2.3.6 JN-PK1 對惡性血液腫瘤細(xì)胞的促凋亡實(shí)驗(yàn)
2.3.7 細(xì)胞流式檢測JN-PK1 促惡性血液腫瘤細(xì)胞凋亡作用
2.4 JN-PK1 作為PI3Kγ抑制劑的機(jī)理研究
2.4.1 PI3Ks亞型蛋白的選取及其準(zhǔn)備
2.4.2 JN-PK1 的構(gòu)建和優(yōu)化
2.4.3 JN-PK1 對接到四個(gè)亞型的活性口袋
2.4.4 分子動(dòng)力學(xué)模擬(MD simulation)
2.4.5 MM/GBSA結(jié)合自由能計(jì)算
2.5 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
2.5.1 JN-PK1 有效抑制多種惡性腫瘤細(xì)胞的增殖
2.5.2 JN-PK1 選擇性抑制PI3Kγ
2.5.3 JN-PK1 有效抑制PI3K/Akt信號通路
2.5.4 JN-PK1 誘導(dǎo)惡性血液腫瘤細(xì)胞發(fā)生凋亡
2.5.5 JN-PK1 對接到PI3Ks四種亞型的結(jié)果
2.5.6 JN-PK1和PI3Ks四種亞型的分子動(dòng)力學(xué)模擬及自由能分解
2.6 結(jié)論
第三章 PI3Kδ抑制劑Idelalisib衍生物的機(jī)理研究
3.1 引言
3.2 實(shí)驗(yàn)條件及方法
3.2.1 計(jì)算機(jī)軟件
3.2.2 比較分子力場分析法建立3D-QSAR模型
3.2.3 41個(gè)抑制劑與PI3Kδ進(jìn)行分子對接
3.2.4 分子動(dòng)力學(xué)(MD)模擬
3.2.5 MM/GBSA結(jié)合自由能計(jì)算
3.3 結(jié)果與討論
3.3.1 COMFA模型分析
3.3.2 分子對接分析
3.3.3 分子動(dòng)力學(xué)模擬及結(jié)合自由能計(jì)算
3.4 結(jié)論
主要結(jié)論與展望
主要結(jié)論
展望
致謝
參考文獻(xiàn)
附錄 作者在攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表的論文及申請的專利
本文編號:3685531
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