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血管緊張素轉(zhuǎn)化酶抑制劑與牛血清白蛋白的相互作用的研究

發(fā)布時間:2017-05-01 04:00

  本文關(guān)鍵詞:血管緊張素轉(zhuǎn)化酶抑制劑與牛血清白蛋白的相互作用的研究,,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。


【摘要】:運(yùn)用光譜法分別研究了四種血管緊張素轉(zhuǎn)化酶抑制劑(ACEI)與牛血清白蛋白(Bovine Serum Albumin,BSA)的相互作用機(jī)制,并用計算機(jī)模擬技術(shù)對相互作用機(jī)制進(jìn)行微觀的預(yù)測和解釋。前者能了解并表征ACEIs與BSA的作用的關(guān)鍵參數(shù),后者在分子水平上探討四種ACEIs與BSA的結(jié)合作用力及其立體空間構(gòu)象等,預(yù)測相互作用的本質(zhì)。首先,利用熒光光譜法(Fluorescence Spectroscopy)成功研究了ACEIs與BSA的猝滅機(jī)制(Quenching Mechanism)、結(jié)合常數(shù)(Binding Constant),結(jié)合位點數(shù)(Number Of Binding Site,n),結(jié)合位點(Binding Site),熱力學(xué)常數(shù)(Thermodynamic Constant),作用力類型(Binding Force)等參數(shù)。最后根據(jù)大量實驗數(shù)據(jù)分別計算了四種ACEIs與BSA結(jié)合過程的驅(qū)動力,研究結(jié)果顯示:ACEIs與BSA的結(jié)合過程均為低溫自發(fā)并放熱的焓驅(qū)動過程。隨后,采用同步熒光光譜法(Synchronous Fluorescence Spectroscopy)、圓二色譜法(Circular Dichroism,CD)以及紅外光譜法(Infrared Spectroscopy,IR)共同研究四種ACEIs與BSA結(jié)合對BSA的二級結(jié)構(gòu)的影響,從不同的角度相互佐證。結(jié)果顯示ACEIs與BSA結(jié)合后,BSA的二級結(jié)構(gòu)均發(fā)生了微小改變。最后,運(yùn)用Gaussian 03W(Gaussian Inc.,Wallingford,USA)對ACEIs分子結(jié)構(gòu)進(jìn)行優(yōu)化,生成能量最小的立體構(gòu)型并用頻率驗證優(yōu)化結(jié)果的正確性。運(yùn)用NAMD在水和離子環(huán)境中優(yōu)化BSA晶體結(jié)構(gòu),生成在水環(huán)境中能量更低的結(jié)構(gòu),更貼近實驗的水環(huán)境。最后利用對接軟件AutoDock 4.2(The Scripps Research Institute,USA)將優(yōu)化好的ACEIs分子和BSA分子分別進(jìn)行模擬計算。得以從分子角度預(yù)測ACEIs與BSA的相互作用的力與形態(tài)。研究結(jié)果顯示:ACEIs均結(jié)合在BSA的Site I位點,主要作用力是氫鍵和范德華力,與實驗數(shù)據(jù)一致。
【關(guān)鍵詞】:血管緊張素轉(zhuǎn)化酶抑制劑 BSA 構(gòu)象變化 分子模擬
【學(xué)位授予單位】:浙江工業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號】:R969.2
【目錄】:
  • 摘要4-6
  • ABSTRACT6-10
  • 第一章 緒論10-21
  • 1.1 高血壓及其治療藥物10-13
  • 1.1.1 賴諾普利11
  • 1.1.2 依那普利11-12
  • 1.1.3 喹那普利12-13
  • 1.1.4 雷米普利13
  • 1.2 血清蛋白的簡介13-17
  • 1.2.1 人血清白蛋白結(jié)構(gòu)14-15
  • 1.2.2 牛血清白蛋白結(jié)構(gòu)15
  • 1.2.3 人血清白蛋白與牛血清白蛋白比較15-17
  • 1.3 計算機(jī)模擬技術(shù)在藥物與蛋白質(zhì)相互作用研究中的應(yīng)用17-19
  • 1.4 研究意義19
  • 1.5 本論文的設(shè)計思想19-21
  • 第二章 血管緊張素轉(zhuǎn)化酶抑制劑與牛血清白蛋白研究21-42
  • 2.1 前言21
  • 2.2 實驗部分21-23
  • 2.2.1 試劑和儀器21-22
  • 2.2.2 牛血清白蛋白溶液和藥物溶液的配制22
  • 2.2.3 熒光光譜22
  • 2.2.4 紫外-可見光譜22
  • 2.2.5 同步熒光光譜22-23
  • 2.2.6 圓二色光譜23
  • 2.2.7 紅外光譜23
  • 2.3 結(jié)果與討論23-41
  • 2.3.1 藥物對牛血清白蛋白的熒光猝滅分析23-24
  • 2.3.2 藥物猝滅牛血清白蛋白熒光的猝滅機(jī)理24-27
  • 2.3.3 結(jié)合常數(shù)以及結(jié)合位點數(shù)27-30
  • 2.3.4 結(jié)合位點確定30-33
  • 2.3.5 藥物與牛血清白蛋白結(jié)合的熱力學(xué)參數(shù)和作用力類型33-34
  • 2.3.6 牛血清白蛋白構(gòu)象變化研究34-41
  • 2.4 本章小結(jié)41-42
  • 第三章 計算機(jī)分子模擬42-58
  • 3.1 分子模擬軟件簡介42-43
  • 3.1.1 Gaussian簡介42
  • 3.1.2 NAMD簡介42
  • 3.1.3 Autodock簡介42-43
  • 3.2 實驗部分43-44
  • 3.2.1 藥物分子構(gòu)象優(yōu)化43
  • 3.2.2 牛血清白蛋白結(jié)構(gòu)優(yōu)化43
  • 3.2.3 藥物與牛血白清蛋白對接43-44
  • 3.3 結(jié)果與討論44-57
  • 3.3.1 藥物結(jié)構(gòu)優(yōu)化結(jié)果44-49
  • 3.3.2 牛血清白蛋白分子優(yōu)化結(jié)果49
  • 3.3.3 藥物與牛血清白蛋白分子對接結(jié)果49-57
  • 3.4 本章小結(jié)57-58
  • 第四章 結(jié)論與展望58-60
  • 4.1 結(jié)論58-59
  • 4.2 展望59-60
  • 第五章 參考文獻(xiàn)60-66
  • 致謝66-67
  • 攻讀學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文目錄67

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本文編號:338142

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