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TNIP1基因多態(tài)同漢族人群vogt-小柳原田綜合癥及Behcet病的遺傳易感性研究

發(fā)布時間:2021-03-09 13:13
  研究背景: Vogt-小柳原田綜合征(Vogt Koyanagi Haradasyndrome,VKH綜合征)和Behcet病以雙眼全葡萄膜炎為特征的眼部疾病,是中國人群中最重要的兩種葡萄膜炎。人類白細胞抗原(Humanleukocyte antigen,HLA)基因已經被證明同Behcet病和VKH綜合征的發(fā)病具有緊密的聯(lián)系。近期的研究表明,一些非HLA是自身免疫性疾病相關易感基因,同時也是VKH綜合征和Behcet病的易感基因。我研究組也通過對自身免疫性疾病的相關易感基因在VKH綜合征及Behcet病患者進行檢測,而發(fā)現多個同VKH綜合征、Behcet病相關的易感基因。腫瘤壞死子α蛋白3相關蛋白(TNFα-induced protein3interacting with protein1,TNIP1)基因是一些自身免疫性疾病,如系統(tǒng)性紅斑狼瘡等的易感基因,本研究旨在對TNIP1的基因多態(tài)性同中國漢族VKH綜合征和Behcet病的相關性進行研究。 目的:本研究的目的為對TNIP1的基因多態(tài)性同中國漢族vogt-小柳原田綜合征和Behcet病的遺傳易感性進行研究。 方法:本研究根據文獻報道共選TNIP1的7個基因多態(tài)性位點進行研究,分別為rs17728338, rs7708392, rs10036748, rs3762999, rs999556,rs4958881和rs3792783。初步納入656名Behcet病、961名VKH綜合征患者及1534名健康人納入本研究。研究分為兩個階段進行,第一階段,隨機從患者和健康人中選擇377個Behcet病及374個VKH綜合征患者及480個健康對照來初步查找可能的同vogt-小柳原田綜合征和Behcet病相關的TNIP1的基因多態(tài)性位點。研究第二階段,在剩余的279個Behcet病患者和587個VKH綜合征患者及1054個健康對照對第一階段發(fā)現的可能的基因多態(tài)性位點改變進行驗證性檢測研究。對研究樣本進行基因型的分析采用限制性內切酶的聚合酶鏈反應和直接測序的方法,對基因型結果分析采用卡方檢驗及Fisher確切概率分析,并使用Bonferroni法進行矯正。所得p值使用Bonferroni法進行矯正,P值0.05認為有統(tǒng)計學差異,同時計算優(yōu)勢率(Odds ratios,ORs)和95%可信區(qū)間(confidence intervals,CI)。 結果:第一階段,對TNIP1的7個基因多態(tài)性位點的基因型在Behcet病和vogt-小柳原田綜合征患者分別進行分析,所有7個位點的多態(tài)性在患者及健康組基因型頻率附哈迪-溫伯格平衡(P0.05)。7個基因的多態(tài)性位點的基因型頻率在Behcet病患者及正常對照之間無統(tǒng)計學差異。而rs17728338位點的基因型AG型在vogt-小柳原田綜合征患者同健康對照之間的基因型AG型相比基因型頻率減少,而且存在統(tǒng)計學差異,(Pc=0.038OR=1.934,95%CI=1.438~2.601)。第二階段,我們僅對研究對象中剩余的587個VKH綜合征患者和1054個健康對照之間rs17728338的多態(tài)性進行驗證性研究,,而未發(fā)現同Behcet病相關的基因多態(tài)性位點,故終止檢測。rs17728338位點AG基因型頻率在VKH綜合征患者中顯著降低(Pc=0.038)。將第一階段和第二階段結果聯(lián)合統(tǒng)計,發(fā)現rs17728338的AG基因型頻率在VKH綜合征和健康對照之間仍具有統(tǒng)計學差異(Pc=1.83×10-4, OR=1.934,95%CI=1.438~2.601).。 結論:TNIP1的基因多態(tài)性改變同中國漢族人群VHK綜合征的易感性相關,GG基因型和G等位基因可能為VKH綜合征的危險因素,而AG基因型和A等位基因為VKH綜合征的保護因素。
【學位授予單位】:重慶醫(yī)科大學
【學位級別】:博士
【學位授予年份】:2014
【分類號】:R773
文章目錄
英漢縮略語名詞對照
摘要
ABSTRACT
前言
    1 Vogt-小柳原田綜合征和 Beh et 病的疾病概述
    2 VKH 綜合征 Beh et 病發(fā)病機制的研究
    3 TNIP1 基因單核苷酸多態(tài)性同自身免疫性疾病的關系
第一部分 TNIP1 同 VKH 綜合征的相關關系研究
    前言
    1 材料和方法
    2 結果
    3 討論
第二部分 TNIP1 同 Beh et 病的相關關系研究
    前言
    1 材料和方法
    2 結果
    3 討論
全文總結
參考文獻
文獻綜述
    參考文獻
致謝
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本文編號:2283729

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