【摘要】：背景:白塞氏病(Behcet's disease,BD)并發(fā)的眼病是我國最常見的葡萄膜炎類型之一。最近,一項采用免疫芯片的GWAS研究在土耳其Behcet病人群中發(fā)現(xiàn)了多個“新”的疾病易感基因,這些基因多態(tài)性與Behcet病的關(guān)聯(lián)在中國漢族人群中尚不明確。目的:在中國漢族人群進(jìn)一步探討該項GWAS研究報道的“新”的遺傳位點與Behcet病的相關(guān)性。方法:實驗采用病例對照研究方法,分兩個階段進(jìn)行。共納入1238例Behcet病患者和1458例正常對照(第一階段478例Behcet病患者和662例正常對照;第二階段760例Behcet病患者和796例正常對照)。采用MassARRAY System和TaqMan SNP基因分型技術(shù)對22個候選位點進(jìn)行基因分型。Behcet病患者和正常對照組間的等位基因及基因型頻率的比較采用卡方檢驗,對陽性結(jié)果的位點進(jìn)一步做不同人群數(shù)據(jù)的Meta分析。結(jié)果:1.在病例對照研究第一階段發(fā)現(xiàn)4個SNP(LACC1/rs9316059、CEBPB-PTPN1/rs913678、RIPK2/rs10094579、ADO-EGR2/rs224127)的等位基因頻率在Behcet病患者中與正常組之間的差異具有統(tǒng)計學(xué)意義。其中CEBPB-PTPN1/rs913678 C等位基因(Pc=1.01×10~(-2),OR=1.382)、RIPK2/rs10094579 A等位基因(Pc=3.16×10~(-2),OR=1.368)和ADO-EGR2/rs224127 A等位基因(Pc=3.36×10~(-2),OR=1.318)的頻率明顯高于正常人;另外,LACC1/rs9316059的T等位基因頻率明顯低于正常人(Pc=1.53×10~(-5),OR=0.613)。2.第二階段驗證結(jié)果進(jìn)一步證明,LACC1/rs9316059 T等位基因頻率在Behcet病患者中顯著降低(Pc=1.34×10~(-3),OR=0.745),而CEBPB-PTPN1/rs913678 C等位基因、RIPK2/rs10094579 A等位基因和ADO-EGR2/rs224127 A等位基因頻率在Behcet病患者中顯著增高(分別為,Pc=4.43×10~(-2),OR=1.222;Pc=2.74×10~(-2),OR=1.252;Pc=1.88×10~(-2),OR=1.232)。3.綜合兩個階段數(shù)據(jù)統(tǒng)計分析表明:LACC1/rs9316059、CEBPB-PTPN1/rs913678、RIPK2/rs10094579、ADO-EGR2/rs224127的等位基因頻率在1238例Behcet病患者與1458例正常組之間存在統(tǒng)計學(xué)顯著差異(分別為:rs9316059 T等位基因,Pc=4.95×10~(-8),OR=0.687;rs913678 C等位基,Pc=3.01×10~(-4),OR=1.297;rs10094579 A等位基因,Pc=6.93×10~(-4),OR=1.302;rs224127 A等位基因,Pc=3.77×10~(-4),OR=1.274)。4.對4個陽性結(jié)果的SNP與Behcet病患者的主要臨床表現(xiàn)進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析,結(jié)果沒有任何相關(guān)性證據(jù)發(fā)現(xiàn)。5.將本實驗研究數(shù)據(jù)與土耳其、伊朗和日本人的Behcet病基因相關(guān)性研究數(shù)據(jù)進(jìn)行Meta分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn)4個陽性SNP(rs9316059、rs913678、rs10094579、rs224127)的等位基因頻率差異P值都小于5×10~(-8)(分別為2.96×10~(-16)、2.09×10~(-16)、9.21×10~(-11)、5.28×10~(-13))。結(jié)論:LACC1、CEBPB-PTPN1、RIPK2及ADO-EGR2基因單核苷酸多態(tài)性與中國漢族人Behcet病的遺傳易感性顯著相關(guān)。
【圖文】：

圖 1 Sequenom MassARRAY SNP 質(zhì)譜分型和質(zhì)控Fig 1 Genotyping result and Quality control of Sequnom Mass ARRAYSNP2.3 第一階段 22 個 SNP 與 Behcet 病相關(guān)性分析結(jié)果在第一階段研究中，在 478 名 Behcet 病患者和 662 名正常對照中對 22 個 SNP進(jìn)行了基因分型，并對各 SNP 位點比較 Behcet 病患者和正常對照組之間的基因型和 等 位 基 因 頻 率 。 結(jié) 果 顯 示 ： CEBPB-PTPN1/rs913678 的 C 等 位 基 因 、RIPK2/rs10094579 的 A 等位基因和 ADO-EGR2/rs224127 的 A 等位基因在 Behcet病患者組明顯高于正常對照組（分別為 Pc=1.01×10-2，，OR=1.382；Pc=3.16×10-2，OR=1.368；Pc=3.36×10-2，OR=1.318）；此外，Behcet 病患者組 LACC1/rs9316059的 T 等位基因頻率明顯低于正常對照組（Pc=1.53×10-5; OR=0.613）（見表 7）；然

37圖 2 四個與 BD 相關(guān)的 SNP 在中國漢族和其他種群對比的森林圖Figure 2. Forest plots for 4 SNPs associated with BD in the Chinese Han population comparedwith other populations.OR, odds ratio; 95 % CI, 95 % confidence interval; TUR, Turkish; JPN, Japanese; CHIN, HanChinese; For the 4 SNPs, the meta-analysis refer to the C, T,A, and Aalleles, respectively. Thebroken vertical line shows the no effect point (odds ratio 1).
【學(xué)位授予單位】：重慶醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】：博士
【學(xué)位授予年份】：2018
【分類號】：R773.9

【參考文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前1條

1 Wasseem Skef;Matthew J Hamilton;Thurayya Arayssi;;Gastrointestinal Beh?et's disease:A review[J];World Journal of Gastroenterology;2015年13期

本文編號：2689224