伴發(fā)閉角型青光眼視網(wǎng)膜色素變性遺傳家系RHO基因突變的鑒定研究
發(fā)布時間:2020-07-29 13:44
【摘要】:目的:1.研究一個伴發(fā)閉角型青光眼(angle-closure glaucoma,ACG)的視網(wǎng)膜色素變性(retinitis pigmentosa,RP)家系的遺傳特性和臨床表型,提取各家系成員的DNA,建立臨床電子檔案和DNA標本庫。2.篩查致病基因,測序分析家系成員基因組DNA,定位致病突變。方法:1.RP家系臨床資料的采集:RP家系內(nèi)的6例成員(5例患者,1例正常人)簽署知情同意書,按照RP的診斷標準,詢問家系成員病史,繪制家系圖譜,門診檢查視力、眼壓、視野、OCT、裂隙燈、房角鏡、間接檢眼鏡、眼底照相、ERG等。2.抽取家系成員的外周靜脈血并提取基因組DNA,結(jié)合目標區(qū)域捕獲高通量測序先證者DNA,比對基因組數(shù)據(jù)庫DNA序列,篩選可疑致病基因位點。3.采用Sanger測序驗證先證者和家系內(nèi)其他成員疑似突變位點。結(jié)果:1.依據(jù)遺傳特征明確該RP家系是一個常染色體顯性遺傳RP家系,所有受試者基因組DNA純度均鑒定達標。2.此RP家系的5例患者均有夜盲和視野缺損,存在不同程度視力下降,視網(wǎng)膜呈青灰色骨細胞樣改變,2例患者伴發(fā)閉角型青光眼,2例患者存在房角狹窄。3.RP家系先證者的可疑致病原因初步定位于RHO基因c.541GAp.Glu181Lys突變,經(jīng)Sanger測序驗證證實突變存在,家系內(nèi)、外成員檢測確定基因型表型共分離。結(jié)論:1.本研究家系是一個伴發(fā)閉角型青光眼的常染色體顯性遺傳RP家系,臨床表型符合RP特征。2.初步認為本研究的患者發(fā)病與RHO基因c.541GAp.Glu181Lys突變有關(guān)。3.視網(wǎng)膜色素變性伴發(fā)青光眼患者較易漏診,通過分析臨床資料及目標區(qū)域捕獲高通量測序技術(shù)可明確診斷及致病基因突變。
【學(xué)位授予單位】:中國人民解放軍醫(yī)學(xué)院
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號】:R775;R774.13
【圖文】:
RP家系內(nèi)的先證者HI:邋9的姐姐IE:邋6和子女IV:邋9、IV:邋10經(jīng)檢查均為患者,逡逑該家系RP性狀連續(xù)4代傳遞,男女均有發(fā)病,比例為1邋:邋2,符合常染色體完全顯性逡逑遺傳特征。本研究中RP家系圖譜如圖1。逡逑14逡逑
Fig.邋2邋Clinical邋characteristics邋of邋RP邋patients邋a:patient邋III邋6,邋OD,showing邋an邋iris邋hole邋at邋11邋o'clock逡逑direction;b:patient邋III邋9,邋OD.showing邋shallow邋anterior邋chamber;c:patient邋III邋9,邋OD,showing邋chamber逡逑angle邋closure;d:patient邋III邋6,邋OD,showing邋attenuation邋of邋vessels,bone邋spicule邋deposits邋in邋the邋retina;逡逑e:patient邋III邋9,邋OS,邋showing邋bone邋spicule邋deposits邋in邋the邋retina,aneurysmal邋change邋of邋inferior逡逑vessels;f:patient邋III邋9,邋OD.showing邋superior邋visual邋field邋defect;g:patient邋III邋6?邋OD,showing邋a邋tubular逡逑visual邋field;h:patient邋III邋9,邋OD/OS,showing邋retinal邋nerve邋fiber邋layer邋thickness邋decreased:patient邋III邋9,逡逑OD,showing邋retinal邋thickness邋increase邋in邋the邋fovea;j:patient邋III邋6,邋OD,showing邋a邋thin邋retina邋beside逡逑macula邋lutea逡逑】7逡逑
(4)序列分析逡逑參考美國醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)和基因組學(xué)學(xué)院(American邋College邋of邋Medical邋Genetics逡逑and邋Genomics,ACMG)相關(guān)指南解讀數(shù)據(jù),評估下機的原始數(shù)據(jù)(Raw邋reads)的測逡逑序質(zhì)量,首先去除被接頭污染以及低質(zhì)量reads,隨后用Burrows邋Wheeler邋Aligner逡逑軟件[4]比對HGl9序列,評價序列捕獲效果,用SOAPsnp軟件f5]和Samtools軟逡逑件[6]分別進行邋SNV(single邋nucletide邋variant)和邋Indel(insertion邋and邋deletion)查詢,生逡逑成目標區(qū)域堿基多態(tài)性結(jié)果,比對數(shù)據(jù)庫NCBI邋dbSNP、HapMap、1000邋human逡逑genome邋dataset邋和邋database邋of邋100邋Chinese邋healthy邋adults,找出可疑突變,進行注釋、逡逑26逡逑
本文編號:2774041
【學(xué)位授予單位】:中國人民解放軍醫(yī)學(xué)院
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號】:R775;R774.13
【圖文】:
RP家系內(nèi)的先證者HI:邋9的姐姐IE:邋6和子女IV:邋9、IV:邋10經(jīng)檢查均為患者,逡逑該家系RP性狀連續(xù)4代傳遞,男女均有發(fā)病,比例為1邋:邋2,符合常染色體完全顯性逡逑遺傳特征。本研究中RP家系圖譜如圖1。逡逑14逡逑
Fig.邋2邋Clinical邋characteristics邋of邋RP邋patients邋a:patient邋III邋6,邋OD,showing邋an邋iris邋hole邋at邋11邋o'clock逡逑direction;b:patient邋III邋9,邋OD.showing邋shallow邋anterior邋chamber;c:patient邋III邋9,邋OD,showing邋chamber逡逑angle邋closure;d:patient邋III邋6,邋OD,showing邋attenuation邋of邋vessels,bone邋spicule邋deposits邋in邋the邋retina;逡逑e:patient邋III邋9,邋OS,邋showing邋bone邋spicule邋deposits邋in邋the邋retina,aneurysmal邋change邋of邋inferior逡逑vessels;f:patient邋III邋9,邋OD.showing邋superior邋visual邋field邋defect;g:patient邋III邋6?邋OD,showing邋a邋tubular逡逑visual邋field;h:patient邋III邋9,邋OD/OS,showing邋retinal邋nerve邋fiber邋layer邋thickness邋decreased:patient邋III邋9,逡逑OD,showing邋retinal邋thickness邋increase邋in邋the邋fovea;j:patient邋III邋6,邋OD,showing邋a邋thin邋retina邋beside逡逑macula邋lutea逡逑】7逡逑
(4)序列分析逡逑參考美國醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)和基因組學(xué)學(xué)院(American邋College邋of邋Medical邋Genetics逡逑and邋Genomics,ACMG)相關(guān)指南解讀數(shù)據(jù),評估下機的原始數(shù)據(jù)(Raw邋reads)的測逡逑序質(zhì)量,首先去除被接頭污染以及低質(zhì)量reads,隨后用Burrows邋Wheeler邋Aligner逡逑軟件[4]比對HGl9序列,評價序列捕獲效果,用SOAPsnp軟件f5]和Samtools軟逡逑件[6]分別進行邋SNV(single邋nucletide邋variant)和邋Indel(insertion邋and邋deletion)查詢,生逡逑成目標區(qū)域堿基多態(tài)性結(jié)果,比對數(shù)據(jù)庫NCBI邋dbSNP、HapMap、1000邋human逡逑genome邋dataset邋和邋database邋of邋100邋Chinese邋healthy邋adults,找出可疑突變,進行注釋、逡逑26逡逑
【參考文獻】
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3 閆光輝;盛迅倫;;中國視網(wǎng)膜色素變性相關(guān)基因研究現(xiàn)狀[J];中華眼底病雜志;2011年05期
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6 彭清華;視網(wǎng)膜色素變性并發(fā)青光眼21例臨床分析[J];中國實用眼科雜志;1995年02期
本文編號:2774041
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