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基于RNA-seq技術(shù)的散發(fā)性梅尼埃病患者外周血單核細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究

發(fā)布時(shí)間:2020-11-07 08:56
   研究背景:梅尼埃病是一種復(fù)雜性的內(nèi)耳疾病,以發(fā)作性眩暈,波動(dòng)性感音神經(jīng)性聾、耳鳴、耳悶脹感為主要臨床特征。隨著基因技術(shù)的不斷發(fā)展,梅尼埃病的基因?qū)W研究逐漸成為熱點(diǎn),但始終沒(méi)能夠完全揭示其發(fā)病機(jī)制。RNA-seq測(cè)序技術(shù)在多種疾病的分子病因?qū)W研究中取得了一系列的成果,然而,迄今為止,RNA-seq技術(shù)還未應(yīng)用于梅尼埃病的研究中。實(shí)驗(yàn)?zāi)康?本研究旨在應(yīng)用RNA-seq測(cè)序技術(shù),分析梅尼埃病患者和正常人外周血轉(zhuǎn)錄組譜差異基因的表達(dá)變化,尋找潛在的差異基因以揭示疾病病因?qū)W相關(guān)機(jī)制。實(shí)驗(yàn)方法:首先,利用RNA-seq測(cè)序技術(shù),分析人外周血單核細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組譜,根據(jù)FPKM0.1,篩選出梅尼埃病患者組和正常組的差異表達(dá)基因;然后,利用GO(Geneontology)功能分析方法分析差異表達(dá)基因的功能特性,通過(guò)構(gòu)建蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用的整體網(wǎng)絡(luò)圖,尋找不同基因表達(dá)產(chǎn)物之間的相互作用;為了驗(yàn)證梅尼埃病患者組和正常組差異基因表達(dá)水平,我們應(yīng)用實(shí)時(shí)定量熒光PCR(qRT-PCR)和酶聯(lián)免疫吸附試驗(yàn)(ELISA)方法,并分析相關(guān)差異表達(dá)基因與梅尼埃病免疫因素的相互關(guān)系。實(shí)驗(yàn)結(jié)果:對(duì)3例梅尼埃病患者和3例正常人進(jìn)行測(cè)序的結(jié)果顯示:共有366個(gè)差異表達(dá)基因(包括154個(gè)上調(diào)基因和212個(gè)下調(diào)基因)。其中,差異基因GSTM1,TMEM176A,TMEM176B,NSFP1在梅尼埃病患者中表達(dá)升高,SLC4A1和SLC4A10表達(dá)降低。GO功能分析顯示:免疫因素可能在梅尼埃病發(fā)病過(guò)程中起重要作用。qRT-PCR和ELISA結(jié)果顯示:GSTM1基因在患者組和正常組中有明顯差異表達(dá)。結(jié)論:梅尼埃病患者基因表達(dá)譜異于正常人,GSTM1基因顯著上調(diào),揭示GSTM1可能作為梅尼埃病一個(gè)潛在生物標(biāo)記物,免疫因素可能在梅尼埃病發(fā)病過(guò)程中起重要作用。
【學(xué)位單位】:山東大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位年份】:2018
【中圖分類(lèi)】:R764.33
【部分圖文】:

梅尼埃病,差異表達(dá),患者,對(duì)照組


?山東大學(xué)碩士學(xué)位論文???圖2?:對(duì)照組和梅尼埃病患者組各自前200位基因表達(dá)情況。??(A)?對(duì)照組中降續(xù)排列的前200位基因的表達(dá)情況。右邊的藍(lán)色標(biāo)注的數(shù)字??代表該基因在梅尼埃病患者組表達(dá)的位次。??(B)?梅尼埃病患者組前200位基因的表達(dá)情況。右邊的紅色標(biāo)注的數(shù)字代表??該基因在對(duì)照組表達(dá)的位次。??

基因


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功能圖,蛋白,功能,網(wǎng)絡(luò)分析


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本文編號(hào):2873721

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