隨著遺傳性耳聾致病基因和作用機制的深入研究,越來越多的科研工作者把工作重點轉移到基因型表型相關性研究領域。本論文首先進行了文獻研究,篩選出了南方地區(qū)非綜合征性耳聾患者GJB2基因、SLC26A4基因和和mtDNA 12S rRNA基因上存在的20個SNP突變熱點;建立了基于這些SNP位點的多重PCR、單堿基延伸和基因芯片檢測技術聯(lián)合對遺傳性耳聾致病基因分型方法;設計了點制41條探針,共6個Arrays,每個Array分布了144個信號點耳聾分型芯片,每張芯片可檢測6個樣本。結果表明:該基因分型芯片的檢測靈敏度為75pg;用一代測序確診的23例患者樣本進行測試,結果檢測特異性為100%,假陽性0%;數(shù)據(jù)的批間差10%以下。擴大樣本數(shù)至南方地區(qū)235例非綜合征性耳聾患者樣本,研究發(fā)現(xiàn)67例攜帶GJB2突變基因,其中c.235delC突變34例（14.17%）,c.109G>A突變10例（10.21%）;發(fā)現(xiàn)31例攜帶SLC26A4突變基因,其中c.919-2A>G20例（8.51%）,c.2168A>G 9例（3.83%）;發(fā)現(xiàn)線粒體DNA 12S rRNA基因存在m.1... 

【文章來源】：上海交通大學上海市 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：86 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

研究路線圖

上海交通大學工程碩士學位論文表 2-1 不同飽和鹽溶液的相對濕度Table2-1Relative humidity of different saturated salt solutionsSatutated saltsolutionsRelative humidity at different temperatures (℃)15 20 25 30 40CaCl2 6H2O 0.35 0.32 0.29 0.26K2CO3 2H2O 0.44 0.45Ca(NO3)2 4H2O 0.60 0.55 0.50 0.45NaBr 2H2O 0.61 0.59 0.57 0.55NaCl 0.75 0.75 0.75 0.75 0.75KCl 0.86 0.85 0.85

c)圖 2-2 遺傳性耳聾基因 SNP 分型基因芯片探針分布a: 一張耳聾基因芯片上有 6 個相同的 Array，每個 Array 用圍欄分離成單獨的區(qū)域，每個區(qū)域能檢測一個樣本；b：芯片雜交后，通過結合的 cy3 標記特異熒光探針讀取熒光信號，每個 Array 上的探針組合均相同；c：探針在芯片上的位置信息，P 為陽性對照，N 為陰性對照，B 為空白對照。Fig. 2-2 Layout of oligonucleotide probes in the hereditary deafness gene SNP chipa:A microarray was composed of six identical arrays, each of which is separted by a rectangle intoscanning area of a sample;b: After hybridization, the fluorescence signal was read by thecombination of the cy3 marker specific fluorescent probe, and each array had same combinationof triplicate oligonucletide probes; c: Position information of probe on the chip. P means PositiveProbe, N denotes Negative Probe, B represents Blank (Spotting buffer).

【參考文獻】：
期刊論文
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博士論文
[1]遺傳性耳聾基因診斷新技術的研究和應用與非綜合征性耳聾家系的分子遺傳學研究[D]. 門美超.中南大學 2011



本文編號：3214815